표제지
목차
가. 서론 2
1. 연구의 필요성 2
2. 국내ㆍ외 현황 5
나. 연구의 내용 및 범위 8
1. 연구목표 8
2. 연구 내용 9
3. 당해연도 연구 추진 계획 10
다. 국내ㆍ외 DNA 바코드 데이터베이스 현황 11
라. DNA 바코드 마커의 유효성 검증 19
마. 표준 법생물(동물) DNA 감식기법 메뉴얼 작성 50
1. DNA 추출 및 유전자 증폭 51
2. 염기서열 정보를 이용한 종 판별 54
3. DNA 바코드 비교 분석 통한 종 판별 55
바. 사업비 집행 59
사. 참고문헌 61
[부록] 62
표 1/표 2. 해외 주요 유전자 데이터 센터 6
표 2/표 3. 국내 대표 생물정보센터 7
표 3/표 4. DNA 바코딩에 활용되는 생물군별 주요 유전자 마커(Purty and Chatterjee 2016) 12
표 4/표 5. 종내/종간 변이율 중첩구간에서 확인되는 대표종 23
표 5/표 6. COI 바코드 염기서열을 이용한 매목의 종내/종간 변이율 25
표 6/표 7. COI 바코드 염기서열을 이용한 잉어과(잉어목)의 종내/종간 변이율 30
표 7/표 8. COI 바코드 염기서열을 이용한 십각목의 종내/종간 변이율 39
표 8/표 9. COI 바코드 염기서열을 이용한 십각목의 종내/종간 변이율 46
표 9/표 10. COI universal primer 정보 52
표 10/표 11. 종 식별마커 COI증폭을 위한 PCR 반응액 조성 52
표 11/표 12. 종 식별마커 COI 증폭을 위한 PCR 반응 조건 52
그림 1. DNA Barcoding 의 기본 원리 3
그림 2. BOLD(오른쪽)와 iBOL(왼쪽)의 메인 페이지 5
그림 3. 연구추진체계 8
그림 4. 당해연도 연구체계 10
그림 5. 생물분류군 준위별 적합한 유전자 마커(Hwang and Kim 1999) 12
그림 6. BOLD system 웹페이지 13
그림 7. UNITE 데이터베이스 웹사이트 15
그림 8. Diat.barcode 데이터베이스 웹사이트 16
그림 9. KBOL 데이터베이스 메인페이지 17
그림 10. 국립생물자원관 한반도의 생물다양성 데이터베이스 17
그림 11. 한반도의 생물다양성 데이터베이스 상세페이지 18
그림 12. 바코드 염기서열 분석 개요 20
그림 12. 칠레에 서식하는 조류에 대한 barcode gap 분석 21
그림 13. 한반도 조류의 DNA 바코드 분석 결과 22
그림 15. 매목의 종내/종간 유전적 거리(p-distance)에 대한 산포도 26
그림 16. 매목의 종내/종간 유전적 거리(p-distance)에 대한 바이올린 플롯 26
그림 17. 매목 COI 유전자의 종내 변이율 모식도 27
그림 18. Capoeta의 genetic distance plots(A: barcode gap, B: 종내/종간 변이율의 범위) 28
그림 19. Tanakia 속의 종내/종간 변이율(A: COI; B: Cyt b) 29
그림 20. 잉어과의 종내/종간 유전적 거리(p-distance)에 대한 산포도 34
그림 21. 잉어과의 종내/종간 유전적 거리(p-distance)에 대한 바이올린 플롯 34
그림 22. 잉어과 COI 유전자의 종내 변이율 모식도 35
그림 23. 북해에 서식하는 요각류의 genetic distance plots(A: barcode gap, B: 종내/종간 변이율의 상관관계) 36
그림 24. 한반도 요각류의 분류학적 준위별 유전적 거리 평균값(K2P) 37
그림 25. 한반도 요각류의 분류학적 준위별 유전적 거리 37
그림 26. 한반도 요각류 COI 유전자의 distance matrix 37
그림 27. 십각목의 종내/종간 유전적 거리(p-distance) 41
그림 28. 십각목의 종내/종간 유전적 거리(p-distance) 41
그림 29. 십각목 COI 유전자의 종내 변이율 모식도 42
그림 30. 거미류의 barcode gap 분석 결과(A: Lycosidae (늑대거미과), B: Salticidae(깡충거미과)) 43
그림 31. COI 유전자 기반의 Ganthela의 계통유연관계 및 species delimitation 분석 결과 44
그림 32. Ganthela 그룹의 barcode gap(A: K2P distance, B: P-distance) 44
그림 33. 거미목의 종내/종간 유전적 거리(p-distance)에 대한 산포도 48
그림 34. 거미목의 종내/종간 유전적 거리(p-distance)에 대한 바이올린 플롯 48
그림 35. 거미목 COI 유전자의 종내 변이율 모식도 49
그림 36. 염기서열 유사도 분석 절차 54
그림 37. 염기서열 정렬 프로그램 55
그림 38. Mega-X를 이용한 유전적 거리 분석 (a) 방법 및 (b) 결과 56
그림 39. DNA 바코드 갭 분석에 대한 결과 해석 57
그림 1. DNA 바코드 보유 DB 현황과 정보 공유 체계 구축을 위한 설문지 62
그림 2. 설문 참여 협조 요청 메일 63