在十六世紀即將結束之際, 李贄與基督教傳教士利瑪竇曾經有過幾次會面。 依據他們留下的紀錄, 兩人在南京見面三次、 在濟寧見面兩次。 身爲中西兩個世界最先鋒的人物, 他們的話題當然不外乎宗教和思想之類, 尤其在濟寧的對話據說是頗有深度的。 由此推論, 他們相遇或許可以發展爲兩種不同文明之間的對話。 但遺憾的是, 到目前爲止, 我們還無法找到會談所帶來的任何結果。 因此, 本文在分析探討兩人往來事實的基礎上, 將他們之間所存在的隔閡歸納爲兩種。 第一、 李贄是一位非常激進的、 要打破因襲的自由主義者。 他徹底批判所謂的聖賢和社會道德觀念。 當時, 在混亂的明末, 還有一批要‘救國’的儒學正統派――東林黨。 他們不僅追求科學技術的實學, 還排斥佛教等異端, 因而以張問達等爲首的東林黨核心人物逼迫儒學判逆李贄, 直致使他因走投無路而死。 利瑪竇曾經在南京結交了很多屬於泰州學派的非正統儒家, 但他一到北京就認爲東林黨才是政治主流, 並爲了傳教而聯合他門。 之後, 利氏對李贄的態度也有所變化, 他也加入到批評李贄的隊伍中去了。第二、 利瑪竇是基督教傳教士, 李贄卻與此相反, 不僅是搞理學的, 同時還是佛教的僧人。 宋明理學本來是依據無神論而構成的形而上學, 也就是在中國傳統土壤中醞釀出來的精華, 而且已經涵蓋了佛、 道兩教的一些因素。 因爲明末是統合氛圍濃厚的時代, 於是李贄等人提出的‘三教合一’論便流行起來了, 那便是既具多元化, 又具有相對主義性質的中國固有思想。 而西方基督教的世界觀呢, 恰恰與此相反, 是在一元論與絕對主義的基礎上所建立的。 利瑪竇雖然提出了‘補儒易佛’以企圖使基督教與儒家相結合, 但他卻無法接受宋明理學的無神論, 他只不過是肯定孔子的原始儒教而已, 而對當時的主流思想理學卻予以否定。 他的這種認識缺陷, 既導致了與李贄不能兩立的局面, 又給後來的傳教活動帶來了不利的影響。