주민자치에 대한 관심과 중요성이 부각되면서 주민자치센터에 대한 평가도 많이 이루어져 왔다. 하지만 그동안 주민자치센터에 대한 평가는 설문조사 등을 통한 평가지표를 바탕으로 한 연구가 대부분 이었고 자료포락분석 등을 이용한 계량분석은 극소수였다. 자료포락분석을 이용한 연구도 방법론적인 측면에서 몇 가지 문제점을 보이고 있다. 따라서 본 연구는 선행연구의 편중된 연구 경향을 극복하고 방법론적인 한계를 최소화하는 주민자치센터 평가를 실시하였다. 평가를 위한 분석 대상은 서울시 두 자치구의 주민자치센터 35곳이며 분석의 초점은 효율성 측정과 비교이다. 분석방법은 자료포락분석의 규모수익가변의 투입방향모형을 사용하였다. 본 연구는 측정된 효율성을 비모수통계법으로 비교함으로써 자료포락분석을 사용한 기존 연구들보다 분석결과의 타당성을 높였다. 그리고 측정된 효율성 점수와 효율적 프론티어를 각각 비교함으로써 동 단위의 주민자치센터 운영뿐 아니라 구 단위의 주민자치센터 운영에 대해서도 유용한 함의를 도출하였다.