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MARC
논문명/저자명
2006년~2007년 서울지역 소아 환자로부터 분리한 로타바이러스의 유전자형 및 염기서열 분석 / 정영수 인기도
발행사항
서울 : 중앙대학교 대학원, 2008.2
청구기호
TD 618.92 ㅈ272ㅇ
형태사항
ii, 78 p. ; 26 cm
자료실
전자자료
제어번호
KDMT1200825062
주기사항
학위논문(박사) -- 중앙대학교 대학원, 소아과학, 2008.2
원문

목차보기더보기

표제지

목차

머리말 6

재료 및 방법 9

1. 분변 시료 9

2. 로타바이러스 RNA 분리 9

3. Primers 10

4. VP7 (G) 혈청형 분석 13

5. VP4 (P) 유전자형 분석 14

6. 세포 배양을 이용한 로타바이러스 분리 15

7. 간접형광항체반응 (Indirect immunofluorescence assay) 16

8. Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) 17

9. 로타바이러스 분리주의 VP7 유전자 염기서열 분석 17

10. 로타바이러스 분리주의 NSP4 유전자 염기서열 분석 20

결과 22

1. 로타바이러스 G 혈청형 분포 22

2. 로타바이러스 P 유전자형 분포 25

3. 로타바이러스 G 혈청형과 P 유전자형의 상관성 28

4. 간접형광항체법에 의한 로타바이러스 검출 30

5. 로타바이러스 분리주의 RNA 전기영동상과 아군 분석 32

6. 로타바이러스 분리주의 VP7 유전자 염기서열 분석 34

7. 로타바이러스 분리주의 NSP4 유전자 염기서열 분석 37

고찰 41

결론 52

인용 문헌 56

Appendix 74

＝국문초록＝ 79

＝ABSTRACT＝ 81

초록보기 더보기

2006년 11월부터 2007년 5월까지 중앙대학교 용산병원에 급성 위장관염으로 입원한 환아들의 분변으로부터 일련의 RT-PCR과 multiplex PCR에 의하여 로타바이러스의 G 혈청형과 P 유전자형을 조사하였다. 로타바이러스 양성으로 판정된 분변 시료 79례에서 나타난 G 혈청형은 G1이 38례(48.0%)로 가장 많았으며, G2가 17례(21.5%), G3이 12례(15.1%), G4가 4례(5.1%), G8과 G9가 각 1례(1.3%) 검출되었다. 중복 감염은 5례(6.4%) 검출되었으며, 1례의 시료(1.3%)는 혈청형을 결정할 수 없었다. P 유전자형은 P[8]이 25례(31.6%)로 가장 많았으며, P[4]가 22례(27.8%), P[6]이 16례(20.3%), P[9]가 2례(2.5%) 검출되었다. 중복 감염은 5례(6.4%) 검출되었으며, 9례의 시료(11.4%)는 유전자형을 규명할 수 없었다. G 혈청형과 P 유전자형의 조합형은 G1P[4]가 14례(17.8%)로 가장 많았으며, G1P[8]이 12례(15.1%), G2P[6]이 8례(10.1%), G2P[8]이 6례(7.6%), G1P[6], G2P[4], G3P[4] 및 G3P[6]이 각 3례(3.7%), G3P[8]과 G4P[4]가 각 2례(2.5%), G1P[9], G3P[9], G4P[6], G4P[8] 및 G9P[8]이 각 1례(1.3%) 검출되었다. 중복 감염은 8례(10.1%) 검출되었으며, 어느 한 쪽이 결정되지 않았던 경우는 10례(12.7%)로 나타났다. 간접형광항체법을 시행하여 MA104 세포에서 로타바이러스의 감염 여부를 확인하였으며, 국내 로타바이러스 분리주 CAU 016-07과 CAU 037-07의 RNA 전기영동상은 "long" RNA 패턴을 보여 아군 II로 판명되었다. 외국 유래주들과의 유전적 상관성은 VP7의 경우 2006년 스페인에서 보고된 5.1주와 유전적으로 가장 밀접하였고, NSP4의 경우 유전자형 B에 속하였다. 이상의 결과를 종합해 볼 때, 본 연구 결과는 국내에 유행하는 로타바이러스에 대한 분자역학적 기초 자료를 제공함과 동시에 병원성 관련 연구와 백신 개발 전략 수립에 유용하게 사용될 것으로 사료된다.

참고문헌 (76건) : 자료제공( 네이버학술정보 )더보기

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 VP4 and VP7 Genotyping of Group A Rotavirus Isolated from Diarrhea Patients in Seoul by Multiplex PCR 소장
2 2003년~2005년 서울지역 소아 환자로부터 분리한 로타바이러스의 유전자형 및 염기서열 분석 소장
3 Close relationship between G8-serotype bovine and human rotaviruses isolated in Nigeria. 네이버 미소장
4 Evaluation of Rhesus Rotavirus Vaccine (MMU 18006) in Infants and Young Children 네이버 미소장
5 (1992) Nucleotide sequences of normal and rearranged RNA segments 10 of human rotaviruses. J Gen 미소장
6 Comparative study of the epidemiology of rotavirus in children from a community-based birth cohort and a hospital in South India. 네이버 미소장
7 Evaluation of rhesus rotavirus monovalent and tetravalent reassortant vaccines in US children. US Rotavirus Vaccine Efficacy Group. 네이버 미소장
8 Bresee J, Fang ZY, Wang B, Nelson EA, Tam J, Soenarto Y. Wilopo SA, Kilgore P, Kim JS, Kang JO, Lan WS , Gaik CL, Moe K, Chen... 미소장
9 (2005) Update on rotavirus vaccines. Pcdiatr Infect Dis J 24:947-952. 미소장
10 Diagnosis of rotavirus infection by cell culture. 네이버 미소장
11 Centers for Disease Control and Prevention (CDC) (1999) Withdrawal of rotavirus vaccine recommendation. MMWR Morb Mortal Wkly Rep... 미소장
12 Molecular epidemiology and clinical manifestations of viral gastroenteritis in hospitalized pediatric patients in Northern Taiwan. 네이버 미소장
13 Species specificity and interspecies relatedness of NSP4 genetic groups by comparative NSP4 sequence analyses of animal rotaviruses. 네이버 미소장
14 Immune response of infants and children to low-passage bovine rotavirus (strain WC3). 네이버 미소장
15 Rotavirus vaccines and vaccination potential. 네이버 미소장
16 The expanding diversity of rotaviruses 네이버 미소장
17 FAILURE OF LIVE, ATTENUATED ORAL ROTAVIRUS VACCINE 네이버 미소장
18 Epidemiological features of rotavirus infection among hospitalized children with gastroenteristis in Ho Chi Minh City, Vietnam. 네이버 미소장
19 Rotaviruses in Venezuelan children with gastroenteritis. 네이버 미소장
20 (2001) Rotaviruses and their replication, p. 1747-1785. In Knipe DM, Howley RM, Griffin DE, Lamb RA, Martin MA, Roizman B, Straus... 미소장
21 Sentinel Hospital Surveillance for Rotavirus Diarrhea in the People's Republic of China, August 2001-July 2003 네이버 미소장
22 Diversity of rotavirus strains among children with acute diarrhea in China: 1998-2000 surveillance study. 네이버 미소장
23 (1993) PHYLIP (Phylogony Inference Package) version 3.5c. Department of Genetics, Seattle: University of Washington. 미소장
24 Reactions to and antigenicity of two human-rhesus rotavirus reassortant vaccine candidates of serotypes 1 and 2 in Venezuelan infants. 네이버 미소장
25 Identification of group A rotavirus gene 4 types by polymerase chain reaction. 네이버 미소장
26 The Epidemiology of Rotavirus Diarrhea in the United States: Surveillance and Estimates of Disease Burden 네이버 미소장
27 The promise of new rotavirus vaccines. 네이버 미소장
28 Rotavirus Serotype G5 Associated with Diarrhea in Brazilian Children 네이버 미소장
29 Polymerase chain reaction amplification and typing of rotavirus nucleic acid from stool specimens. 네이버 미소장
30 Diversity in Indian equine rotaviruses: identification of genotype G10,P6[1] and G1 strains and a new VP7 genotype (G16) strain in specimens from diarrheic foals in India. 네이버 미소장
31 Rapid diagnosis of rotavirus infection by direct detection of viral nucleic acid in silver-stained polyacrylamide gels. 네이버 미소장
32 Epidemiology and strain characterization of rotavirus diarrhea in Malaysia 네이버 미소장
33 (1969) Evolution of protein molecules. In Mammalian Protein Metabolism, volume 3. pp. 21-132. Edited by H.N. Munro. New York:... 미소장
34 Molecular Epidemiological Profile of Rotavirus in South Korea, July 2002 through June 2003: Emergence of G4P[6] and G9P[8] Strains 네이버 미소장
35 Antigenic characterization of human and animal rotaviruses by immune adherence hemagglutination assay (IAHA): evidence for distinctness of IAHA and neutralization antigens. 네이버 미소장
36 Strategies for the development of a rotavirus vaccine against infantile diarrhea with an update on clinical trials of rotavirus vaccines. 네이버 미소장
37 Rotavirus-Specific B Cells Induced by Recent Infection in Adults and Children Predominantly Express the Intestinal Homing Receptor α4β7 네이버 미소장
38 Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain 네이버 미소장
39 Emergence of human G9 rotavirus with an exceptionally high frequency in children admitted to hospital with diarrhea in Chiang Mai, Thailand 네이버 미소장
40 Distribution of rotavirus VP7 genotypes among children suffering from watery diarrhea in Kolkata, India 네이버 미소장
41 Neonatal rotavirus infection in Bangladesh: strain characterization and risk factors for nosocomial infection 네이버 미소장
42 Epidemiological Profile of Rotavirus Infection in the Republic of Korea: Results from Prospective Surveillance in the Jeongeub District, 1 July 2002 through 30 June 2004 네이버 미소장
43 Genetic Characterization of the Rotavirus Nonstructural Protein, NSP4 네이버 미소장
44 Korea Center for Disease Control and Prevention (2005) Laboratory surveillance of viral gastroenteritis. CDMR 16:61-67. 미소장
45 Genetic characterization of the rotaviruses associated with a nursery outbreak. 네이버 미소장
46 Neonatal Rotavirus Infection in Belem, Northern Brazil: Nosocomial Transmission of a P[6] G2 Strain 네이버 미소장
47 Changing epidemiology of rotavirus G-types circulating in Hong Kong, China. 네이버 미소장
48 Identification of group A porcine rotavirus strains bearing a novel VP4 (P) Genotype in Italian swine herds. 네이버 미소장
49 A candidate for a new serotype of human rotavirus. 네이버 미소장
50 Surveillance study (2000 to 2001) of G- and P-type human rotaviruses circulating in South Korea. 네이버 미소장
51 Genetic distribution of group A human rotavirus types isolated in Gyunggi province of Korea, 1999–2002 네이버 미소장
52 Murphy TV, Gargiullo PM, Massoudi MS, Nelson DB, Jumaan AO, Okoro CA, Zanardi LR, Setia S, Fair E, LeBaron CW, Wharton M,... 미소장
53 Nguyen VM, Nguyen VT, Huynh PL, Dang DT, Nguyen TH, Phan VT, Nguyen TL, Le TL, Ivanoff B, Gentsch JR, Glass RI； Vietnam... 미소장
54 Rotavirus and severe childhood diarrhea. 네이버 미소장
55 Global illness and deaths caused by rotavirus disease in children. 네이버 미소장
56 Safety and Efficacy of High-dose Rhesus-Human Reassortant Rotavirus Vaccines—Report of the National Multicenter Trial 네이버 미소장
57 The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. 네이버 미소장
58 Changing pattern of human group A rotaviruses: Emergence of G12 as an important pathogen among children in eastern India 네이버 미소장
59 Global distribution of rotavirus serotypes/genotypes and its implication for the development and implementation of an effective rotavirus vaccine 네이버 미소장
60 VP7 gene polymorphism of serotype G9 rotavirus strains and its impact on G genotype determination by PCR. 네이버 미소장
61 Overview of rotavirus infections in Korea 네이버 미소장
62 Monoclonal antibodies to subgroup 1 rotavirus. 네이버 미소장
63 Comparison of atypical rotaviruses from calves, piglets, lambs and man. 네이버 미소장
64 Distribution of human group a rotavirus VP7 and VP4 types circulating in Seoul, Korea between 1998 and 2000 네이버 미소장
65 Geographic distribution of human rotavirus VP4 genotypes and VP7 serotypes in five South African regions. 네이버 미소장
66 Molecular characterization of a new porcine rotavirus P genotype found in an asymptomatic pig in Slovenia 네이버 미소장
67 Rotavirus genotypes in Slovenia: unexpected detection of G8P[8] and G12P[8] genotypes. 네이버 미소장
68 The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools. 네이버 미소장
69 The rotavirus nonstructural glycoprotein NSP4 possesses membrane destabilization activity. 네이버 미소장
70 Cost-effectiveness analysis of a rotavirus immunization program for the United States. 네이버 미소장
71 Clinical trials of live oral rotavirus vaccines: the Finnish experience 네이버 미소장
72 Vesikari T, Matson DO, Dennehy P, Van Damme P, Santosham M, Rodriguez Z, Dallas MJ, Heyse JF, Goveia MG, Black SB, Shinefield HR,... 미소장
73 World Health Organization (WHO) (1999) Rotavirus vaccine. WHO WER 74:33-38. 미소장
74 (2006) Changing distribution of group A rotavirus G-types and genetic analysis of G9 circulating in Japan. Arch Virol 151:183-192. 미소장
75 Mutations in rotavirus nonstructural glycoprotein NSP4 are associated with altered virus virulence. 네이버 미소장
76 (2000) Rotavirus infection in children in Japan. Pcdiatr Int 42:428-439. 미소장
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