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Pectobacterium carotovorum은 배추를 비롯한 광범위한 식물체에 무름병을 일으키는 병원성 세균으로, 무름병의

효율적인 방제를 위하여 신속한 병원체의 진단이 요구되고 있다. 따라서 본 연구에서는 높은 특이성으로 다양한

진단에 적용되고 있는 PCR법을 이용하여 Pectobacterium carotovorum을 높은 정확성과 민감성으로 검출할 수 있

는 진단법을 개발하고자 하였다. 먼저 P. carotovorum에 특이성이 있다고 보고된 다양한 특이 primer들을 비교하

여 가장 특이성이 높은 primer쌍들을 선별하였으며, 최종 선발된 특이 primer쌍은 ERB_3F (5'-TGCGACACCT

CCTCATCACG-3'), ERB_3R (5'-CTTATCACGCTGTAACCAGC-3')로 나타났다. 이들을 사용한 PCR 검출법은

58oC의 annealing 온도, 15 mM MgCl2 농도 등으로 최적화되었으며, 최적조건에서 P. carotovorum 특이 PCR 진단

법은 10 pg, 즉 2×103 copies의 병원균 유전자를 검출할 수 있는 우수한 민감성을 보였다. 또한 배양된 균주가 아닌

현장 시료에서 본 P. carotovorum 검출법을 시험해 본 결과 이 검사법은 병원균 배양없이 현장에도 직접 적용할

수 있음을 입증하였다. 따라서 본 연구를 통해 확립된 P. carotovorum 특이 PCR 진단법은 해당 병원균을 신속하

게 진단하는데 유용하게 사용될 수 있을 것이라 기대한다.

A new PCR method was developed to detect Pectobacterium carotovorum which is the causative agent of soft

rot in Brassica pekinensis. A specific detection primer set based on Lytic murein transglycolase gene was

designed and evaluated. Using ERB3_F (5'-TGC GAC ACC TCC TCA TCA CG-3') and ERB3_R (5'-CTT

ATC ACG CTG TAA CCA GC-3') primers, 437 nucleotides long fragment was specifically amplified. The

amplified products were observed in 52 out of 55 strains of P. carotovorum or Pectobacterium carotovorum

subsp. carotovorum. On the other hand, no amplification was observed in 8 organisms including Chinese cabbage

and potato. The optimal PCR condition for the ERB3_F/ERB3_R primer set was 58oC for annealing and

15 mM for MgCl2. With serially diluted templates, the specific PCR sensitivitie limit was 2?03 copies. Also,

this method can be applied not only to DNA but also to field samples. This PCR method may be expected to be

useful for specific detection of P. carotovorum.

권호기사

권호기사 목록 테이블로 기사명, 저자명, 페이지, 원문, 기사목차 순으로 되어있습니다.
기사명 저자명 페이지 원문 목차
Escherichia coli에서 효소활성을 지닌 Human HtrA3 단백질 제조와 HtrA Serine Protease 1, 2와의 효소활성 비교 김지환 ;김구영 ;남민경 ;김상수 ;임향숙 pp.291-299

분열효모에서 spNab2 유전자의 결실돌연변이 및 과발현에 대한 분석 윤진호 pp.300-305

Pectobacterium carotovorum의 검출을 위한 PCR 진단법의 개발 노지나 ;유미선 ;박동석 ;김정구 ;윤병수 pp.306-311

사상성 진균 Aspergillus nidulans에서 forkhead 유전자인 fkhF의 구조와 기능 분석 박미혜 ;김현영 ;김종화 ;한갑훈 pp.312-317

장미꽃 추출물에 의한 식중독 세균 Salmonella enteritidis JK-15에 대한 살균활성 및 그에 따른 LPS 변화 송유진 ;조윤석 ;오계헌 pp.318-323

능이버섯(Sarcodon aspratus) 무름병소에서 분리한 MK1 균주의 최적 성장조건과 정제된 균체외다당류의 특성 유정은 ; 이영남 pp.324-331

꿀벌(Apis mellifera)의 장내 세균인 Bacillus sp. HY-20이 분비하는 Xylanase의 특성 이란희 ;김도영 ;한미경 ;오현우 ;함수진 ;박두상 ;배경숙 ;석대은 ;신동하 ; pp.332-338

김치로부터 오르니틴 생성능을 갖는 Weissella 속 균주의 분리, 동정 및 특성 유진주 ;박형주 ;김수곤 ;오석흥 pp.339-345

이식을 위한 사람 양막의 소독 및 멸균공정에 의한 감염성 위해인자 불활화 효과 배정은 ;김찬경 ;김인섭 pp.346-353

생물담체 활용 생물접종에 의한 원유로 오염된 해양토양의 정화 Kelvin I. Ekpeghere ;배환진 ;권성현 ;김병혁 ;박득자 ;김희식 ;고성철 pp.354-361

Pseudomonas aeruginosa AJ1에 의한 Microcystis aeruginosa의 성장제어 김선정 ;이상섭 pp.362-367

적색색소를 생산하는 해양미생물 JE-34 균주의 분류학적 특성 및 항균활성 김주상 ;김만철 ;Ramasamy Harikrishnan ;한용재 ;허문수 pp.368-376

전통 메주에서 분리한 Bacillus subtilis MJ-226이 생산하는 혈전용해효소의 특성 임성미 pp.377-384

Chlorella pyrenoidosa의 생장 특성 및 동일 균주로부터 Acetaldehyde Dehydrogenase의 활성 검출 이준우 pp.385-390

한국 전통주인 막걸리의 발효 및 유통과정에서의 효모 및 총산과 유기산의 변화 이특재 ;황대연 ;이충열 ;손홍주 pp.391-396

해양방선균 Streptomyces sp. ACT-1의 동정 및 항산화 활성 김만철 ;김주상 ;김윤범 ;Ramasamy Harikrishnan ;한용재 ;허문수 pp.397-403

Pseudoalteromonas sp. Ju11-1과 Pseudoalteromonas sp. Ju14의 색소 추출물의 물리화학적 안정성과 기능성 박진숙 ;조현희 ;강명희 pp.404-410

Bacillus sp. MR2에 의한 망간단괴의 생물용출 최성찬 ;이가화 ;이홍금 pp.411-415

벤조피렌으로 유발된 흰쥐 간독성에 대한 번데기동충하초 배양액의 회복효과 조성준 ;이태희 ;김진만 ;한영환 pp.416-418

바이오센서 개발을 위한 발광 유전자의 대장균에서의 발현 시스템 분석 조미미 ;김영두 ;강경숙 ;김숙경 ;양인철 ;박상열 ;이찬용 pp.419-424

장독소 유전자 함유 Bacillus cereus 확인을 위한 독소 전사 조절 유전자 plcR-papR의 PCR 검출법 윤숙현 ;김용상 ;소순구 ;정도연 ;한금수 ;엄태붕 pp.425-429

Vibrio 속 16S rRNA 유전자 염기서열의 이질성 분석 기장서 pp.430-434

참고문헌 (7건) : 자료제공( 네이버학술정보 )

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 강희완, 고승주, 권순우. 1998. PCR 다형성 밴드 유래 DNA probe에 의한 Erwinia carotovora subsp. carotovora 특 이적 검출. 한국식물병리학회지 14, 164-170. 미소장
2 김용기, 심홍식, 박경석, 예완해, 김택수, 김효진. 2006. 주 요 채소류 저장병해 종류 및 피해조사. 농업생물연구2005, pp. 669-687. 미소장
3 명인식, 이영기. 2004. 세균성 무름병균의 유전적 분화 및 정밀 검출법 개발. 작물보호연구2003. 농촌진흥청 농업과 학기술원, pp. 7-23. 미소장
4 용영록. 2003. 고랭지 여름배추의 무름병 방제 및 고품질 안정 생산기술 개발. 농림부 146. 미소장
5 Bell, K.S., M. Sebaihia, L. Pritchard, M.T. Holden, L.J. Hyman, M.C. Holeva, N.R. Thomsom, S.D. Bentley, L.J. Churcher, K. Mungall, R. Atkin, N. Bason, K. Brooks, T. Chillingworth, K. Clark, J. Doggett, A. Fraser, Z. Hance, H. Hauser, K. Jagels, et al. 2004. Genome sequence of the enterobacterial phytopathogen Erwinia carotovora subsp. atroseptica and characterization of virulence factors. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 11105-11110. 미소장
6 Potato diseases caused by soft rot erwinias: an overview of pathogenesis 네이버 미소장
7 Biotechnology in Turkey: an overview. 네이버 미소장

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