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기사명/저자명
Heating of freeze-dried protein samples with urea for SDS-PAGE in proteomics study / Yul-Taek Jeon, Margaret R Ruzicka, Il Kyu Cho, Qing Xiao Li, Soo-Un Kim 인기도
발행사항
서울 : 한국응용생명화학회, 2011.02.28
수록지명
한국응용생명화학회지= Journal of the Korean society for applied biological chemistry. 제54권 제1호 (2011년 2월), pp.19-23
자료실
[서울관] 정기간행물실(524호)
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제어번호
KINX2011046390
원문
외부기관 원문
KISTI

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Contents

Heating of freeze-dried protein samples with urea for SDS-PAGE in proteomics study / Yul-Taek Jeon ; Margaret R Ruzicka ; Il Kyu Cho ; Qing Xiao Li ; Soo-Un Kim 1

[요약] 1

Materials and Methods 2

Preparation of freeze-dried fungal extract. 2

SDS-PAGE. 2

In-gel digestion. 2

Protein identification. 2

Peptide mass fingerprinting. 3

Results and Discussion 3

References 4

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Though urea helps solubilize the protein samples, use of urea under the boiling condition is generally avoided due to carbamylation of protein by cyanate in equilibrium with urea. Validity of adding urea in standard sample buffer and subjecting the standard protein, bovine serum albumin, to SDS-PAGE according to Laemmli procedure, which invariably involves heating of the protein sample at 100oC, was evaluated. Heating samples with crystalline ultra-pure urea improved separation, and the peptide mass fingerprint of the gel-separated protein by matrixassisted laser desorption/ionization time-of-flight/time-of-flight mass spectrometer (MALDI TOF/TOF MS) indicated that the protein could be identified without difficulty with 39.2% of peptide

coverage, which was comparable to the value obtained from the protein not treated with urea.

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Heating of freeze-dried protein samples with urea for SDS-PAGE in proteomics study Yul-Taek Jeon ,Margaret R Ruzicka ,Il Kyu Cho ,Qing Xiao Li ,Soo-Un Kim pp.19-23 원문보기 (음성지원, 협정기관 방문 후 이용 가능 ) 보기
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Ethyl-(4-hydroxyphenyl) oxamate sodium salt as a strong melanin biosynthesis inhibitor Yong Kweon Cho ,Dong-Soo Shin pp.66-72 원문보기 (음성지원, 협정기관 방문 후 이용 가능 ) 보기
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