교육자치권 확대와 함께 학령인구가 감소하고, 교육재정교부금이 증가함에 따라 교육재정의 효율적 운영과 지출구조에 대한 검토 필요성이 어느 때보다 높아지고 있다. 지방교육재정 분석제도는 재정책무성을 이행하고, 재정운영의 효율성과 성과를 평가하기 위해 발전해왔으나, 본 제도의 운영성과와 발전가능성에 대한 연구는 미흡한 실정이다. 본 연구는 머신러닝 비지도학습 접근법인 군집분석을 통해서 지방교육재정 분석제도의 재정지표에 기반한 지방교육청의 재정건전성과 재정효율성 지표분석을 수행했다. 분석결과, 지방교육청의 재정지표별 이질적인 군집화를 발견하였고, 이를 통해 재정분석지표의 간소화, 데이터 기반의 의사결정 등 제도 개선에 관한 정책적, 이론적 의의를 제시하였다.