비만은 우리 건강에 악영향을 미치며, 비만율은 전 세계적으로증가하고 있어 그에 따라 비만을 예방하기 위한 많은 연구들이진행되고 있다. 최근, 비만과 장내미생물 간의 상관관계가 많이 보고되고 있다. 장내미생물생태를 조사하기 위한 샘플은 분변또는 맹장을 선택하고 있는데, 샘플 유형(분변 및 맹장)에 따라미생물생태 결과에 미치는 영향에 대한 일반적인 이해가 없는실정이다. 본 연구에서 마우스를 고지방 식이 섭취로 비만을 유발하여 식이 조절에 따른 분변 및 맹장의 장내미생물생태를 비교했다. 일반 식단(ND) 및 고지방 식단(HFD)은 6주령 ICR 마우스가 12주 간 섭취하도록 하였으며, 분변 및 맹장 샘플로부터 추출한 DNA에서 16S rRNA 유전자를 증폭하여 MiSeq으로시퀀싱했다. α-diversity 결과는 식이 조절과 샘플 종류에 따라장내미생물생태가 크게 영향을 받는다는 것을 보여준다. 분변과맹장의 장내미생물생태의 taxonomic composition의 차이는Family, Genus 수준에서 명확하게 확인되었다. Genus 수준에서Faecalibaculum과 Lactobacillus는 맹장과 분변 샘플에서 각각많은 것으로 나타났다. 일반적으로, 식단의 종류는 식이 조절을적용한 연구 모델에서 샘플의 출처보다 미생물생태 변화에 더상당한 영향을 미친다. 그러나, 장내미생물생태 분석 결과는 식단과 샘플의 종류(분변/맹장)를 모두 고려하여 신중하게 해석되어야 한다.