본 연구에서는 우리나라의 핵심 산업에 대한 공공 R&D 투자의 포트폴리오 변화가 국가 경제에 미치는 파급효과를 사전적으로 분석해 보고자 한다. 이를 위해 개별 산업 단위의 모의실험이 가능한 연산일반균형 모형을 구축하였다. 특히 본 연구에서는 특정한 산업(철강과 반도체)의 공공 R&D 투자 효과 분석에 초점을 맞추었다는 점에서 기존 연구들과 명확한 차별성을 갖는다. 분석 결과, 철강산업에 대한 공공 R&D 투자비중을 과거보다 증가시켰을 경우, 경제 전반에 긍정적인 영향을 주었다. 반면, 반도체산업에 대한 공공 R&D 투자 비중을 증가시켰을 경우, 경제성장률은 높아지다가 다시 감소하는 추이를 보였다. 이는 반도체산업에 대한 공공 R&D 투자의 최적점이 존재하며, 그 이상의 투자는 오히려 특정 산업에 대한 자원의 불균형적 집중을 유발하여 경제성장에 부정적인 영향을 주게 됨을 의미한다.