소장세균과증식은 소장의 미생물이 증가하거나 비정상 유형의 미생물의 집락화로 인하여 유발된 임상 질환으로 진단법에는 흡인소장액 미생물 분석과 호흡검사가 있다. 흡인소장액 미생물 분석이 호흡검사보다 정확하지만 침습적이고 비용이 비싸고 내시경 및 진정제 투여로 인한 합병증 위험으로 널리 사용되고 있지 못하며 실제 임상에서는 호흡검사로 진단을 내린다. 호흡검사 수행에 있어서 결과에 영향을 미칠 수 있는 항생제, 위장관운동촉진제, 변비완하제, 과도한 복합 탄수화물 섭취, 격렬한 운동 및 흡연 등을 사전에 환자에게 교육을 시행해야 한다. 북미선언문에 제시한 90분 이내 기저치에서 수소가 20 ppm 이상 증가하거나 메탄이 10 ppm 이상 증가하면 호흡검사 양성이라고 판독한다. 락툴로스 호흡검사는 가속화된 구강 통과 시간에 따른 위양성 결과와 포도당 호흡검사는 포도당흡수 장애에서 나타날 수 있는 위양성과 원위부 소장세균과증식에 대한 위음성 결과가 단점이라는 것을 인지해야 할 것이다.Small intestinal bacterial overgrowth (SIBO) occurs when the small bowel is colonized by high numbers of abnormal microorganisms. There is no gold standard diagnostic test for SIBO. Both small bowel aspiration and breath testing have limitations as diagnostic tests. However, breath testing has the practical advantages of being readily available, inexpensive, and noninvasive.