표제지
목차
Ⅰ. 연구결과 요약문 5
연구결과최종보고서 요약문 5
Summary 6
Ⅱ. 학술연구개발용역과제 연구결과 7
제1장 최종 목표 7
1.1. 목표 7
1.2. 목표달성도 및 관련분야에 대한 기여도 9
제2장 국내외 기술 현황 10
제3장 최종 연구 내용 및 방법 11
3.1. 과제내용 11
3.2. 추진방법 12
3.3. 추진일정(세부과제별 추진 일정을 기술) 14
3.4. 과제종료시 최종결과보고서 등 제출 15
3.5. 기대효과 및 활용방안 16
제4장 최종 연구 결과 17
제5장 연구결과 고찰 및 결론 30
제6장 연구성과 및 활용계획 32
6.1. 연구성과 32
6.2. 활용계획(과제 종료 후) 33
제7장 연구용역과제 진행과정에서 수집한 해외과학기술 정보 34
제8장 기타 중요변경사항 35
제9장 연구비 사용 내역 및 연구원 분담표 36
9.1. 연구비 사용 내역(작성일까지 사용내역 작성) 36
9.2. 연구분담표 37
제10장 참고문헌 37
제11장 첨부서류 38
첨부-1. 신규 가와사끼병 환자 임상정보 및 시료 수집 IRB 승인서 39
첨부-2. 세포주 기탁, 시료보존기한 연장요청 & SNP chip data기탁 IRB 신청서 41
첨부-3. 참여병원 IRB 신청서 (고려대병원, 이대목동병원, 대전성모병원 IRB) 47
첨부-4. 가와사끼병 표준 임상정보 수집 양식에 대한 한국가와사끼병연구회 승인서 52
첨부-5. 가와사끼병 환자 혈액에서 혈장(plasma)과 genomic DNA 분리 표준 protocol 55
첨부-6. 가와사끼병 Omni1-Quad BeadChip QC Report 57
첨부-7. 한국가와사끼병 유전연구컨소시엄에 대한 Korean Circulation Journal 투고논문 69
첨부-8. 기관 개인정보취급 관리방안 - 오믹스 연구용 질환패널 자원확보 사업 79
표 1. 가와사끼병 임상 역학 자료 분류 20
표 2. 가와사끼병 임상 역학 자료 코드북 (database용 파일) 20
표 3. 가와사끼병 시료 수집 현황(2015년 5월 19일 집계 현황) 22
표 4. 보관중인 세포주에 대한 세포배양후 생존율 및 분주 가능성 조사. 23
표 5/표 6. 세포주에서 분리된 질병관리본부 기탁용 46건의 genomic DNA 시료 정보 23
표 6/표 7. 생산된 302건의 SNP chip data에서 임상 성별과 SNP성별 간의 오류 시료 6건 목록 25
표 7/표 8. 다양한 분석 방법을 사용하여 가와사끼병 감수성(susceptibility) 유전자 발굴을 위한 반복성 검정용 후보 SNP 목록. 25
표 8/표 9. complete KD 시료를 이용한 유전연관성 분석 (249 complete KD vs. 1000 controls) 26
표 9/표 10. male KD 특이적으로 작용하는 유전변이 발굴을 위한 유전연관성 분석 (249 complete KD vs. 1000 controls) 26
표 10/표 11. female KD 특이적으로 작용하는 유전변이 발굴을 위한 유전연관성 분석 (249 complete KD vs. 1000 controls) 27
표 11/표 12. IVIG 저항성 원인 유전변이 발굴을 위한 유전연관성 분석 (98 IVIG non-responder KD vs. 196 responder KD) 27
표 12/표 13. 재발하는 KD data를 이용한 가와사끼 원인 유전변이 발굴을 위한 유전연관성 분석 (37 recurrent KD vs. 1,000 controls) 28
표 13/표 14. 가족력이 있거나 재발하는 KD data를 이용한 가와사끼 원인 유전변이 발굴을 위한 유전연관성 분석 (51 family history or recurrence KD vs. 1,000 controls) 28
그림 1. 기존 제1차 및 제2차 (한국 가와사끼병 유전연구 컨소시엄)의 참여기관 및 시료 수집 실적. 17
그림 2. 본 연구과제 수행을 위한 제3차 (한국 가와사끼병 유전연구 컨소시엄) 참여 기관 및 참여자 구성도. 18
그림 3. 가와사끼병 표준 임상정보 수집 양식 (word file 양식). 19
그림 4. 가와사끼병 연구를 위한 표준 임상정보 수집 및 유전체 시료 수집 체계 구축. 21
그림 1. Picogreen을 이용한 DNA 농도측정의 원리 (모식도) 57
그림 2. KD 샘플 DNA 전기영동 결과 (DNA Quality 확인) 58
그림 3. Staining, Extension Controls 59
그림 4. Target Removal, Hybridization Controls 60
그림 5. Stringencyl, Non-Specific Binding Controls 61
그림 6. Non-polymorphic Controls 62
그림 7. 유전형이 명확히 구분되지 않는 SNP 유형 63
그림 8. 유전형이 명확히 구분되는 SNP 유형 64
첨부-7. 한국가와사끼병 유전연구컨소시엄에 대한 Korean Circulation Journal 투고논문 76
Fig. 1. Participating institutes in KKDGC and the numbers of sample collected. A total of 517 and 681 KD case samples were collected during the first (May 2008~Feb. 2010) and second (April 2012~Sep. 2014)... 76
Fig. 2. Work process of KKDGC to collect the clinical data and genomic DNA samples. Each patient’s blood sample and clinical data were collected using standard protocol. 76
Fig. 3. Clinical data collection sheet for KD. A total of 41 clinical variables were collected per patient. 77
Fig. 4. Cell proliferation assay after in vitro immunoglobulin (IG) treatment in KD patient-derived B cell lines (A), macrophage-like cell line (U937) and neutrophil-like cell (HL60). Each cell was treated with various... 78
Fig. 5. Overview of GWAS performed by KKDGC. The results of GWAS were published. 78