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[표지]
연구결과 요약문
목차
1. 연구개발과제의 개요 4
2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 4
1) RHD 및 RHCE 유전자형 분석을 위한 Target enrichment method 개발 4
가. Probe hybridization을 이용한 target enrichment 4
나. long range PCR 기반 target enrichment 4
2) RHD 및 RHCE 유전자형 염기서열분석법 선정 7
Pacbio Sequel II 플랫폼에 최적화된 library 제작 및 시퀀싱 7
Barcoded SMRTbell adapter를 이용한 라이브러리 제작 방법 수립 7
3) RHD 및 RHCE 유전자형 분석 알고리즘 개발 8
Genotyping 파이프라인 확립 및 발견된 allele별 SNP로부터 샘플별로 2 종류의 일배체형 확인 8
4) 헌혈 혈액 폐기용 분절 샘플을 이용하여 파이프라인 검증 및 실험 결과 확인 8
Pacbio Sequel II 장비를 이용해 long-read NGS 를 시행함 8
샘플 별 Long-read NGS 결과 metrics 8
Long-read NGS에 의해 생성된 HIFI read의 downstream 분석 과정 8
Pacbio long-read NGS에 의한 관심부위(RHD~RHCE 부위)의 커버리지 9
샘플 별 면역학적 표현형 검사결과로부터 추론된 유전자형과 일치 여부 9
시퀀싱 결과로 확인된 샘플별 및 대립유전자별 SNP 리스트 10
이형접합형 변이를 assambly marker로 활용한 RHD 와 RHCE 부위의 phasing 10
3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 수준 11
1) 정성적 연구개발성과(연구개발결과) 11
RHD 및 RHCE 유전자형 분석을 위한 Target enrichment method 개발 11
RHD 및 RHCE 유전자형 염기서열분석 수행 12
RHD 및 RHCE 일배체별 유전자형 분석 알고리즘 개발 12
임상검체를 이용한 RHD 및 RHCE 일배체별 유전자형 분석법 평가 12
2) 세부 정량적 연구개발성과 : [붙임 1] 참조 12
3) 목표 달성 수준 12
4) 목표 미달 시 원인 분석(해당 시) 12
4-1) 목표 미달 원인(사유) 자체분석 내용 12
4-2) 자체 보완활동 12
4-3) 연구개발 과정의 성실성 12
4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도(연구개발결과의 중요성) 12
LR-PCR 및 long read sequencing을 이용한 유전형 분석 12
RHD 및 RHCE 유전자형 분석의 의의 12
5. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 13
연구개발성과의 활용분야 13
1) RHD/RHCE 한국인 일배체형 참조 데이터베이스 확립 13
추가연구의 필요성 13
1) 대규모 검체를 대상으로 한 대량 병렬 시퀀싱의 실증 13
타 연구에의 응용 13
1) 임상적 활용 기반 13
6. 자체점검표 14
7. 참고문헌 14
붙임 15
1. 세부 정량적 연구개발성과 15
2-1. 연구책임자 대표적 연구실적 16
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