본 연구는 한국 논에서 다년간 광범위하게 사용하고 있는 제초제들에 대한 몇몇 수생식물들의 반응과 제초제로부터 논 생태계 내의 생물다양성 보존을 위한 indicator 식물로서 사용 가능성을 구명하고자 실시하였다. Butachlor 및 SU계 혼합 제초제를 각각 다년간 사용하고 있는 강원 평창 지역과 전남 나주 지역의 논, 농수로, 저수지에서 수생식물 분포를 조사한 결과 전남 나주 지역에 비해 강원 평창지역에서 훨씬 다양한 수생식물이 생존하고 있었다. 비SU계 제초제인 butachlor와 molinate 그리고 SU계 제초제인 BSM과 PSE에 대한 일본에서 제초제 위험성 수생식물들로 규정된 물옥잠, 네가래, 생이가래의 반응은 비SU계 제초제들에 비해 SU계 제초제들에 대하여 훨씬 민감하게 반응하였다. 논 생태계에서 제초제 살포 후 논으로부터 유출된 SU계 제초제가 수생식물에 미치는 영향과 실제 유출된 제초제 농도를 비교하기 위해서 농수로에서 채취한 물은 수생식물인 네가래에 심한 영향을 미쳤으며, 반은 경향은 유출된 PSE 농도와 일치하였다. 또한 SU계 제초제 작용점인 네가래에서 추출된 ALS활성을 BSM과 PSE 농도별로 분석한 결과 이들 제초제 매우 낮은 농도에서 조차 심하게 억제되었다.These studies were conducted to evaluate the possibility of using them as indicator species for biodiversity conservation from and the response of some aquatic plants to herbicides which have been used widely in rice-cropping areas in Korea. The aquatic plants seen in paddy farming system of Kangwon province where butachlor has been used mainly for many year, were much more varied than those surveyed in paddy farming system of Chonnam province where sulfonylurea herbicides (SUs) have been used continuously for many year. The effects of bensulfuron- methyl (BSM) and pyrazosulfuron-ethyl (PSE) of sulfonylurea herbicides (SUs) to Monochoria korsakowii (M. korsakowii), Marsilea quadrifolia (M. quadrifolia), and Salvinia natans (S. natans) which are aquatic species listed as threatened species by the Environment Agency of Japan, much more effective than those to butachlor and molinate. The GR50 values of BSM and PSE to aquatic plants tested were relatively very low compared with those of butachlor and molinate. The concentrations of SUs which may affect the growth aquatic plants detected in water collected from irrigation ditches of rice fields treated with SU-included herbicides. Acetolactate synthase (ALS) activity isolated from M. quadrifolia was seriously inhibited even at very low concentration of BSM and PSE.