대표어
한국학술지인용색인(NRF)
권호기사보기
| 기사명 | 저자명 | 페이지 | 원문 | 기사목차 |
|---|
국회도서관 홈으로
정보검색
소장정보 검색
결과 내 검색
동의어 포함
목차보기
목차
COI와 rbcL 염기서열을 이용한 생물계통수 비교 / 김명숙 ; 이정형 1
요약 1
1. 서론 1
2. NJ와 ML 계통수 작성의 이론적 배경 3
3. Gracilaria COI와 rbcL 염기서열 자료에 대한 NJ와 ML 계통수 5
4. 결론 6
참고문헌 9
Abstract 11
초록보기
최근 빠르게 진행되고 있는 생물다양성의 손실은 정확한 생물분류와 동정을 위한 기술적인 지원의 필요성을 증가시킨다. 전통적인 방법에 의한 새로운 종의 체계적인 분류는 많은 시간과 노력 및 예산이 들어간다는 점에서 효율성이 떨어지므로 표준화된 DNA(deoxyribonucleic acid) 바코드(barcode)에 의한 분류방식은 매우 큰 중요성을 갖는다. DNA 바코드의 효용은 포괄적이고 광범위하게 접근할 수 있는 데이터베이스의 발전에 있으며, 짧은 DNA 염기서열을 이용하여 다양한 생물군으로부터 종의 빠르고 정확한 식별을 가능하게 한다. 본 논문에서는 DNA 바코드로 인정하는 COI(mitochondrial gene cytochrome c oxidase I) 유전자 염기서열을 이용하여 NJ(neighbor joining) 계통수(phylogenetic tree)와 ML(maximum likelihood) 계통수를 작성하고 그 결과를 홍조류 생물계통수 추론에서 주로 사용되는 rbcL 염기서열을 바탕으로 작성된 계통수와 각각 비교하였다. COI 유전자의 계통수 추정결과는 rbcL 유전자의 계통수 추정결과와 동일한 위상으로 나타나므로, DNA 바코드 유전자인 COI 염기서열은 홍조류 종의 빠른 인지와 정확한 식별에 유용하게 이용될 수 있음을 보였다.
The loss of biodiversity progressing rapidly in recent years has been increasing the necessity of technical support for the accurate taxonomy and identification. Systematics by traditional method has required plenty of time, effort and budget resulted in decreasing efficiency. The utility of DNA barcoding is to provide an efficient method for species-level identifications and, as such, will contribute powerfully to taxonomic and biodiversity research. In this paper, we compared the NJ and ML phylogenetic tree using COI gene as DNA barcode and rbcL gene as phylogeny for Gracilariaceae of Rhodophyta. The result of phylogenetic tree estimated by COI gene is showing same topology with the phylogenetic tree by rbcL gene. Thus we confirmed that DNA barcoding can complement currrent research in the taxonomy by providing potentially useful information for groups that are already well studied, and will be helpful in the selection of taxa for research attention.
The loss of biodiversity progressing rapidly in recent years has been increasing the necessity of technical support for the accurate taxonomy and identification. Systematics by traditional method has required plenty of time, effort and budget resulted in decreasing efficiency. The utility of DNA barcoding is to provide an efficient method for species-level identifications and, as such, will contribute powerfully to taxonomic and biodiversity research. In this paper, we compared the NJ and ML phylogenetic tree using COI gene as DNA barcode and rbcL gene as phylogeny for Gracilariaceae of Rhodophyta. The result of phylogenetic tree estimated by COI gene is showing same topology with the phylogenetic tree by rbcL gene. Thus we confirmed that DNA barcoding can complement currrent research in the taxonomy by providing potentially useful information for groups that are already well studied, and will be helpful in the selection of taxa for research attention.
권호기사
참고문헌 (30건) : 자료제공( 네이버학술정보 )
| 번호 | 참고문헌 | 국회도서관 소장유무 |
|---|---|---|
| 1 | Comparison of Maximum Likelihood and Bayesian Inference to Estimate Phylogenetic Relationships | 소장 |
| 2 | Estimation of Phylogenetic Relationships using Bootstrap of Maximum Likelihood and Bayesian Analysis | 소장 |
| 3 | Gene Clustering using Normal Mixture Model restricted Fold Change in Microarray data | 소장 |
| 4 | A Note on Bayesian Information Criterion in Model-Based Clustering | 소장 |
| 5 | A new look at the statistical model identification  |
미소장 |
| 6 | Identifying spiders through DNA barcodes |
미소장 |
| 7 | Blaxter M. L., Floyd R. (2003). Molecular taxonomics for biodiversity surveys: already a reality, Trends in Ecology & Evolution, 18(6), 268-269. | 미소장 |
| 8 | Casella, G., Berger, R. L. (1990). Statistical inference, Duxbury Press, Belmont, California. | 미소장 |
| 9 | Confidence Limits on Phylogenies: An Approach Using the Bootstrap |
미소장 |
| 10 | Challenges for taxonomy |
미소장 |
| 11 | Godfray, H. C. J., Knapp, S. (2004). Introduction. in Taxonomy for the twenty-first century-Special Issue, Philosophical Transactions of the Royal Society, B, 359, 559-569. | 미소장 |
| 12 | Hammond, P. (1992). Species inventory, In Global biodiversity: status of the earth's living resources, Edited by B. Groomgridge, Chapman and Hall, Lodon, 17-39. | 미소장 |
| 13 | Hawksworth, D. L., Kalin-Arroyo, M. T. (1995). Magnitude and distribution of biodiversity, In Global biodiversity assessment, Edited by V. H. Heywood, Cambridge University Press, Cambridge, UK, 107-191. | 미소장 |
| 14 | Biological Identifications through DNA Barcodes |
미소장 |
| 15 | Barcoding Animal Life: Cytochrome c Oxidase Subunit 1 Divergences among Closely Related Species |
미소장 |
| 16 | Hebert, P. D. N., Penton, E. H., Bums, J. M., Janrerl, D. H., Hallwachs, W. (2004a). Ten species in one: DNA barcoding reveals cryptic species in the neotropical skipper butterfly , Proceedings of the National Academiy of Sciences, 101(41), 14812-14817. doi:10.1073/pnas.0406166101. | 미소장 |
| 17 | Identification of Birds through DNA Barcodes |
미소장 |
| 18 | Applying DNA barcoding to Korean Gracilariaceae (Rhodophyta) |
미소장 |
| 19 | Kress, W. J., Wurdack, K. J., Zimmer, E. A., Weigt, L. A., Janzen, D. H. (2005). Use of DNA barcodes to identify flowering plants, Proceedings of the National Academiy of Sciences, 102(23), 8369-8374. doi: 10.1073/pnas.0503123102. | 미소장 |
| 20 | A genetic algorithm for maximum-likelihood phylogeny inference using nucleotide sequence data. |
미소장 |
| 21 | How Many Species are There on Earth? |
미소장 |
| 22 | Monaghan, M. T., Balke, M., Gregory. T. R., Vogler, A. P. (2005). DNA-based species delineation in tropical beetles using mitochondrial and nuclear markers, Philosophical Transactions of the Royal Society, B: Biological Sciences, 360, 1925-1933. | 미소장 |
| 23 | fastDNAmL: a tool for construction of phylogenetic trees of DNA sequences using maximum likelihood. |
미소장 |
| 24 | MODELTEST: testing the model of DNA substitution. |
미소장 |
| 25 | The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. |
미소장 |
| 26 | Stochastic Search Strategy for Estimation of Maximum Likelihood Phylogenetic Trees |
미소장 |
| 27 | Saunders, G. W. (2005). Applying DNA barcoding to red macroalgae: a preliminary appraisal holds promise for future applications, Philosophical Transactions of the Royal Society, B: Biological Sciences, 360, 1879-1888. | 미소장 |
| 28 | Performance study of phylogenetic methods: (unweighted) quartet methods and neighbor-joining |
미소장 |
| 29 | A note on the neighbor-joining algorithm of Saitou and Nei. |
미소장 |
| 30 | Swofford, D. L. (2001). PAUP*: Phylogenetic Analysis Using Parsimony (*and other methods), version 4.0b10, Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts. | 미소장 |
MARC 보기
오류 데이터 정정요청
*표시는 필수 입력사항입니다.
알림톡 발송
| 전화번호 |
|---|
개인정보 수정 바로가기
연속간행물 권호 선택
우편복사 안내
- ◾ 도서관을 방문하지 못할 경우 인터넷, 팩스 등으로 자료 복사를 신청하고, 복사물을 우편·팩스 등으로 제공받는 서비스
- ◾ 대상자료: 일반도서, 연속간행물 및 학위논문
- ※ 고서, 고잡지, 훼손될 우려가 있는 자료, 마이크로폼 자료 및 신문 등 제외
- ◾ 신청 책수: 1인 5책 이하(1일 기준)
- ◾ 신청 절차: 자료 검색 → 우편복사 목록담기 → 복사 범위 입력 → 우편복사 주문서 입력 → 접수 및 확인
- ※ 저작권법에 의거하여 부분 복사(전체 페이지 수의 1/3 범위 이내)만 가능
- ◾ 복사 범위 입력 예시: (연속 페이지) 1-30, (부분 페이지) 25, 30-40
| 번호 | 발행일자 | 권호명 | 제본정보 | 자료실 | 원문 | 신청 페이지 |
|---|
도서위치안내(서울관)
도서위치안내: 정기간행물실(524호) / 서가번호: 국내17
2021년 이전 정기간행물은 온라인 신청(원문 구축 자료는 원문 이용)
0
확인
우편복사 목록담기를 완료하였습니다.
내서재에 담기
새로운 서재
*표시는 필수 입력사항입니다.
저장
저장 되었습니다.