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[표지]
연구개발 최종보고서·요약서
제출문
보고서 요약서
요약문
목차
1. 연구개발과제의 개요 7
가. 연구 목표 7
나. 연구 내용 7
다. 기대 효과 7
2. 연구수행내용 및 성과 9
가. ExPathNet 시스템 구축(ExPathNet: a web based tool for gene set enrichment and network analysis of RNA-seq data) 9
(1) 배경 9
(2) ExPathNet 기능 및 특징 10
(3) ExPathNet 시스템 구조 11
(4) ExPathNet 분석 flow 12
나. GENT 2(Gene Expression Database of Normal and Tumor Tissues) 17
(1) 배경 17
(2) GENT 2 특징 19
(3) GENT 2 향후 계획 24
다. 유전자 발현 Fold-change 데이터베이스 구축 25
(1) 배경 25
(2) 데이터 현황 27
(3) Fold-change database 향후 계획 28
라. Gene Signature DB; gene annotation update 28
(1) 배경 28
(2) 데이터 현황 32
(3) Gene signature DB 향후 계획 33
마. 그래프데이터베이스를 활용한 heterogeneous biological data의 네트워크 분석 및 웹서버 개발 33
(1) 배경 33
(2) heterogeneous biological network 데이터 수집 및 가공 36
(3) Graph database 시스템 구축 및 biological network 데이터 연동 42
(4) Graph database 기반 네트워크 데이터의 활용 46
(5) Graph database 향후계획 48
바. 약물 타겟 분석을 위한 barcode-seq 데이터 분석 파이프라인 및 도구 개발 49
(1) 배경 49
(2) 전체적인 Barcas 툴의 flow 50
(3) Barcas 사용법 및 특징 50
(4) 강화된 통계학 기법 54
(5) Barcode-seq 발전계획 57
사. 발아효모 결손균주의 약물작용점 데이터 수집 및 DB화 57
(1) 배경 57
(2) 데이터 현황 59
아. 돌연변이 부위에서의 크로마틴 구조와 DNA 복구 활성화 사이의 연관성 분석 59
자. 수요자 기반 분석 지원 60
3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 64
4. 연구개발성과의 활용 계획 등 65
5. 연구 과정에서 수집한 해외 과학기술 정보 66
가. 비관계형 데이터베이스 데이터베이스 시스템(NoSQL)의 발달 66
나. 생물학적 네트워크 분석을 위한 그래프론 데이터베이스의 활용 증가 67
다. 빅데이터 분석을 위한 새로운 전산 시스템 67
라. 네트워크 기반의 유전자 리스트 기능 분석 67
마. Annotation bias 및 네트워크 연결을 보정한 유전자 세트 분석 68
바. 유전자 리스트 및 발현 데이터 등 종합 분석 시스템 동향 68
사. 유전자 세트 주석 데이터베이스의 확대 및 강화 동향 69
6. 연구개발성과의 보안등급 70
7. 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구시설·장비 현황 70
8. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전 조치 이행 실적 71
1) 기술적 위험 요소 분석 71
2) 안전 관리 대책 71
9. 연구개발과제의 대표적 연구 실적 72
제10장 기타 사항 72
붙임_참고문헌 73
별첨_주관연구기관의 자체평가 의견서(내용없음) 6
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