노무현 정부에 들어서 기관에 대한 경영실적평가는 정부투자기관보다 공공성이 더욱 강조되는 정부산하기관까지 확대되었다. 그 결과 2004년부터 「정부산하기관관리기본법」에 따라 정부산하기관에 대한 고객만족도 및 경영실적에 대한 평가를 3년째 실시해 오고 있다. 비록 짧은 시행기간이긴 하지만 아직까지 정부산하기관에 대한 평가와 결과에 대한 분석이 미진한 상태이다. 그러므로 본 연구는 정부산하기관 평가 결과를 분석한 첫 연구로서, 시행 3년째인 정부산하기관 고객만족도 및 경영실적 평가 결과를 분석함으로써, 분석결과를 통해 연구의 함의를 이끌고 나아가 향후 제도적 발전을 위해 대안을 모색하였다. 분석결과 유의미한 결과는 부채와 경영실적평가결과 간의 상관관계와 주무부서별 정부산하기관의 고객만족도 조사결과 간의 차이이다. 이상의 분석결과를 볼 때, 다음과 같이 연구의 함의를 도출할 수 있다. 첫째, 부채가 경영실적평가결과에 정의 유의미한 관계를 보임에 따라, 부채를 줄이고 이를 위한 노력을 평가에 반영되도록 평가지표를 개선할 필요가 있다. 둘째, 고객만족도 조사결과와 경영실적평가결과 간의 유의미한 상관관계를 보이지 못했으므로, 고객만족도 조사에 변별력을 높여 경영실적평가에 반영할 필요가 있다. 셋째, 정부기능부문별로 정부산하기관의 고객만족도 및 경영실적평가 결과는 차이를 보이지 못했다. 이는 고객만족도 조사의 변별력이 낮기 때문으로 이해된다. 넷째, 주무부서별 정부산하기관의 고객만족도에는 차이를 보였다. 바람직한 것은 기관의 특성과 기관이 집행하는 정책의 특성을 반영하여 평가결과에 반영하여 평가의 형평성을 유지할 필요가 있다. 이렇게 시행 3년째인 정부산하기관 평가가 지속적으로 문제점을 찾고 새로운 대안으로 보완해 간다면, 정부산하기관에 대한 국민의 만족은 진정 제고될 것이며, 정부산하기관도 정부의 평가를 긍정적으로 인식할 것이다. 이것이야 말로 정부산하기관에 대한 평가의 목적인 정부가 추진하는 혁신의 중요 개념인 참여와 고객지향성을 통한 정부산하기관의 효율성을 확보하는 길이다.