제1장 미생물학으로의 초대11.1 미생물의 특징31.2 초기 미생물학 연구41. 현미경의 발명42. 질병의 병인론과 생명의 자연발생설43. 감염 조절방법들61.3 특수 미생물학 분야71. 전염병 예방법72. 바이러스의 발견73. 항생물질74. 미생물 유전학과 분자생물학의 발달81.4 미생물 분류91.5 최신 미생물학과 생명공학과의 관계121. 생명공학122. 미생물 생명공학의 발전123. 미생물에 의한 환경정화12● 요약13● 정리문제13제2장 미생물 계통분류학152.1 초기 지구와 생명의 기원161. 지구 형성과 초기 지구상 생명체162. 세포 생명체의 기원173. 초기 생명체의 다양화174. 진핵생물의 출현192.2 미생물의 진화과정201. 진화과정202. 계통 분석203. 계통 분석방법212.3 미생물 분류체계231. 종의 개념232. 분류와 명명법24● 요약25● 정리문제25제3장 세균의 다양성 273.1 세균의 특성28세균의 일반적인 특성과 다양한 계통 발생293.2 산소발생형 광영양세균 시아노박테리아301. 시아노박테리아 세포구조312. 단세포, 실 모양 및 군체의 시아노박테리아313. 다세포성324. 시아노박테리아 군집성333.3 그람 양성균331. Firmicutes332. 비포자형성 Firmicutes343. 방선균373.4 그람 음성균 프로테오박테리아401. 프로테오박테리아들의 다양한 대사과정402. a-프로테오박테리아413. b-프로테오박테리아444. g-프로테오박테리아455. d?-프로테오박테리아 486. e?-프로테오박테리아493.5 초기에 갈라진 그람 음성균501. Acidobacteria502. Bacteroidetes503. Chlorobi514. Fusobacteria515. Nitrospirae513.6 스피로헤타521. 스피로헤타의 다양성522. 스피로헤타의 세포구조523.7 클라미디아531. 세포 내 기생하는 클라미디아532. Planctomycetes533. Verrucomicrobia54● 요약54● 정리문제54제4장 고균 다양성554.1 고균의 계통학적 및 대사적 다양성561. 고균의 세포구조와 대사과정572. 고균 유전체 구조와 조절593. 고균의 계통수604.2 Crenarchaeota621. 서식처와 에너지 대사과정622. Sulfolobales633. Desulfurococcales634. 중온성 Crenarchaeota645. 저온성 Crenarchaeota654.3 Thaumarchaeota65암모니아를 산화하는 타움고균654.4 Euryarchaeota661. 메탄생성경로662. 메탄생성균의 세포 형태673. 메탄생성균의 혐기성 서식처684. 메탄생성 과정684.5 호염성 Euryarchaeota711. 호염성 고균의 특징712. 상이한 고염분 서식처에 따른 호염 고균의 종류733. 레티날에 의한 광종속영양734.6 ?극한의 Euryarchaeota와 초기에 분기한 고균 집단741. Thermococcales742. Archaeoglobus는 역-메탄생성 과정753. Thermoplasmatales754. Nanoarchaeota765. 초기에 분기된 그룹76● 요약77● 정리문제77제5장 진핵미생물의 다양성795.1 진핵미생물의 다양성801. 후방편모생물: 동물과 균류802. 조류의 진화825.2 원생생물821. 중복편모충류와 부기저체류822. 유글레나충류823. 피하낭류834. 부등편모조류855. Cercozoan과 Radiolarian866. Amoebozoa865.3 균류871. 균류의 특성872. 균류의 생식과 계통발생895.4 조류931. 1차 조류932. 2차 조류: 규조류와 켈프95● 요약98● 정리문제98제6장 바이러스 다양성996.1 바이러스란 무엇인가?1001. 숙주세포1012. 숙주세포 DNA에 끼어 들어가는 바이러스 유전체1023. 바이러스의 특성1024. 병원체로서의 바이러스1026.2 바이러스 구조1031. 대칭구조의 비리온1032. 비대칭 구조의 비리온1073. 바이로이드와 프라이온1076.3 바이러스 유전체와 바이러스 분류1081. 바이러스 유전체1082. ICTV 바이러스 분류1083. Baltimore 바이러스 분류법1094. 감염하는 숙주에 따른 분류1115. RNA 유전체에 의한 분류1116. DNA 유전체에 의한 분류1127. 신종 및 변종 바이러스1136.4 바이러스 복제 및 증식1141. 바이러스의 생활사 단계1142. 박테리오파지의 생활사1143. 파지의 용원성1164. 동물바이러스의 복제과정1195. 잠복성 바이러스 감염1236. 레트로바이러스1237. 동물바이러스 감염 결과1256.5 식물바이러스 복제주기1251. 침투1252. 감염1263. DNA Pararetrovirus1266.6 바이러스 배양법1271. 배양방법의 발달과정1272. 세포배양의 종류1273. 세포독성효과1276.7 유사 바이러스1281. 위성 바이러스1282. D형 간염 바이러스1283. 바이로이드1284. 프라이온1296.8 발암 바이러스1291. 인체 발암 바이러스1292. 발암 바이러스는 어떻게 암을 일으키는가?1303. 발암유전자130● 요약131● 정리문제131제7장 미생물 관찰1337.1 미생물 관찰하기1357.2 빛의 특성1367.3 광학현미경1401. 복합현미경1412. 형광현미경1433. 암시야 현미경1457.4 전자현미경1451. 전자현미경1462. 초저온 전자현미경1463. 공초점 현미경법1477.5 광학현미경 사용기술1481. 시료 준비1482. 염색 과정148● 요약150● 정리문제150제8장 미생물 세포구조와 기능1518.1?원핵세포의 특징1521. 원핵세포의 범위1522. 원핵세포의 모양과 크기1528.2?원핵세포 구조와 기능1541. 세포막과 수송1542. 세균 세포벽1583. 고균 세포벽1618.3?세균세포의 기타 구조물1621. 세포 표면구조물1622. 세포 봉입체1633. 가스소포체(기낭)1644. 내생포자1648.4?세포의 이동 방식1651. 편모운동1652. 활주운동1663. 미생물의 주성1678.5 진핵미생물의 구조와 세포소기관1671. 세포막의 구성요소 및 특징1672. 물질 수송1673. 세포소기관1694. 세포골격과 운동기관170● 요약170● 정리문제170제9장 미생물의 대사와 생장1719.1 미생물의 영양1721. 영양소1722. 미생물의 생체량1733. 에너지 획득과정1744. 에너지 저장1759.2 영양소 섭취 방식1751. 촉진 확산1762. 능동수송1773. ABC 수송체계1784. 시데로포어1795. 작용기 전달수송1799.3 미생물 배양1791. 배양배지의 종류1792. 세균의 영양요구1803. 실험실 세균배양1804. 환경시료에서의 미생물 검출1819.4 미생물 생장 측정1849.5 미생물 생장주기1871. 기하급수적 생장1872. 세대기간1873. 정치배양에서의 생장단계1884. 연속배양1909.6 생체막(바이오필름)1909.7 세균의 세포분화1921. 세균의 내생포자1922. 시아노박테리아 분화1933. 자실체 분화1944. 방선균 분화194● 요약195● 정리문제195제10장 미생물의 생장과 환경19710.1 미생물 생장과 환경적 한계19810.2 온도와 압력1981. 생장속도와 온도1992. 생장온도에 따른 미생물 분류20010.3 삼투압20110.4 pH 농도2021. 최적 pH, 최고 pH 그리고 최소 pH2022. pH 범위에 따른 미생물 분류202?3. pH 항상성20410.5 산소에 의한 영향2051. 세포 내 산소의 장단점2052. 호기성과 혐기성2063. 혐기성균과 조건부 혐기성 미생물2074. 혐기성균의 실험실 배양방법2085. 수분과 압력20810.6 영양소 결핍과 기아에서의 미생물 반응208기아에 대한 반응20810.7 미생물 생장제어2091. 물리적 제어2092. 화학적 제어210● 요약211● 정리문제211제11장 미생물 유전학21311.1 유전물질의 구조와 기능2151. 유전자형과 표현형2162. DNA와 염색체2163. DNA 복제 2174. RNA와 단백질 합성22011.2 세균의 유전자 발현 조절2221. 전사 전 조절2222. 전사 후 조절22511.3 돌연변이2251. 돌연변이 종류2252. 돌연변이원2263. 돌연변이체 탐지 2274. 발암원 탐지22811.4 유전물질의 전이와 재조합2281. 세균의 형질전환2282. 유전물질 접합2293. 세균에서의 형질도입2294. 플라스미드와 트랜스포존22911.5 생명공학2301. 재조합 DNA 기술2302. 재조합 DNA 제조과정23011.6 생명공학 도구2311. 선택2312. 돌연변이2313. 제한효소2314. 벡터2315. PCR233● 요약233● 정리문제233제12장 미생물의 에너지 및 중심대사23512.1 미생물의 에너지 획득과정2371. 미생물의 에너지 사용현황2382. 생물 에너지학23812.2 화학반응에서의 자유에너지 변화23912.3 에너지 수송체와 전자수송2401. ATP2402. NADH2413. FADH2 24312.4 효소2431. 효소의 특성2432. 효소반응24412.5 미생물의 해당과정2441. 분해되는 기질2442. 혐기성 대사과정24712.6 호기성 호흡: TCA 회로2521. 아세틸-CoA2522. TCA 회로2533. 산화적 인산화과정2534. 글리옥실레이트(glyoxylate) 우회경로2545. TCA 회로 중간산물과 아미노산 합성25412.7 난분해성 물질의 분해과정2541. 호기성 벤젠 분해과정2552. 혐기성 벤젠 분해과정2563. 기타 거대분자의 분해과정256● 요약258● 정리문제258제13장 미생물의 에너지 획득25913.1 전자전달계2601. 전자공여체와 전자수용체2602. 에너지 저장2613. 전자전달계는 막에 있다2631 3.2 양성자구동력2641. 전자전달계의 양성자 펌프2642. 양성자구동력의 구성요소2653. 양성자구동력이 하는 일2651 3.3 호기성 세균의 전자전달계2661. 보조인자가 하는 일2662. 산화환원효소 단백질 복합체2673. ATP 합성효소2704. Na+ 펌프27113.4 혐기성 호흡2711. 질소의 산화형태2722. 황의 산화형태2723. 이화적 금속환원2731 3.5 무기영양과정과 메탄합성과정2731. 철의 산화과정2742. 질소의 산화과정2743. 황과 금속 산화과정2754. 수소영양세균2765. 메탄생성과정2766. 메틸영양과정2761 3.6 광영양과정2761. 박테리오로돕신2772. 엽록소2783. 광계 I과 II280● 요약284● 정리문제284제14장 생합성28514.1 생합성 개론2861. 생합성에 필요한 기질2872. 생합성에 필요한 에너지28714.2 CO2 고정: 캘빈 회로2891. 캘빈 회로 개요2892. Ribulose 1,5-Bisphosphate에 CO2 결합2903. Rubisco 작용기작2914. Ribulose 1,5-Bisphosphate의 재생2915. 캘빈 회로 조절29314.3 다양한 CO2 고정경로2931. 환원성 또는 역-TCA 회로2932. 아세틸-CoA 경로2943. 3-Hydroxypropionate 회로29514.4 지방산과 폴리케타이트 생합성2961. 지방산 합성2962. 불포화 과정2973. 지방산 합성 조절2974. 폴리케타이드 항생제29814.5 질소고정2981. 질소 동화작용2982. 질소고정과정3003. 질소고정에 관련된 분자적인 조절기작30314.6 아미노산과 염기의 생합성3031. 아미노산 합성3032. NH4+의 동화과정3043. 아미노산 생합성과정3044. 퓨린과 피리미딘 합성3055. 펩타이드성 항생제 합성307● 요약309● 정리문제309제15장 인체 내 미생물과 선천성 면역31115.1 인체 마이크로바이옴3121. 마이크로바이옴 획득3122. 피부3133. 눈3144. 구강과 비강3145. 호흡기관3156. 비뇨생식기관3157. 위3158. 장내31515.2 미생물균총의 이로움과 해로움3161. 이로움3162. 해로움3173. 비만의 원인3175.3 면역계3181. 선천성 면역과 적응면역3182. 감염과 질병3183. 면역세포3184. 림프기관32115.4 감염에 대한 물리적 및 화학적 방어3221. 물리적 장벽3222. 화학적 장벽32415.5 선천성 면역3241. 침입자 감지하기3242. I형 인터페론3263. 급성 염증3264. 식균세포3285. 식균세포의 살균과정3296. 자가파지와 세포 내 병원균3297. 만성 염증33015.6 보체와 열3311. 보체 기능3312. 보체의 다른 역할3323. 급성단계에서의 반응3324. 열333● 요약333● 정리문제333제16장 적응면역 반응33516.1 적응면역의 개요3361. 체액성 면역과 세포-매개 면역3362. 면역원성3383. 면역반응의 일반 특성3384. 항원과 합텐3401 6.2 항체 구조 및 다양성3401. 항체의 면역침강3412. 항체의 세부구조3413. 항체의 다양성3434. 항체의 기능과 구조3435. 1차 및 2차 항체반응3456. 클론선택3467. 항체 유전자 발현과정3481 6.3 세포성 면역반응3511. T 세포 활성화3512. 항원제시과정3523. T 세포 수용체3534. 흉선의 기능3545. TH0 세포의 활성화3556. TFH 세포 기능3567. TH1 세포의 기능3568. TH17 세포의 기능3579. 면역반응의 균형자 역할35710. 초항원35811. 적응면역을 회피하는 미생물35912. 대식세포의 활성화3591 6.4 적응면역에서의 보체3601. 보체 활성화 조절3612. 보체 구성원의 다른 역할3611 6.5 장내 점막면역3611. 장 면역계3612. 피아간 식별3633. 장 면역계의 구획 형성3634. ?장 면역과 인체건강에 영향을 미치는 마이크로바이옴3631 6.6 면역 백신주사3641. 백신3642. 집단면역3643. 백신과 면역력3644. 백신 안정성3651 6.7 과민증과 자가면역3651. 즉시형 과민증3662. 지연성 과민반응3663. 자가면역366● 요약367● 정리문제367제17장 미생물의 발병기작36917.1 숙주-병원체 관계3701. 병원체 개념3702. 발병기작 용어3713. 정상균총3724. 감염성 질병의 면역병인론37217.2 병독성 인자3731. 병독성 유전자 식별법3732. 병원성 아일랜드(유전자군)3733. 수평적 유전자 전이에 의한 병원균체37417.3 미생물의 부착3741. 필리3752. 필리구조가 아닌 어데신3773. 생체막(바이오필름)과 감염37817.4 미생물 독소3781. 미생물 외독소3782. 숙주 세포막을 파괴하는 세포독소3803. AB 단위체로 구성된 외독소3804. 엔테로독소3815. 내독소38217.5 독소 단백질의 위치3831. II형 단백질 분비와 IV형 필리 조합3832. III형 분비기작 3833. IV형 분비계38517.6 숙주 내 미생물3851. 병원균 위치인식3852. 세균의 세포 밖 면역회피3863. 숙주세포 내 병원균3864. 감염에 대한 병원균의 인지능력387● 요약387● 정리문제387제18장 임상미생물학과 역학38918.1 임상미생물학3901. 미생물을 동정하는 데 시간이 필요하다3902. 시료수집과 처리과정3913. 생장배지 및 배양3924. 생물학적 안전성 고려사항39218.2 최신 병원균 동정법3931. 전통적 진단 접근법3932. 신속 동정기술3933. 기타 동정법3984. 현장 신속 진단법3985. 메타지놈 진단법39918.3 역학의 기본 원리399풍토병, 유행병, 또는 대유행 감염병39918.4 신종 질병의 탐지4011. 신·변종 병원균4012. 신종 질병 추적402● 요약403● 정리문제403제19장 항미생물제제 및 치료요법40519.1 항미생물 치료의 원리40619.2 항세균제4071. 항균제 발견의 역사4072. 선택적 독성력4083. 항균제 항균활성4094. 항균활성 측정법40919.3 항생제 작용기작4101. 세포벽 합성 억제4102. 병원균 세포막 파괴 항생제4143. 핵산 억제제4144. 단백질 합성 억제제41519.4 항진균제4161. Polyene 계열 항진균제4162. Azole 계열 항진균제4163. Allylamine 계열 항진균제4164. 기타 항진균제41719.5 항바이러스제4171. 바이러스 언코팅 억제제4172. DNA 합성 억제제4183. 항-HIV 억제제4184. 새로운 항바이러스제제41919.6 항생제 내성4201. 항생제 내성균 생성4212. 새로운 항균제의 모습421● 요약422● 정리문제422제20장 미생물 생태학42320.1 최신 미생물 생태학의 방법4251. 환경 시료4252. 메타지놈 시퀀싱과 어셈블리42620.2 기능성 환경학4291. 탄소 동화와 분해과정 4292. 산소와 다른 전자 수용체4303. 온도, 염도, pH43020.3 공생4301. 상리공생4302. 공생은 다양한 수준의 협력과 기생을 포함한다43020.4 해양 및 수생 미생물4311. 해수 서식처4312. 배양되지 않는 균의 배양4313. 해수의 메타지놈4324. 해수 군집 속의 플랑크톤4325. 담수의 미생물 군집43320.5 토양 미생물4341. 토양 미생물학4342. 리그닌 분해4343. 근권4344. 균근43520.6 식물 속의 미생물 군집4371. 식물 내부 기생 미생물4372. 뿌리혹박테리아4373. 식물 병원균437● 요약438● 정리문제438참고문헌439부록: 마이크로바이옴에 대한 이해440찾아보기 445