표제지

요약

목차

Ⅰ. 서론 10

Ⅱ. 연구사 12

1. 한국 전통소에 관한 연구 12

2. 소의 개량 방법 12

1) 전통적 개량 방법 13

2) 분자유전학적 Marker를 이용한 동물 육종 연구동향 14

3) 분자유전학을 이용한 개량방법 15

3. DNA 표지인자 18

1) 초위성체 다형성 (Simple sequence length polymorphism, SSLP) 18

2) 제한효소 절편 길이 다형성(Restriction fragment length polymorphism, RFLP) 19

3) 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 21

4) 단일가닥 구조 다형성(single strand conformation polymorphism, SSCP) 22

5) 임의증폭 단편 다형성(random amplified polymorphic DNA, RAPD) 24

6) 제한증폭 단편 다형성(amplified fragment length polymorphism, AFLP) 25

7) 유전자 복제수변이 (Copy Number Variation, CNV) 25

4. 후보유전자 MC4R 25

1) MC4R(melanocortin 4 receptor) 25

Ⅲ.재료 및 방법 27

1. 조직, 혈액Sample 및 genomic DNA 확보 27

1) 공시축 선정 27

2) 경제형질 조사항목 27

2. Genomic DNA의 분리 및 정제 28

1) 공시축의 tissue sample로 부터 genomic DNA의 추출 28

2) 공시축의 blood sample에서 Genomic DNA의 추출 28

3. Microsatellite marker을 이용한 공시재료의 동일성 검정 29

1) Microsatellite marker의 PCR증폭 29

2) Microsatellite 유전자형 분석 29

4. MC4R 유전자의 PCR 및 유전자형 확인 33

1) MC4R 유전자의 primer 설계 및 합성 33

2) MC4R 유전자의 PCR 증폭 33

3) PCR-RFLP 분석방법을 통한 MC4R 유전자의 유전자형 확인(genotyping) 33

5. 통계분석 34

Ⅳ. 결과 35

1. 한국전통소 MC4R 유전자 SNP C1069G의 유전자형 분석 35

2. 한국전통소의 MC4R 유전자 C1069G SNP과 경제형질과의 유의성 분석 38

Ⅴ. 고찰 42

Ⅵ. 참고문헌 44

요약 50

Table 1. SNPs and their econmic traits found of candidate gene in Hanwoo 17

Table 2. Bovine microsatellite marker set and expected size range (in base pairs) 32

Table 3. Primer sequences and fragment size for PCR amplification 1069C＞G SNP genotyping of MC4R gene 33

Table 4. Extreme values of phenotypic values measured on carcass traits in korean native cattle 36

Table 5. Genotype frequencies of meat grades of Korean native cattle 37

Table 6. Genotype frequencies and allele frequencies of the MC4R gene in Korean native cattle 38

Table 7. Least squares means and standard errors for economic traits of the MC4R gene in Korean nattive cattle breeds 40

Table 8. Association of C1069G SNP genotype with carcass and meat quality traits in Qinchuan cattle 41

Figure 1. Two variants of an SSLP 19

Figure 2. A restriction fragment length polymorphism (RFLP) 20

Figure 3. Agarose gel electrophoresis of RFLP 21

Figure 4. A single nucleotide polymorphism (SNP) 22

Figure 5. Single strand conformation polymorphism (SSCP) 23

Figure 6. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) 24

Figure 7. Bovine-specific 11 microsatellite marker (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA23, SPS115, TGLA122, TGLA227, TGLA53, and TGLA126, BOV_X, BOV_Y) 31

Figure 8. 1.5% Agarose gel electrophoresis of TaiI-PCR-RFLP. CC genotype shows two fragments (481bp and 260bp), CG genotype shows three fragments (741bp, 481bp and... 35