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표제지
목차
국문요약 7
1. 서론 9
2. 재료 및 방법 11
2.1. 채집 11
2.2. DNA 추출 12
2.3. 중합효소연쇄반응(PCR) 12
2.4. Gene cloning 13
2.5. 데이터 분석 13
3. 결과 16
4. 고찰 25
5. 인용문헌 29
ABSTRACT 34
Table 1. PCR primers used in this study 15
Table 2. Genetic distances for pairwise comparisons between 610 COI gene sequences. 16
Table 3. BLAST search results showing more than 98% identity to subject sequences. 18
Table 4. Genetic distances for pairwise comparisons between 322 COI sequences for 18 nominal species. 20
Table 5. Genetic distances for pairwise comparisons between 228 COI sequences for 24 MOTUs. 21
Figure 1. A map showing the sampling location in Lake Sihwa. 11
Figure 2. Agarose gel electrophoresis of plasmid DNA digested with EcoRI. 14
Figure 3. Frequency distribution of genecic distances by pairwise comparisons of 610 COI gene sequences. 17
Figure 4. Neighbor-joining tree of 322 COI gene sequences of 18 nominal species. 22
Figure 5. Neighbor-joining tree of 288 COI gene sequences of 24 MOTUs. 23
Figure 6. Neighbor-joining tree of 610 COI gene sequences of all examined MOTUs 24
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동물플랑크톤은 해양생태계에서 생산자와 2차 소비자를 연결 해주는 연결고리로서 먹이사슬에서 매우 중요한 역할을 하고 있고, 환경 변화의 지표생물로 많이 이용되고 있다. 따라서 해양환경을 이해하고 그 변화를 예측하기 위하여 동물플랑크톤의 군집 분석은 매우 중요하다. 동물플랑크톤은 크기가 작고, 몸이 연약하며, 형태분류학자가 부족하기 때문에 동물플랑크톤에 속하는 다양한 분류군의 종 동정이 쉽지 않다. 본 연구에서는 분석지역인 시화호를 대표적 사례로 하여 동물플랑크톤 군집을 분석하기 위해서 미토콘드리아 cytochrome oxidase I (COI) 유전자 염기서열을 이용한 분자동정을 시도하였다. 채집한 bulk sample과 필요에 따라 나머지 시료에서 형태학적으로 차이가 나는 개체에서 DNA를 추출하였다. COI 유전자를 증폭하기 위해서 동물플랑크톤의 다양한 분류군에 이용되는 universal PCR primer를 이용하여 최적의 조건에서 중합효소연 쇄반응(PCR)을 실시하였다. Bulk sample의 PCR 산물은 cloning을 실시하여 무작위로 재조합 clone을 선택하여 DNA sequencing하였다. 모두 610개의 염기서열로부터 유전거리를 계산하고 계통수를 작성하며, NCBI BLAST 검색을 하여 18종을 확인하였으며 속 이상의 상위 분류군으로 할당된 24개의 분자운영분류단위(molecular operational taxonomic unit, MOTU)를 확인하였다. 확인된 18종에는 요각류 7종, 십각류 3종, 지각류 1종, 모악류 2종, 히드라충류 1종, 어류 유생 4종 등이 포함되었다. 정확한 해양 동물플랑크톤의 동정을 위해서는 한국 해역에서 서식하는 동물폴랑크톤의 참조표준데이터가 더욱 축적되어야 할 것이다.
원문구축 및 2018년 이후 자료는 524호에서 직접 열람하십시요.
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