목차
[표제지 등]=0,1,2
제출문=0,3,1
요약문=i,4,7
CONTENTS=viii,11,5
제1장 서론=1,16,2
제2장 국내외 기술개발 현황=3,18,1
1.HIV env 및 nef 유전자와 질병진전과의 연관성=3,18,2
2. 질병진정과 연관된 면역 유전학적 연구=4,19,4
제3장 연구개발수행 내용 및 결과=8,23,1
제1절 질병진전 차이에 따른 HIV 분리주의 생물학적 성상 및 env와 nef 유전자의 변이분석=8,23,1
I. LTNP와 RP에서 분리된 HIV-1 env 유전자와 질병진전과의 연관성 분석=8,23,1
1. 방법=8,23,1
가. 대상군 선정=8,23,1
나. HIV 분리 및 배양=8,23,1
(1) HIV 감염자 및 AIDS 환자의 PBMC 분리=8,23,1
(2) 정상인 PBMC의 stimulation=8,23,2
(3) HIV 분리 및 배양=9,24,1
(4) HIV-1 p24 antigen detection ELISA=9,24,1
다. HIV 분리주의 생물학적 표현형 결정=9,24,1
(1) 세포주 및 배양=10,25,1
(2) HIV 분리주의 viral phenotype=10,25,1
라. HIV-1 분리주의 유전학적 분석=10,25,1
(1) Genomic DNA 분리=10,25,1
(2) HIV-1 env 유전자=10,25,1
(가) Polymerase chain reaction=10,25,2
(나) Cloning=11,26,1
(다) Plasmid DNA 분리=11,26,2
(라) 염기서열 결정=12,27,1
(마) 분자유전학적 자료 분석=12,27,2
마. 통계적 분석=13,28,1
2. 결과=13,28,1
가. LTNP와 RP의 HIV-1 분리주의 생물학적 성상 분석=13,28,1
(1) 연구 대상군의 역학적 양상=13,28,1
(2) HIV 분리 및 배양 속도=13,28,8
(3) HIV 분리주의 viral phenotype 분석=21,36,1
(4) HIV 분리율과 질병진전의 관계=21,36,2
(5) LTNP와 RP로부터 분리된 HIV-1 env 유전자의 특성=22,37,1
(6) LTNP와 RP로부터 분리된 HIV-1 분리주의 V3 loop 분석=22,37,4
나. 다양한 HIV-1 subtype 분리주의 viral phenotype (SI/NSI)과 V3 domain 아미노산 서열 분석=25,40,1
(1) 연구대상군의 역학 및 임상=25,40,1
(2) HIV-1 분리주의 viral phenotype=25,40,2
(3) Viral phenotype과 배양속도의 관계=26,41,2
(4) Viral phenotype과 질병진전의 관계=27,42,3
(5) Viral phenotype과 V3 loop의 관계=29,44,4
(6) Subtype G의 longitudinal 분석=32,47,2
다. LTNP와 RP의 HIV-1 분리주의 env 유전자의 변이 분석=33,48,1
(1) 연구 대상군의 역학 및 임상=33,48,8
(2) LTNP와 RP의 HIV-1 env 유전자 sequence 분석=41,56,1
(가) Intrachain disulfide bond=41,56,1
(나) N-glycosylation site=41,56,2
(다) CD4 binding site=43,58,2
(라) CCR5 binding site=44,59,2
(마) V1-V2 부위의 아미노산 분석=46,61,2
(바) V3 loop 아미노산 분석=47,62,7
(3) Env 유전자의 변이 및 phylogenetic 분석=53,68,2
(가) KRA9012 분리주의 변이 및 유연관계=54,69,5
(나) KRA9019 분리주의 변이 및 유연관계=58,73,5
(다) KRB0018 분리주의 변이 및 유연관계=63,78,1
(라) KRB0050 분리주의 변이 및 유연관계=63,78,3
(마) KRB1006 분리주의 변이 및 유연관계=66,81,1
(바) KRB2055 분리주의 변이 및 유연관계=66,81,1
(사) KRB4024 분리주의 변이 및 유연관계=66,81,5
(아) KRB5028 분리주의 변이 및 유연관계=70,85,2
(4) Synonymous와 non-synonymous substitution=72,87,8
II. LTNP와 RP에서 분리된 HIV-1 nef 유전자와 질병진전과의 연관성 분석=80,95,1
1. 방법=80,95,1
가. Primer 제작=80,95,1
나. Polymerase chain reaction과 Cloning=80,95,1
다. Plasmid DNA 추출=80,95,2
라. PEG (Polyethylene Glycol) 침전=81,96,1
마. 염기서열 분석=81,96,1
2. 결과=81,96,1
가. LTNP와 RP로부터 분리된 HIV-1 nef 유전자의 분석=81,96,1
(1) 연구 대상군=81,96,2
(2) LTNP와 RP로부터 분리된 HIV-1 nef 유전자의 특성=83,98,3
나. HIV-1 분리주의 viral phenotype (SI/NSI)에 따른 nef 유전자의 분석=85,100,1
(1) 연구대상군=85,100,1
(2) HIV-1 분리주의 viral phenotype (SI/NSI)에 따른 nef 유전자의 특성=85,100,3
다. LTNP와 RP의 HIV-1 분리주의 nef 유전자의 변이 분석=88,103,1
(1) 연구 대상군의 역학 및 임상=88,103,3
(2) LTNP와 RP의 HIV-1 nef 유전자 sequence 분석=91,106,5
(3) Nef 유전자의 변이 및 phylogenetic 분석=96,111,2
(가) KRA9012 분리주의 변이 및 검사=98,113,1
(나) KRB0018 분리주의 변이 및 유연관계=98,113,8
(다) KRB0050 분리주의 변이 및 유연관계=103,121,1
(라) KRB1006 분리주의 변이 및 유연관계=106,121,3
(마) KRB2055 분리주의 변이 및 유연관계=109,124,1
(바) KRB4024 분리주의 변이 및 유연관계=109,124,2
(사) KRB5028 분리주의 변이 및 유연관계=111,126,1
III. HIV-1 env 및 nef 유전자의 CTL epitope 부위 분석=112,127,1
1. LTNP와 RP로부터 분리된 HIV-1 env 유전자의 CTL epitope 부위 예측 비교=112,127,2
2. Epitope부위의 질병진전에 따른 염기서열의 변화=114,129,8
제2절 AIDS로의 질병진전과 관련된 숙주의 면역ㆍ유전학적 특성=122,137,1
I. HIV 감염자의 질병진전에 따른 CD28 및 HLA-DR 분자의 발현=122,137,1
1. 방법=122,137,1
가. 혈액학적 검사=122,137,1
나. T 세포에서의 CD28분자 및 HLA-DR분자 발현 측정=122,137,1
다. 혈청내 HIV-1 바이러스량 측정=122,137,1
라. 통계적 분석=122,137,2
2. 결과=123,138,1
가. 숙주의 면역학적 인자인 CD28 분자와 HIV감염의 질병진전 양상과의 연관성=123,138,1
나. CD4+ T 세포수준에 의한 CD4+ T 세포와 CD8+ T 세포에서의 CD28 발현량 분석=123,138,2
다. CD4+ T 세포수준에 의한 CD4+ T 세포와 CD8+ T 세포에서의 HLA-DR 발현량 분석=124,139,1
라. T 아세포에서의 CD28분자 및 HLA-DR분자의 발현과 T 세포간의 연관성 분석=124,139,1
마. CD4+ T 세포수 200개/mm³이하인 HIV감염자에서의 HIV바이러스량 분석=124,139,7
바. HIV 감염저항성을 보이는 백인의 고위험군 비감염자에대한 HLA-DR 및 CCR5 발현량 분석=131,146,2
II. 유전학적 특성 - CCR5, CCR2b, SDF 유전자 다형화 분석=133,148,1
1. 방법=133,148,1
가. 대상군=133,148,1
나. 말초혈액으로부터 림프구세포 분리=133,148,1
다. 림프구세포로 부터 DNA 분리=133,148,1
라. CCR5 유전자형 분석=133,148,2
마. SDFI-3'A 유전자형 분석=134,149,1
바. CCR2b-64I 유전자형 분석=134,149,1
사. 통계적 분석=134,149,1
2. 결과=134,149,1
가. 대상군에서의 CCR5 유전자형 분석=134,149,2
나. 대상군에서의 CCR2b-64I와 SDFI-3'A 유전자 빈도=135,150,4
다. LTNP 와 RP의 SDFI-3'A와 CCR2b-64I 유전자 빈도=138,153,1
라. CCR2b-64I 와 SDFI-3'A 대립유전자가 HIV감염자의 질병진전에 미치는 영향=138,153,3
마. CCR2b-64I와 SDFI-3'A 대립유전자가 CD4+ T 세포수 200개/mm³ 이후의 생존들에 미치는 영향=141,156,2
III. 숙주의 면역유전학적 특성이 HIV 질병진전에 미치는 영향=143,158,1
1. 방법=143,158,1
가. 국내 HIV 감염자 및 AIDS 환자 대상군 선정=143,158,1
나. 실험대상 및 DNA추출=143,158,1
다. HLA 형별=143,158,1
(1) 혈청학적방법에 의한 Class I 형별 [87]=143,158,1
(2) DNA 형별법에 의한 class I 형별 [88]=143,158,1
(3) HLA class II 형별 [89-92]=143,158,1
라. 항원처리유전자 (TAP, LMP, HLA-DM) 형별=144,159,1
(1) PCR-SSCP에 의한 TAP, DM유전자 형별분석 [93,94]=144,159,1
(2) PCR-ARMS 방법에 의한 TAP2 의 형별분석[95]=144,159,1
(3) PCR-RFLP방법에 의한 LMP유전자의 형별분석=144,159,1
마. Cytokine 유전자의 다양성 분석[96-98]=144,159,1
(1) PCR-RFLP법에 의한 Cytokne유전자의 다양성 구분=144,159,1
(2) PCR-SSCP를 이용한 IL-10 promoter 부위 다양성 분석=145,160,1
(3) IL-4 promoter (-590) 와 IL-4 receptor (1092) 대립유전자 형별=145,160,1
(4) IFN-γ intron I 부위의 microsatellite (CA 반복) 대립유전자 형별=145,160,1
바. 통계분석=145,160,2
2. 결과=147,162,1
가. HLA class I 에서의 정상인과 HIV 감염자와의 연관성=147,162,1
나. HIV class II 에서의 정상인과 HIV 감염자와의 연관성=147,162,1
다. 정상인에서의 항원처리유전자 형별=147,162,1
라. HIV 감염자에서의 항원처리유전자 형별=147,162,1
마. HIV 감염과 질병 진전에 항원처리유전자의 유전자형이 미치는 영향 조사=147,162,3
바. HIV 감염과 IL-10 유전자의 유전자형이 미치는 영향 조사=149,164,2
사. HIV 감염과 IL-4 유전자의 유전자형이 미치는 영향 조사=150,165,1
아. HIV 감염과 INF-γ 유전자의 유전자형이 미치는 영향 조사=150,165,1
자. HIV 감염과 TNF 유전자와 유전자형이 미치는 영향 조사=150,165,3
제4장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도=153,168,5
제5장 연구개발결과의 활용계획=158,173,1
제6장 참고문헌=159,174,7