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표제지

목차

1. 서론 3

2. 유전자 알고리즘 6

2.1. 유전자 알고리즘 정의 6

2.2. 유전자 알고리즘의 매개변수 결정 9

3. 유전자 상호작용효과 규명을 위한 유전자 알고리즘 응용 13

3.1. 유전자 알고리즘에 의한 주요 SNP 선정 13

3.2. 유전자 알고리즘을 이용한 유전자 상호작용 규명 16

4. 실험 자료와 상호작용 효과 및 우수 유전자형 선정 결과 20

4.1. 실험 자료 20

4.2. 유전자 상호작용 효과 및 우수 유전자형 선정 21

5. 결론 및 토의 28

참고문헌 30

Abstract 35

표목차

표 2.1. 유전자 알고리즘 사용을 위한 매개변수 10

표 2.2. 오분류표 12

표 4.1. K-means방법을 이용한 이분화 결과 21

표 4.2. 균형화와 resampling 결과 21

표 4.3. 유전자 알고리즘을 이용한 주요 SNP 선정 결과 22

표 4.4. 유전자 알고리즘을 통한 경제형질별 2개의 SNPs 조합마커와 정확도(상위 5개) 23

표 4.5. 경제형질별 영향을 많이 주는 SNPs 조합마커의 유의성 검정 결과 23

표 4.6. 유전자 알고리즘을 통한 경제형질별 3개의 SNPs 조합마커와 정확도(상위 5개) 25

표 4.7. 경제형질별 SNPs 조합마커의 우수 유전자형 선정 및 유의성 검정 결과 25

표 4.8. 공통으로 나타난 우수 유전자형을 각 경제형질에 대한 t-검정 결과 27

그림목차

그림 2.1. 유전자 알고리즘 절차 8

그림 2.2. 단순교배 11

그림 3.1. 유전자 알고리즘을 이용한 주요 SNPs 선정 14

그림 3.2. 유전자 알고리즘을 이용한 유전자 상호작용효과 규명 절차 17

그림 3.3. WEKA프로그램 내의 분석 흐름도 19

초록보기

Genetic algorithm has been applied to many fields for search like non-linear problem based on multiple variables and optimization process. Among others, in the data mining field, there are methods to select the best input variables for model accuracy and various predict models which were merged by using the genetic algorithm. By the way, to improve and preserve quality of the Hanwoo(Korean cattle) which is represented the agricultural industry in our country, we need to find out outstanding economical traits of Hanwoo in having specific genotype of single nucleotide polymorphism(SNP) which is inherited to next generation. This research proposed the identification of gene-gene interaction by using the genetic algorithm. And we selected the best genotypes of the principal SNPs marker by applying to real data on Hanwoo genetic.

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