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Draft genome sequence of Anaerosporobacter sp. nov., strain AGMB01083 isolated from a faeces of Korean cow ＝ 한우 분변에서 분리된 Anaerosporobacter 속의 신종 균주 AGMB01083의 유전체 염기서열 초안 / Seung-Hyeon Choi ; Jam-Eon Park ; Ji Young Choi ; Se Won Kang ; Moon-Soo Rhee ; Kang Hyun Lee ; Mi-Kyung Lee ; Jiyoung Lee ; Ju Huck Lee ; Jung-Sook Lee ; Seung-Hwan Park 1

[Text] 1

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Anaerosporobacter에 속하는 균주는 산림 토양에서 분리

된 것으로 알려져 있다. Anaerosporobacter sp. nov. strain AG

MB01083 균주는 한우 분변에서 분리되었다. Illumina 플랫폼

을 이용한 strain AGMB01083의 유전체 서열에 따라 새로운

종을 기술한다. 16S rRNA 서열 유사성에 따르면, AGMB01083

균주는 Anaerosporobacter mobilis HY-37-4T (95.7%)와 가장

밀접한 관련이 있었다. 유전체는 36.6%의 DNA G + C 함량,

3,981개의 유전자, 27개의 rRNA, 70개의 tRNA로 구성되었으

며, 염색체의 크기는 4,589,105 bp 구성되어 있다.

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기사명 저자명 페이지 원문 목차
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Draft genome sequence of Anaerosporobacter sp. nov., strain AGMB01083 isolated from a faeces of Korean cow = 한우 분변에서 분리된 Anaerosporobacter 속의 신종 균주 AGMB01083의 유전체 염기서열 초안 Seung-Hyeon Choi, Jam-Eon Park, Ji Young Choi, Se Won Kang, Moon-Soo Rhee, Kang Hyun Lee, Mi-Kyung Lee, Jiyoung Lee, Ju Huck Lee, Jung-Sook Lee, Seung-Hwan Park p. 180-182

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참고문헌 (8건) : 자료제공( 네이버학술정보 )

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 Bankevich A, Nurk S, Antipov D, Gurevich AA, Dvorkin M, Kulikov AS, Lesin VM, Nikolenko SI, Pham S, Prjibelski AD, et al. 2012. S pades: A n ew g enom e assem bly algorithm a nd i ts applications to single-cell sequencing. J. Comput. Biol. 19, 455–477. 미소장
2 Jeong H, Lim YW, Yi H, Sekiguchi Y, Kamagata Y, and Chun J. 2007. Anaerosporobacter mobilis gen. nov., sp. nov., isolated from forest soil. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57, 1784–1787. 미소장
3 Data, information, knowledge and principle: back to metabolism in KEGG. 네이버 미소장
4 Lee I, Chalita M, Ha SM, Na SI, Yoon SH, and Chun J. 2017. Contest16S: An algorithm that identifies contaminated prokaryotic genomes using 16S rRNA gene sequences. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67, 2053–2057. 미소장
5 Lee I, Ouk Kim Y, Park SC, and Chun J. 2016. OrthoANI: An improved algorithm and software for calculating average nucleotide identity. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66, 1100–1103. 미소장
6 Parks DH, Imelfort M, Skennerton CT, Hugenholtz P, and Tyson GW. 2015. CheckM: Assessing the quality of microbial genomes recovered from isolates, single cells, and metagenomes. Genome Res. 25, 1043–1055. 미소장
7 UniProt: a hub for protein information. 네이버 미소장
8 Wilson KH, Blitchington RB, and Greene RC. 1990. Amplification of bacterial 16S ribosomal DNA with polymerase chain reaction. J. Clin. Microbiol. 28, 1942–1946. 미소장

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