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Archaeal communities were investigated using 454 pyrosequencing technology based on 16S rRNA gene in 11 samples collected from six different full-scale anaerobic digesters. Observed operational taxonomic units (OTUs) estimated from the archaeal 16S rRNA gene sequences were 13-55 OTUs (3% cutoff) which was corresponded to 29-89% of Chao1 richness estimates. In the anaerobic digesters there were archaeal sequences within the orders Thermoproteales, Thermoplasmatales, Desulfurococcales as well as within the orders Methanomicrobiales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanosarcinales, and Methanocellales, which are known to produce methane. Among these orders, Methanococcales known to produce methane using hydrogen was the predominant taxon and constituted 51.8-99.7% of total sequences. All samples showed a very similar community structure (Pearson correlation coefficient=0.99) except for one sample based on a heat map analysis. In addition, canonical correspondence analysis correlating archaeal communities to the environmental variables demonstrated that digester temperature and total solids removal rate were the two important explanatory variables. Overall results suggested that environmental and operational variables of anaerobic digester are important factors determining archaeal diversity and community structure.

권호기사

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기사명 저자명 페이지 원문 목차
난배양성 토양세균을 위한 신배양기술의 고찰과 향후 발전 방향 김재수 pp.179-187

C형 간염바이러스(HCV)의 NS5B RNA Replicase에 의해 활성이 유도되는 Hammerhead 리보자임에 의한 HCV 복제 억제 연구 이창호, 이성욱 pp.188-193

호알칼리성 Bacillus pseudofirmus HS-54가 생산하는 알칼리성 Protease의 특성 방성호, 정인실 pp.194-199

서로 다른 두 단백질의 세포 내 동시 발현 체계의 개발을 통한 ErmSF에서 특이적으로 발견되는 N-Terminal End Region(NTER)을 포함하는 펩타이드의 생체내에서의 ErmSF 활성 억제 효과 검색 진형종 pp.200-208

454 Pyrosequencing을 이용한 실규모 혐기성 소화조의 아케아 군집구조 분석 강현진, 김택승, 이영행, 이택준, 한금석, 최영준, 박희등 pp.209-217

케피어그레인으로 제조한 요쿠르트로부터 Enterococcus faecalis OA18 균주의 분리 및 특성규명 유진주, 김수곤, 서경원, 오석흥 pp.218-224

Microbacterium sp. 분리균의 Hemicellulases 생산성과 효소특성 윤기홍 pp.225-230

갓김치에서 분리된 Pediococcus pentosaceus MLK67의 담즙산 분해능 및 콜레스테롤 동화능 임성미 pp.231-240

오염된 음료에서 분리된 세균에 대한 한약재의 항균성 유영은, 김옥아, 김상찬, 박성민 pp.241-248

Penicillium brevi-compactum을 이용한 면역억제제 Mycophenolic Acid 발효에서 탄소원 및 질소원의 영향 노용택 pp.249-254

무당벌레 소화기관으로부터 산성 단백질 분해효소를 생산하는 Staphylococcus sp. CB2-3의 분리 및 특성 김세종, 황경숙 pp.255-262

균주간 유전체 지문 비교분석에서 유전형질 일치성의 확률적 한계 분석 조영근 pp.263-267

남조세균 Anabaena 종 구분을 위한 RNA Polymerase Beta Subunit(rpoB) 유전자염기서열 분석 천주용, 이민아, 기장서 pp.268-274

Pyrosequencing을 이용한 전통된장 제조과정 중 세균군집구조의 분석 김용상, 정도연, 황영태, 엄태붕 pp.275-280

참고문헌 (40건) : 자료제공( 네이버학술정보 )

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 Methanogenic population dynamics during startup of a full-scale anaerobic sequencing batch reactor treating swine waste 네이버 미소장
2 The Ribosomal Database Project (RDP-II): sequences and tools for high-throughput rRNA analysis 네이버 미소장
3 Microbial community structure and methanogenic activity during start-up of psychrophilic anaerobic digesters treating synthetic industrial wastewaters 네이버 미소장
4 Distribution and diversity of archaea corresponding to the limnological cycle of a hypersaline stratified lake (Solar lake, Sinai, Egypt). 네이버 미소장
5 Monitoring of activity dynamics of an anaerobic digester bacterial community using 16S rRNA polymerase chain reaction--single-strand conformation polymorphism analysis. 네이버 미소장
6 Archaea in Coastal Marine Environments 네이버 미소장
7 Biotechnology Journal 3/2008 네이버 미소장
8 Gilliam, F.S. and N.E. Saunders. 2003. Making more sense of the order: A review of Canoco for Windows 4.5, PC-ORD version 4 and SYN-TAX 2000. J. Veg. Sci. 14, 297-304. 미소장
9 Molecular microbial diversity of an anaerobic digestor as determined by small-subunit rDNA sequence analysis. 네이버 미소장
10 PC-ORD version 5: A user-friendly toolbox for ecologists 네이버 미소장
11 Detection and localization of syntrophic propionate-oxidizing bacteria in granular sludge by in situ hybridization using 16S rRNA-based oligonucleotide probes. 네이버 미소장
12 Huber, H. and K.O. Stetter. 2006. Desulfurococcales, pp. 52-68. In M. Dworkns (ed.), Prokaryotes: an evoling electron resource for the microbiological community, Springer, New York, NY, USA. 미소장
13 Huber, H., M. Thomm, H. Konig, G. Thies, and K.O. Stetter. 1982. Methanococcus thermolithotrophilcus, a novel thermophilic lithotrophic methanogen. Arch. Microbiol. 132, 47-50. 미소장
14 Effects of prolonged starvation on methanogenic population dynamics in anaerobic digestion of swine wastewater. 네이버 미소장
15 Analysis of Methanogenic Archaeal and Sulphate Reducing Bacterial Populations in Deep Sediments of the Black Sea 네이버 미소장
16 Jones, W.J., J.A. Leigh, F. Mayer, C.R. Woese, and R.S. Wolfe. 1983. Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent Arch. Microbiol. 136, 254-261. 미소장
17 Methanogenic community shift in anaerobic batch digesters treating swine wastewater 네이버 미소장
18 Archaeal diversity in tidal flat sediment as revealed by 16S rDNA analysis. 소장
19 Characterization of the methanogenic Archaea within two-phase biogas reactor systems operated with plant biomass 네이버 미소장
20 Biotechnology in Turkey: an overview. 네이버 미소장
21 Microbial community dynamics during start-up of acidogenic anaerobic reactors 네이버 미소장
22 Madigan, M.T. and J.M. Martinko. 2006. Brock biology of microorganisms. 11th ed. Upper Saddle, Prentice Hall, USA. 미소장
23 Metcalf and Eddy. 2003. Wastewater engineering: treatment and reuse. 4th ed. McGraw-Hill, New York, NY, USA. 미소장
24 Metzker, M.L. 2010. Sequencing technologies-the next generation. Nat. Rev. Genetics 11, 31-46. 미소장
25 Vertical stratification of microbial communities in the Red Sea revealed by 16S rDNA pyrosequencing 네이버 미소장
26 Quince, C., A. Lanzen, T.P. Curtis, R.J. Davenport, N. Hall, I.M. Head, L.F. Read, and W.T. Sloan. 2009. Accurate determination of microbial diversity from 454 pyrosequencing data. Nat. Meth. 6, 639-641. 미소장
27 Raskin, L., D.D. Zheng, M.E. Griffin, P.G. Stroot, and P. Misra. 1995. Characterization of microbial communities in anaerobic bioreactors using molecular probes. Antonie van Leeuwenhoek 68, 297-308. 미소장
28 Rittmann, B.E. and P.E. McCarty. 2001. Environmental biotechnology:principles and applications. McGraw-Hill Higher Education, New York, USA. 미소장
29 Schleper, C., G. Puehler, I. Holz, A. Gambacorta, D. Janekovic, U. Santarius, H.P. Klenk, and W. Zillig. 1995. Picrophilus gen. nov., fam. nov.: a novel aerobic, heterotrophic, thermoacidophilic genus and family comprising archaea capable of growth around pH 0. J. Bacteriol. 177, 7050-7059. 미소장
30 Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. 네이버 미소장
31 Biotechnology Journal 3/2008 네이버 미소장
32 Shin, S., G. Han, J. Lim, C. Lee, and S. Hwang. 2010. A comprehensive microbial insight into two-stage anaerobic digestion of food waste-recycling wastewater Water Res. 44, 4838-4849. 미소장
33 Variations in methanogenic population structure under overloading of pre-acidified high-strength organic wastewaters 네이버 미소장
34 Effect of Temperature on Microbial Community of a Glucose-Degrading Methanogenic Consortium under Hyperthermophilic Chemostat Cultivation 네이버 미소장
35 CANOCO: An Extension of DECORANA to Analyze Species-Environment Relationships 네이버 미소장
36 A nested PCR approach for improved recovery of archaeal 16S rRNA gene fragments from freshwater samples 네이버 미소장
37 Effects of various fatty acid amendments on a microbial digester community in batch culture. 네이버 미소장
38 Nutrition and carbon metabolism of Methanococcus voltae. 네이버 미소장
39 Whitman, W.B. and C. Jeanthon. 2006. Methanococcales, pp. 257-273. In M. Dworkns (ed.), Prokaryotes: an evolving electron resource for the microbiological community, Springer, New York, NY, USA. 미소장
40 Group‐specific primer and probe sets to detect methanogenic communities using quantitative real‐time polymerase chain reaction 네이버 미소장

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