본고는 벤처기업에 대한 복수의결권 제도의 도입이 연구개발투자에 미칠 수 있는 영향을 예측했다. 실증분석에는 한국기업데이터에 포함된 14,179개 벤처기업 자료가 활용됐으며 추정에는 일반화성향점수매칭 방법을 적용했다. 실증분석 결과, 대주주의 지분변화에 따라 의사결정 권한의 변화가 민감하게 반응할 수 있는 구간에서 대주주의 지분강화는 기업의 연구개발지출에 통계적으로 유의미한 정(+)의 영향을 미치는 것으로 나타났다. 대주주 지분율이 35%인 벤처기업의 경우 복수의결권 도입을 통해 지분율을 45%로 10%p 높였다고 가정한다면, 기업의 연구개발투자는 약 5천만원 증가하는 것으로 추정되었다. 이와 같은 결과는 지분증가에 따라 의사결정 권한이 강화될 수 있는 구간인 30∼50% 대주주 지분율이 존재한다면, 복수의결권 도입은 대주주의 지분강화를 통해 벤처기업의 연구개발지출을 늘릴 수 있다는 것을 의미한다. 본 연구의 분석결과는 벤처기업에 대한 차등의결권 도입을 위한 정부 및 산업계의 노력에 설명을 제공할 수 있다.