표제지
목차
ABSTRACT 9
제1장 서론 11
제2장 배경 연구 16
제1절 이론적 배경 16
1. 약물 재창출 16
2. FDA Orange Book 22
제2절 방법론적 배경 25
1. 지식 그래프 25
2. 네트워크 표현 학습 27
3. 개체명 인식 29
제3장 연구 방법론 32
제1절 개요 32
제2절 의약 데이터 수집 및 전처리 35
제3절 의약 지식 그래프 구축 39
제4절 약물 재창출 후보군 탐색 41
제5절 제약기술 생태계 구축 47
제6절 제약기술 생태계 기반 약물 재창출 기회 탐색 49
제4장 사례연구 51
제1절 약물 재창출 후보 식별 52
제2절 약물 재창출 기회 탐색 58
제5장 토의 64
제1절 개요 64
제2절 과학적 근거 분석 66
제6장 결론 79
제1절 요약 및 기대효과 79
제2절 연구의 한계 및 추후 연구 81
참고문헌 83
부록 100
[부록 1] 약물-유전자 연관관계 정의 100
[부록 2] 유전자-질병 연관관계 정의 105
[부록 3] 과학적 근거 분석결과 108
국문초록 112
〈표 2-1〉 실험적 방법 기반의 약물 재창출 사례 17
〈표 2-2〉 약물 기반 계산적 접근법 개요 19
〈표 2-3〉 질병 기반 계산적 접근법 개요 20
〈표 3-1〉 용어 정의 34
〈표 3-2〉 질병 정보 목록 일부 36
〈표 3-3〉 유전자 정보 목록 일부 37
〈표 3-4〉 약물 정보 목록 일부 37
〈표 4-1〉 DisGeNET 내 알츠하이머병 키워드 질병목록 일부 52
〈표 4-2〉 약물 재창출 후보 일부 57
〈표 4-3〉 최종 약물 재창출 후보 상위 30개 61
〈표 5-1〉 상위 30개 약물에 대한 과학적 근거 분석 결과 개요 66
〈표 5-2〉 과학적 근거 분석 결과 : Scy-635 68
〈표 5-3〉 과학적 근거 분석 결과 : Vipadenant 70
〈표 5-4〉 과학적 근거 분석 결과 : Diquafosol 71
〈표 5-5〉 과학적 근거 분석 결과 : TNP-ATP 73
〈표 5-6〉 과학적 근거 분석 결과 : Tonapofylline 74
〈표 5-7〉 과학적 근거 분석 결과 : Trabodenoson 75
〈표 5-8〉 과학적 근거 분석 결과 : Selodenoson 77
〈그림 1-1〉 신약 개발과정과 약물 재창출의 비교 11
〈그림 2-1〉 네트워크 표현 학습의 활용 예 28
〈그림 2-2〉 BERN2의 개념도 31
〈그림 3-1〉 제약기술 생태계 기반 약물 재창출 접근법의 개요 33
〈그림 3-2〉 의약 데이터 수집 및 전처리 개요 35
〈그림 3-3〉 Node2Vec의 random walk 42
〈그림 3-4〉 코사인 유사도 공식 45
〈그림 3-5〉 제약기술 생태계 개요 47
〈그림 4-1〉 알츠하이머병 연관 유전자의 Protein Class 분포 53
〈그림 4-2〉 유전자-질병 연관관계 분류체계 55
〈그림 4-3〉 약물 재창출 후보군 탐색 과정의 개요 (적색 노드 : 질병 / 청색 노드 : 약물) 56
〈그림 4-4〉 알츠하이머 특허 정의 과정 (적색 노드 : 질병, 청색 노드 : 특허) 59