표제지
목차
ABSTRACT 9
제1장 서론 10
제1절 천궁의 특성 10
제2절 식물에서의 고온 스트레스 반응 12
제2장 고온조건에 따른 온도 반응 유전자의 발현 양상 분석 20
제1절 재료 및 방법 20
1. 시험 재료 및 고온 처리 방법 20
2. Total RNA 추출 20
3. cDNA 합성 21
4. 상동성 분석 및 프라이머 디자인 22
5. Real-time PCR 분석 29
6. DEG 분석 및 Gene Ontology enrichment 분석 29
제2절 결과 31
1. qPCR과 DEG 분석을 통한 유전자 발현 양상 분석 31
2. Gene Ontology enrichment 분석 53
제3장 결론 59
참고문헌 61
부록 76
[부록 1] Agarose gel electrophoresis and melting curve analysis of RT-qPCR products 76
[부록 2] Plant materials used for RT-qPCR analysis 79
[부록 3] Genes included in GO terms which are associated with the heat stress response. GO terms indicated in bold text are used for the analysis of〈Figure 18〉. 82
국문초록 92
〈표 1〉 Sequence analysis of genes used for qPCR 23
〈표 2〉 Primer sequence used for qPCR 26
〈그림 1〉 Outline of representative projected responses in plants under heat stress condition. Arrows denote activation or up-regulation, while lines with circle ends indicate inhibition or down-regulation. Dashed gray lines represent the predicted pathways. 18:3 CoA, 18:3... 16
〈그림 2〉 Expression patterns of Cnidium officinale HY5(elongated hypocotyl 5) gene by qPCR and DEG analysis. HT3 and HT5 values of DEG were set as logFC of DEG... 32
〈그림 3〉 Expression patterns of Cnidium officinale GI(gigantea) gene by qPCR and DEG analysis. 33
〈그림 4〉 Expression patterns of Cnidium officinale AGPAT(1-acyl-glycerol-3-phosphate O-acyltransferase) gene by qPCR and DEG analysis. 34
〈그림 5〉 Expression patterns of Cnidium officinale HSP70(heat shock protein 70) gene by qPCR and DEG analysis. 36
〈그림 6〉 Expression patterns of Cnidium officinale PHGPx(phospholipid-hydroper-oxide glutathione peroxidase) gene by qPCR and DEG analysis. 37
〈그림 7〉 Expression patterns of Cnidium officinale CML(calmodulin-like) gene by qPCR and DEG analysis. 38
〈그림 8〉 Expression patterns of Cnidium officinale AGO(argonaute) gene by qPCR and DEG analysis. 40
〈그림 9〉 Expression patterns of Cnidium officinale DELLA gene by qPCR and DEG analysis. 41
〈그림 10〉 Expression patterns of Cnidium officinale MAPKKK(MAPK kinase kinase) gene by qPCR and DEG analysis. 43
〈그림 11〉 Expression patterns of Cnidium officinale CDKA(cyclin-dependent kinase A) gene by qPCR and DEG analysis. 44
〈그림 12〉 Expression patterns of Cnidium officinale sHSP(small HSP) gene by qPCR and DEG analysis. 45
〈그림 13〉 Expression patterns of Cnidium officinale GST(glutathione-S-transferase) gene by qPCR and DEG analysis. 46
〈그림 14〉 Expression patterns of Cnidium officinale SAUR(small auxin-up RNA) gene by qPCR and DEG analysis. 48
〈그림 15〉 Expression patterns of Cnidium officinale WRKY gene by qPCR and DEG analysis. 49
〈그림 16〉 Expression patterns of Cnidium officinale CAR(C2-domain ABA-related protein) gene by qPCR and DEG analysis. 50
〈그림 17〉 List of CO(Cnidium officinale) genes included in〈Figure 1〉. 52
〈그림 18〉 GO enrichment analysis of DEGs in different pairwise comparisons. Indicates GO terms that are related to the heat stress response. HT2, HT3, and HT5 indicated high temperature treatment of 2, 3, and 5℃ higher than the air temperature. 55
〈그림 19〉 Distribution of DEGs among GO terms associated with the heat stress response. 56