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자료명/저자사항
효율적인 야생동물질병 조사를 위한 시료확보체계 마련 [전자자료] = Establishment of sample collection system to investigate efficiently wildlife disease / 국립환경과학원 인기도
발행사항
인천 : 국립환경과학원, 2016
청구기호
전자형태로만 열람가능함
자료실
전자자료
내용구분
연구자료
형태사항
1 온라인 자료 : PDF
출처
외부기관 원문
총서사항
NIER-SP ; 2016-387
면수
248
제어번호
MONO1201764529
주기사항
연구기관: 경상대학교
연구책임자: 연성찬
원문

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표제지

목차

요약문 3

I. 서론 18

1. 연구사업의 배경 18

가. 기후변화에 따른 전염병증가 18

나. 야생동물감염병의 통합적 접근 및 관리의 필요성 19

(1) 전염병 관리를 위한 One Health 19

(2) 야생동물에서 전염병 모니터링의 중요성 20

2. 연구 필요성 22

3. 연구 목표 23

Ⅱ. 과업의 범위 및 연구추진체계 26

1. 과업의 범위 26

가. 전국야생동물센터와 유기적 공조를 통한 중장기 시료확보방안 마련 26

(1) 야생동물 시료의 채취ㆍ수집 체계화 26

(2) 야생동물 질병진단 방법 및 시료채취의 표준화 방안 마련 26

나. 전국적인 시료확보체계 운영을 통해 수집된 야생동물 시료 및 정보를 상위기관에 제공 26

(1) 2016년도 야생동물 폐사체 제공 26

(2) 2016년도 동안 구조ㆍ치료 대상인 야생동물로부터 혈액채취 및 혈청수집 26

(3) 2016년도 야생포유동물에서 참진드기 채집 및 수집ㆍ보관 후 시료정보와 함께 지역거점 야생동물질병진단기관(경남야생동물센터)에 제공 26

다. 야생동물별 주요 질병검사를 위한 시료채취ㆍ보관ㆍ수송 매뉴얼 마련 27

(1) 구조ㆍ치료대상의 살아있는 야생동물로부터 질병검사를 위한 시료채취ㆍ보관ㆍ수송방법 27

(2) 구조ㆍ조치 후 사체 또는 폐사체로부터 부검을 통한 시료채취ㆍ보관ㆍ수송방법 27

라. 수집ㆍ확보된 2016년 야생동물시료의 SFTS 감염률 조사 27

(1) 국내외 SFTS 발생동향 및 특성분석 27

(2) 2016년도 수집된 야생동물시료에 대한 SFTS 감염률 조사 27

2. 연구추진체계 28

3. 연구추진일정 계획 29

4. 연구원 구성 30

Ⅲ. 연구내용 및 방법 32

1. 질병검사를 위한 전국야생동물시료의 효율적인 확보방안마련 32

가. 야생동물 감염병 조사를 위한 전국 야생동물시료의 확보체계구축 32

(1) 전국 야생동물구조센터활용 32

(2) 야생동물구조센터간의 유기적 공조체계를 통해 감염병진단을 위한 야생동물시료 채취ㆍ수집 33

(3) 수집ㆍ확보된 야생동물시료의 안정적인 수송 및 시료정보제공 33

나. 야생동물감염병 검사를 위한 전국 야생동물시료수집 계획 마련 35

(1) 폐사체에 대한 시료수집 계획마련 35

(2) 혈청 시료 및 참진드기 시료 수집 계획마련 38

2. 야생동물질병 모니터링을 위한 주요 질병별 시료채취 확보방안 마련 39

가. 포유야생동물별 주요 질병 조사 및 선정 39

나. 동물의 질병조사를 위해 사용되는 다양한 시료들에 대한 조사 39

다. 야생동물구조센터의 구조ㆍ치료 업무 중에 채취ㆍ보관 가능한 시료 40

3. 전국 시료확보체계 운영을 통해 확보된 야생동물시료의 SFTSV 감염조사 41

가. 야생동물시료의 SFTS 바이러스 감염 조사ㆍ진단과정의 매뉴얼 41

(1) 혈청에서 viral RNA 추출 및 SFTS 바이러스 양성샘플 준비 43

(2) SFTS 바이러스의 검출을 위한 Duplex One-Step Real-Time RT-PCR의 primer와 probe 제작 44

(3) SFTS 바이러스의 검출을 위한 Duplex One-Step Real-Time RT-PCR 46

(4) 혈청 내 SFTS 바이러스의 One-Step RT-Nested PCR에 의한 재검사 47

(5) 2차 검사 One-Step RT-Nested PCR에 의해 양성으로 검출된 시료의 SFTS 바이러스 유전자 분석 48

나. 야생동물에서 채집한 참진드기의 흡혈ㆍ비흡혈 분리 및 동정과 pooling 48

(1) 야생동물에서 채집한 참진드기 분류 및 pooling 49

(2) 참진드기 pool시료로부터 viral RNA추출 50

(3) SFTSV의 검출을 위한 Duplex One-Step Real-Time RT-PCR 또는 One-Step RT-Nested PCR 50

(4) 야생동물에서 채집한 참진드기로부터 SFTS 바이러스 유전자 분석 50

Ⅳ. 연구결과 및 고찰 52

1. 효율적인 전국 시료확보방안 및 체계구축 52

가. 관계기관의 유기적 공조ㆍ협력을 통한 시료확보 52

(1) 전국 야생동물구조센터의 시료확보를 위한 수집ㆍ이동ㆍ운반에 관한 표준운영절차(SOP)를 마련, 시행 53

(2) 야생동물 질병 조사를 위한 중장기 시료확보 방안 마련 53

나. 2016년 전국 야생동물구조센터의 구조현황 55

(1) 2016년 축종별 야생동물구조현황 56

(2) 2016년 전국 야생동물구조센터의 구조ㆍ치료 및 구조ㆍ폐사체 현황 59

다. 유기적 공조를 통한 야생동물질병 검사를 위한 전국적인 시료수집 61

(1) 2016년 전국 야생동물구조센터로부터 사체 수집 및 확보 62

(2) 2016년 전국 야생동물구조센터로부터 혈청시료 수집 결과 및 확보 현황 64

2. 야생동물 종류별 주요 감염병 검사를 위한 실험실 시료채취 매뉴얼마련 66

가. 초기 구조ㆍ치료 과정에 있는 야생동물로부터 시료채취 70

나. 야생동물 구조ㆍ치료 과정에서 발생하는 폐사체로부터 부검을 통한 시료채취 73

3. 수집된 혈청 및 참진드기 시료의 SFTS 바이러스 검출 73

가. 국내외 SFTS 발생동향 및 특성분석 73

(1) 국내 발생동향 및 특성분석 73

(2) 주변국 SFTS 발생동향 및 특성분석 77

(가) 중국 77

(나) 일본 78

(3) SFTS 특성분석 및 진단 79

(가) 특성 및 발병기전 79

(나) 감염 경로 80

(다) 진단 및 치료ㆍ예방 81

나. 2016년 수집ㆍ확보된 혈청시료의 SFTSV 감염조사 81

(1) SFTSV 감염조사를 위한 검체시료로 혈청의 수집ㆍ확보 현황 81

(2) 혈청시료의 SFTSV 검출률 조사결과 83

(가) TaqMan® Duplex One-Step Real-Time RT-PCR(1차 검사, 양성의심시료 시크리닝) 83

(나) 양성의심검체로부터 One-Step RT-Nested PCR에 의한 최종적인 진단결과 85

다. 2016년 수집ㆍ확보된 진드기시료의 SFTSV 감염조사 90

(1) SFTSV 감염조사를 위한 검체시료 진드기의 수집ㆍ확보 현황 90

(2) SFTSV 감염조사를 위한 검체시료 진드기의 분리ㆍ동정 결과 92

(3) 진드기 pool시료의 SFTSV 검출 및 최소야외감염률, MFIR 조사결과 94

(가) TaqMan® Duplex One-Step Real-Time RT-PCR(1차 검사, 양성의심시료 시크리닝 작업) 94

(나) 양성의심검체의 최종적인 SFTSV 감염진단결과(One-Step RT-Nested PCR법) 96

(다) SFTSV감염된 참진드기 pool시료가 혈액의 감염에 미치는 영향 100

(라) 수집한 혈청 및 진드기의 양성검체로부터 SFTS 바이러스 유전자 분석 104

Ⅴ. 결론 및 개선사항 106

1. 결론 106

2. 개선사항 110

가. 야생동물 질병모니터링 네트워크의 필요성 및 목적 110

나. 야생동물 질병모니터링 네트워크 구축 방안 110

다. 야생동물 질병연구 및 구조ㆍ치료에 대한 제도개선 사항 111

Ⅵ. 기대성과(활용방안) 또는 향후계획 114

1. 기대성과(활용방안) 114

2. 향후계획 114

Ⅶ. 참고문헌 116

[부록 1] 2016년도 전국 야생동물구조센터의 야생동물 종별ㆍ지역별 구조ㆍ치료 현황 121

[부록 2] 2016년도 국립환경과학원에 제공된 사체시료 목록 및 정보-포유류 125

[부록 3] 2016년도 국립환경과학원에 제공된 사체시료 목록 및 정보-조류 129

[부록 4] 2016년도 국립환경과학원에 제공된 혈청시료 목록 및 정보 134

[부록 5] 2016년도 SFTSV감염조사를 위해 전국야생동물센터와 유기적 공조를 통해 포유류에서 수집된혈청 및 진드기 목록 및 정보 141

[부록 6] 2016년도 야생포유류에서 채집한 진드기의 동정 및 흡혈여부 조사 및 진드기 pool시료 목록ㆍ정보 및 SFTSV 감염검사 결과 149

[부록 7] 2016년도 개체별 수집된 혈청 및 진드기시료의 SFTSV 감염검사 결과 159

[부록 8] 2016년도 국내 야생동물 혈청 및 진드기pool의 양성시료로부터 부분적인 SFTSV의 S 분절(346bp)에 대한 유전자분석결과 및 계통도 작성을 위해 사용된 DNA 염기서열 167

[부록 9] 2016년도 야생동물 질병진단을 위한 시료채취 매뉴얼 174

Part 1. 살아 있는 야생동물에서 시료채취 177

시료채취 전 준비사항 177

야생 고라니 주요 감염병 178

소 바이러스성 설사ㆍ점막병(Bovine Viral Diarrhea, BVD) 179

결핵병(Tuberculosis) 183

큐열(Q-Fever) 185

라임병(Lyme disease) 188

중증열성혈소판감소증후군(Sever Fever with Thrombocytopenia Syndrome : SFTS) 190

야생 너구리 주요 감염병 192

광견병(Rabies) 193

개 인플루엔자 바이러스(Canine Influenza Virus) 199

라임병(Lyme disease) 203

개 디스템퍼(Canine Distemper Virus) 205

개 파보바이러스(Canine Parvo Virus) 208

야생 조류 주요 감염병 212

조류인플루엔자(Avian Influenza Virus) 213

보툴리즘(Botulism) 217

살모넬라(Salmonella spp.) 219

리메렐라 감염증(Riemerella) 223

뉴캐슬병(Newcastle disease) 227

Part 2. 야생동물 폐사체의 부검을 통한 시료채취 230

야생동물 부검 및 시료채취 232

야생 고라니 사체부검 및 시료채취 233

야생 너구리 사체부검 및 시료채취 236

야생 조류 사체부검 및 시료채취 239

참고문헌 & 부록 241

Table 3-1-1. 야생동물감염병 검사를 위해 국립환경과학원에 제공할 사체시료수집 계획 37

Table 3-1-2. 야생동물감염병 검사를 위해 국립환경과학원에 제공할 혈청시료수집 계획 38

Table 3-2-1. 조사대상 동물에 대한 야생동물 질병 분류 40

Table 3-3-1. TaqMan® Duplex One-Step Real-Time RT-PCR 및 One-Step RT-Nested PCR법에 의한 SFTS 바이러스 검출을 위해 제작된 특이적인 primer와 probe 45

Table 4-1-1. 2016년 전국야생동물구조센터의 구조ㆍ신고 접수 건수(2016. 1.~10.) 56

Table 4-1-2. 2016년 야생동물구조센터의 지역별 구조접수 및 치료ㆍ조치 현황 59

Table 4-1-3. 2016년 야생동물구조센터의 월별 구조접수 및 치료ㆍ조치 현황 60

Table 4-1-4. 야생동물 질병 검사를 위해 수집된 사체시료 현황 62

Table 4-1-5. 야생동물 질병 검사를 위해 수집ㆍ확보된 혈청시료 현황 64

Table 4-2-1. 인수공통감염병 중 법적관리대상이 되는 감염병 68

Table 4-2-2. 야생동물 질병 모니터링을 위한 선정된 대상 야생동물 및 감염병 70

Table 4-2-3. 선정된 야생동물 3종에 대한 주요 감염병의 실험실 진단검사를 위해 구조ㆍ치료과정 중에 살아있는 상태에서 채취가 가능한 시료와 채취된 시료의 장기보관 방법 71

Table 4-2-4. 선정된 야생동물 3종에 대한 주요 감염병의 실험실 진단검사를 위해 구조 후 발생한 폐사체 부검을 통한 시료채취 가능한 부위 및 장기보관 방법 72

Table 4-3-1. 야생포유동물의 SFTSV 감염조사를 위한 검체시료로 2016년도 혈청시료의 지역별ㆍ월별 수집현황(2016. 3.~11.) 82

Table 4-3-2. 2016년 SFTSV 감염조사를 위해 전국 야생동물센터에서 포유동물로부터 채취한 혈청 시료의 포유동물 종류별 시료수집 현황(2016. 3.~11.) 83

Table 4-3-3. 전국 야생동물구조센터에서 수집된 야생 포유동물 혈청시료의 월별 SFTSV 감염률 조사(2016) 87

Table 4-3-4. 전국 야생동물구조센터에서 수집된 야생 포유동물 혈청시료의 지역별 SFTSV 감염률 조사(2016) 88

Table 4-3-5. 전국 야생동물구조센터에서 수집된 야생 포유동물 혈청시료의 포유동물 종류별 SFTSV 감염률 조사(2016) 89

Table 4-4-1. 2016 야생동물에서 채집된 참진드기의 SFTSV 감염률 검사를 위한 진드기시료의 월별ㆍ지역별 수집현황(2016. 3.~11.) 91

Table 4-4-2. 2016 SFTSV 감염률 검사를 위해 야생 포유동물에서 채집된 진드기 시료의 포유류 종류별ㆍ지역별 수집현황(2016. 3.~11.) 91

Table 4-4-3. 전국 야생동물구조센터에서 구조된 포유동물로부터 채집된 흡혈ㆍ비흡혈 진드기의 수집현황(2016. 3.~11.) 92

Table 4-4-4. 전국 야생동물구조센터로부터 구조된 포유동물로부터 채집된 진드기의 진드기종류별ㆍ발육단계별ㆍ지역별 수집현황(2016. 3~ 11.) 93

Table 4-4-5. 전국 센터의 야생포유동물에서 수집된 참진드기의 SFTSV 감염률 월별현황 97

Table 4-4-6. 전국 센터의 야생포유동물에서 수집된 참진드기의 지역별 SFTSV 감염률 현황 98

Table 4-4-7. 전국 센터의 야생포유동물에서 수집된 참진드기의 SFTSV 감염률 동물별 현황 99

Table 4-4-8. One-Step RT-Nested PCR에 의해 최종 양성검체로 확인된 혈청시료가 수집된 야생동물의 개체목록 및 시료정보 101

Table 4-4-9. 야생포유동물에서 수집한 참진드기(pool시료)와 혈청 모두에서 One-Step Real-Time RT-PCR에 의해 양성의심검체로 확인된 개체목록 및 시료정보 102

Table 4-4-10. 최종 양성검체로 확인된 참진드기(pool시료)가 채집된 야생동물의 개체목록 및 시료정보 103

Fig. 1-1. 기온 상승에 따른 전염병 발생 증가율 변화(그림출처: 한국보건사회연구원) 18

Fig. 1-2. 야생동물 매개질병 발생으로 인한 야생동물질병의 국민적 관심증가와 'One Health'관점의 야생동물전염병 통합적 접근ㆍ관리방안 필요성(그림출처: 조선일보자료 일부변경; One Health Conference, Nagoya logo) 19

Fig. 1-3. 환경에 존재하는 병원체의 다양한 전파경로(Friend, M., 2006. Disease Emergence and Resurgence: The Wildlife-Human Connection. U.S. Geological Survey, Reston, Va.) 21

Fig. 1-4. 야생동물 질병 대응 기반 구축을 위한 전국 야생동물시료 확보 및 효율적인 야생동물질병 모니터링 기반 마련 및 수행의 필요성 23

Fig. 3-1-1. 야생동물구조센터의 로고 및 지리적 위치 32

Fig. 3-1-2. 전국 각 센터에 배송된 야생동물시료수집에 관련된 물품 및 물품목록 33

Fig. 3-1-3. 야생동물감염병 검사 및 모니터링을 위해 전국 야생동물센터의 구조ㆍ치료 업무 중 발생된 폐사체의 포장ㆍ수집 및 수송법 표준화를 위해 만들어진 매뉴얼 34

Fig. 3-1-4. 야생동물 구조 또는 수집된 시료정보의 효율적인 파악을 가능하게 하는 전국야생동물 센터 구조ㆍ치료 및 시료관리시스템(예시, IntoWild) 34

Fig. 3-1-5. 전국 각 야생동물구조센터에서 경남야생동물센터로 수집된 시료의 표지(labelling) 방법과 보관. 각 지역 센터 구분을 위해 시료번호 시작부분을 지역고유알파벳으로 지정 표기. 35

Fig. 3-1-6. 전국 야생동물구조센터로 보내진 『야생동물 시료채취 및 수집 매뉴얼』 36

Fig. 3-1-7. 야생동물감염병 검사 및 모니터링을 위해 전국 야생동물센터에서 수집된 시료의 수송협조와 표준수송을 위해 만들어진 시료수송매뉴얼 37

Fig. 3-3-1. 야생동물시료의 SFTS감염의 유전자 분석법에 의한 진단절차 및 양성시료로부터 SFTS바이러스 분리 41

Fig. 3-3-2. 시료확보체계 운영을 통해 수집된 야생동물시료의 SFTS감염 조사분석을 위한 실험실 매뉴얼 42

Fig. 3-3-3. SFTS 바이러스 유전자 진단법의 신뢰도를 높이기 위한 시료 준비과정. 혈청 및 참진드기 pool시료와 함께 internal control로 EGFP RNA첨가, viral RNA추출, Duplex One-Step Real-Time RT-PCR 43

Fig. 3-3-4. SFTS 바이러스 유전자 검출을 위한 S segment에서 특이적인 primer와 probe 위치. A. 분리된 Gangwon/Korea/2012 SFTS 바이러스의 S segment(GenBank accession KF358693) 유전자 지도... 44

Fig. 3-3-5. SFTS 바이러스 유전자의 정확한 진단을 위해 구축한 duplex system에서 internal control로 사용된 EGFP의 특이적인 primer와 probe 위치 45

Fig. 3-3-6. EGFP(internal control)와 SFTSV-S에 특이적인 primer와 probe를 사용, 동시에 검출하는 2채널 duplex system(A). One reaction으로 internal control(EGFP) (B)및 SFTSV-S(C)의 유전자 검출이 동시에 이루어지며,... 47

Fig. 3-3-7. 전국센터로부터 수집된 참진드기의 흡혈ㆍ비흡혈, 종별, 발육단계별 분류 및 동정 49

Fig. 4-1-1. 야생동물의 감염병 모니터링을 위해 관계기관의 유기적 공조ㆍ협력을 통한 시료확보 체계구축 54

Fig. 4-1-2. 야생동물 구조현황, 질병 및 시료정보, 연구결과 등 통합관리시스템구축ㆍ운영을 통한 유기적 공조ㆍ협력 55

Fig. 4-1-3. 2016년 전국야생동물구조센터의 구조 야생동물의 종류별(A), 지역별(B, C) 구조ㆍ신고 접수 빈도율 57

Fig. 4-1-4. 각 센터의 야생동물구조센터의 구조현황 집계시스템으로부터 수집ㆍ확보된 구조정보를 기반으로 작성된 2016 전국구조등록건수의 동물별 현황(전국적으로 100건 미만의 구조동물종은 기타로 구분하여 작성) 57

Fig. 4-1-5. 각 센터별 야생동물구조센터의 구조현황 집계시스템으로부터 수집된 2016 전국 구조 접수발생 등록건수 중 야생동물 질병의 조사대상이 되는 지역별 주요 포유류(고라니, 너구리, 노루) 구조접수 현황 58

Fig. 4-1-6. 2016년 야생동물구조센터의 치료ㆍ조치 후 폐사체(C) 구조ㆍ접수의 월별(A), 지역별(B) 현황 60

Fig. 4-1-7. 2016년 전국 야생동물구조센터의 지역별 구조 후 치료건수 현황(A) 및 폐사체 처리건수의 지역별 (B), 월별(C) 현황 61

Fig. 4-1-8. 효율적인 전국 야생동물 시료채취ㆍ수집ㆍ확보 및 질병진단 과정 61

Fig. 4-1-9. 야생동물 질병검사를 위해 수집ㆍ확보된 고라니(A), 너구리(B), 노루(C), 조류(D)의 사체시료에 대한 지역별 분포현황 63

Fig. 4-1-10. 야생동물 질병검사를 위해 수집ㆍ확보된 고라니(A), 너구리(B), 노루(C), 조류(D)의 혈청시료에 대한 지역별 분포현황 66

Fig. 4-2-1. 2014년(A)/2016년(B) 전국 야생동물구조센터의 동물종별 구조현황 67

Fig. 4-2-2. 2014년/2015년 법정감염병 군별 인체감염 발생현황(그림출처: 질병관리본부의 2015 감염병 감시연보) 68

Fig. 4-2-3. 국내 인수공통전염병의 가축 발병현황(A, 자료출처: 농림축산식품부, 가축전염병 발생월보) 및 유럽에서 발병하는 주요 인수공통전염병의 인체 감염현황(B, 2012 European Food Safety Authority) 69

Fig. 4-3-1. 최근 3년간(2013~2015) 국내 연령별ㆍ성별 중증열성혈소판감소증후군환자 발생현황 및 치사율(자료출처: 2015 감염병 감시연보, 질병관리본부) 74

Fig. 4-3-2. A. 최근 3년간(2013~2015) 국내 지역별 중증열성혈소판감소증후군 환자 및 사망자 발생현황(자료출처: 2015 감염병 감시연보, 질병관리본부). B. 중증열성혈소판감소증후군 환자의 지역적 분포(2013. 4.~2014. 3.) 75

Fig. 4-3-3. 최근 3년간(2013~2015) 국내 월별 중증열성혈소판감소증후군환자 및 사망자 발생현황(자료출처: 2015 감염병 감시연보, 질병관리본부) 76

Fig. 4-3-4. 2011~2012년(A; MIR 0.46%, 55 positive pools/11,856 ticks)과 2013년(B; MIR 0.11%, 9 positive pools/8,313 ticks)에 진드기 수집이 이루진 지역(흑색과 적색으로 표시)및 SFTS 바이러스가 검출된 진드기가 수집된 지역(적색으로 표시) 77

Fig. 4-3-5. 중국내 SFTS 발생지역(그림출처: 중국 질병통제센터, 2011) 78

Fig. 4-3-6. 일본 내 SFTS 발생지역 및 발생빈도(그림출처: 일본NIID, 2016) 79

Fig. 4-4-1. 2016년 SFTSV 감염조사를 위해 수집ㆍ확보된 혈청 검체시료의 동물별(A)ㆍ지역별(B)ㆍ월별(C) 분포현황 83

Fig. 4-4-2. 수집된 혈청시료로부터 SFTS 바이러스 S segment를 target으로 수행한 TaqMan® DuplexOne-Step Real-Time RT-PCR 대표적인 증폭곡선. A. IC(internal control)로 사용한 EGFP 타겟의 증폭곡선패턴... 84

Fig. 4-4-3. 수집된 혈청시료로부터 SFTSV의 S segment를 target으로 수행한 TaqMan® Duplex One-StepReal-Time RT-PCR법에 의해 조사한 결과, 10배씩 희석한 양성대조군의... 85

Fig. 4-4-4. TaqMan® Duplex One-Step Real-Time RT-PCR에 의한 양성의심 혈청검체를 대상으로 수행한One-Step RT-Nested PCR의 대표적인 전기영동 결과. 1차 PCR product; 461bp(위). Nested PCR product;346bp(아래).... 86

Fig. 4-4-5. 전국 야생동물구조센터에서 수집된 포유류 혈청시료(총 349점)의 월별 SFTSV 감염현황(문제가 된 RNA시료는 감염률 산출에서 제외시킴) 87

Fig. 4-4-6. 전국 야생동물구조센터에서 수집된 포유류 혈청시료(총 349점)의 지역별 SFTSV 감염현황(문제가 된 RNA시료는 감염률 산출에서 제외시킴) 88

Fig. 4-4-7. 1차 스크리닝한 양성의심검체 49점의 검체로부터 최종적으로 One-Step RT-Nested PCR에 의해 양성검체로 확진된 시료검체 6점의 CT값 분포도 89

Fig. 4-4-8. 2016년 SFTSV 감염조사를 위해 수집ㆍ확보된 참진드기 시료의 지역별(A)ㆍ월별(B)ㆍ동물별(C) 분포현황 92

Fig. 4-4-9. 2016년 SFTSV 감염조사를 위해 수집ㆍ확보된 참진드기 pool시료의 지역별(A)ㆍ월별(B) 분포현황 94

Fig. 4-4-10. 수집된 혈청시료로부터 SFTSV S segment를 target으로 수행한 TaqMan® Duplex One-StepReal-Time RT-PCR법에 의해 조사한 결과, 10배씩 희석한 양성대조군의... 95

Fig. 4-4-11. TaqMan® Duplex One-Step Real-Time RT-PCR에 의한 양성의심검체를 대상으로 수행한 One-StepRT-Nested PCR의 대표적인 전기영동 결과. 1차 PCR product;... 96

Fig. 4-4-12. 수집된 진드기 총 1,466마리를 pooling, 총 465점의 참진드기 pool시료 중 461점의 검체에 대한 월별 SFTSV 야외최소감염률 현황. Duplex One-Step Real-Time RT-PCR법... 97

Fig. 4-4-13. 수집된 진드기 총 1,466마리를 pooling, 총 465점의 참진드기 pool시료 중 461점의 검체에 대한 지역별 SFTSV 야외최소감염률 현황. Duplex One-Step Real-Time... 99

Fig. 4-4-14. 1차 스크리닝한 양성의심검체 총 149점의 진드기pool 검체로부터 최종적으로 One-Step RT-Nested PCR에 의해 양성검체로 확진된 시료 43개 검체의 CT값 분포 100

Fig. 4-4-15. 한국, 일본, 중국에서 분리된 SFTS 바이러스와 혈청양성시료 및 진드기pool 양성시료의 S segment 일부의 DNA 염기서열 비교 104

Fig. 4-4-16. SFTS 바이러스 S segment의 nucleocapsid 단백질 일부의 DNA 염기서열을 기초로 한 양성검체의 계통발생학적인 관계(neighbor-hood joining) 105

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