표제지
목차
ABSTRACT 8
제1장 서론 11
제2장 전사체 데이터를 이용한 품종 간 차등 스플라이싱 분석 14
제1절 분석 방법 14
1. 데이터 수집 및 전처리 14
2. 품종 간 차등 스플라이싱 유전자 식별 14
3. 품종 그룹 간 공통 차등 스플라이싱 유전자 식별 15
제2절 분석 결과 16
1. 한국 미니돼지와 일반 돼지 간의 차등 스플라이싱 분석 결과 16
2. 한국 미니돼지와 중국 미니돼지 간의 차등 스플라이싱 분석 결과 20
제3장 종 간 전사체 분석을 위한 이종 상동 엑손 탐색 방법론 개발 23
제1절 방법론 개발 23
1. 이종 상동 엑손 탐색 방법론 23
2. 이종 상동 엑손 데이터 생성 24
제2절 방법론 평가 27
1. 이종 상동 엑손 탐색 방법론 평가 방법 27
2. 이종 상동 엑손 탐색 방법론 평가 결과 28
제3절 웹 기반 데이터베이스 구축 30
제4장 전사체 데이터 시각화 라이브러리 구축 32
제1절 시각화 모듈 개발 32
제2절 시각화 라이브러리 구축 33
제5장 결론 36
참고문헌 38
국문초록 43
〈표 2-1〉 한국 미니돼지와 일반 돼지 그룹 간 4가지 조합에 대한 조직별 차등 스플라이싱 유전자 개수 18
〈표 2-2〉 한국 미니돼지와 일반 돼지 그룹 간 조직별 공통 차등 스플라이싱 유전자에 대한 GO 분석 결과 19
〈표 2-3〉 한국 미니돼지와 중국 돼지 그룹 간 2가지 조합에 대한 조직별 차등 스플라이싱 유전자 개수 21
〈표 2-4〉 한국 미니돼지와 중국 돼지 그룹 간 조직별 공통 차등 스플라이싱 유전자에 대한 GO 분석 결과 22
〈표 3-1〉 이종 상동 엑손 데이터 생성을 위해 선정된 포유류 8종 26
〈표 4-1〉 시각화 모듈 종류 및 모듈별 옵션 목록 35
〈그림 3-1〉 이종 상동 엑손 탐색 방법론 모식도 25
〈그림 3-2〉 이종 상동 엑손 방법론 평가 결과 29
〈그림 3-3〉 웹 기반 이종 상동 엑손 데이터베이스 31
〈그림 4-1〉 시각화 라이브러리를 이용한 시각화 결과 34