Ac/Ds 전이인자를 동진벼에 형질 전환하여 얻어진 Ac/Ds 삽입 돌연변이 집단에서 dwarf 표현형을 보이는 돌연변이 계통을 선발하고 MutMap으로 dwarf 표현형의 원인이 되는 SNP를 탐색하였다. 돌연변이 계통은 진한 엽색, 단간, 동그란 종자 모양 등의 표현형을 보였다. 이 돌연변이 계통에 야생형 원품종인 동진벼를 교배한 F₁은 동진벼와 유사한 표현형을 보였으며, 후대 F₂ 집단에서는 야생형 개체들과 돌연변이형 개체들이 3:1로 분리하였다. 이를 통해, dwarf 표현형의 원인 유전자는 단일열성유전자임을 알 수 있었고, 이 유전자를 dwF1로 명명하였다. 동진벼와 dwF1 계통을 resequencing한 결과 동진벼와 dwF1 계통간 homogeneous SNP들이 42,386개 추출되었다. MutMap을 수행하기 위하여 dwF1/동진벼 F₂ 집단에서 돌연변이형 100 개체들의 DNA를 pooling하여 resequencing하였다. MutMap 분석 결과 SNP-index가 일관되게 1에 가까이 나타난 영역이 4번 염색체의 23~30 Mbp 영역이었고, 이 영역에서 SNP-index가 1인 SNP들의 annotation 정보를 조사한 결과, Os04g0469800 유전자의 단백질을 코딩하는 CDS 영역에서 아미노산 변화를 일으키는 non-synonymous SNP가 발견되었다. 이 유전자는 brassinosteroids (BRs) 생합성 과정에 관여하는 Cytochrome P450 계열의 단백질을 코딩하는 D11 유전자로 보고된 바 있으며, dwF1 계통에서는 D11 유전자의 4번째 exon에 존재하는 1,783번째 염기인 guanine (G)이 thymine (T)으로 변경되는 돌연변이가 일어났다. 이로 인해서 dwF1 계통에서는 D11이 코딩하는 단백질의 284번째 아미노산인 aspartic acid가 tyrosine으로 변경되는 것으로 분석되었다. dwF1/동진벼 F₂ 집단을 대상으로 bulked segregant analysis (BSA)와 mapping을 수행한 결과, Os04g0469800 유전자(D11) SNP에서 제작한 J10402 마커 유전자형과 표현형이 완전히 일치하여 Os04g0469800 유전자(D11) SNP가 dwF1 계통의 표현형 변이 원인인 것으로 추정하였다. dwF1 유전자는 D11 유전자의 새로운 대립유전자로써 이 유전자의 분자 생물학적 기능 연구와 BRs에 관련된 연구에 유용한 재료로 활용될 수 있을 것이다.A dwarf mutant rice line was selected from an Ac/Ds insertion mutant population and named dwF1. The phenotype of F₁ and F₂ plants derived from a cross between dwF1 and Dongjin indicated that a single recessive gene is responsible for the mutant phenotype, and we named this gene dwF1. Resequencing of the dwF1 line and Dongjin (wild type) revealed 42,386 homozygous single nucleotide polymorphisms (SNPs) between dwF1 line and Dongjin. MutMap analysis was performed by sequencing a DNA pool prepared from 100 mutant type plants in the dwF1/Dongjin F₂ population, and it was found that the dwF1 gene was located in the 23 ~ 30 Mbp region on chromosome 4. In this region, we found a non-synonymous SNP in the Os04g0469800 gene, which was reported as D11 gene encoding a cytochrome P450 family protein involved in the biosynthesis of brassinosteroids (BRs). This SNP was regarded as the causative SNP for the dwF1 phenotype, and the dwF1 gene is a novel allele of D11. We performed mapping of the dwF1 gene with five SNP markers on chromosome 4 with 190 dwF1/Dongjin F₂ plants. The phenotype of F₂ plants was completely co-segregated with genotypes of the J10402 marker, which was developed based on the non-synonymous SNP in the D11 gene. These results will contribute to the study of the molecular biological functions of the D11 gene and BRs.