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요약문

목차

Abstract 14

I. 서론 15

II. 큰기러기, 쇠기러기 16

1. 서론 16

2. 연구방법 20

가. 연구시료 20

나. 실험방법 23

3. 연구 결과 39

가. SNP 선별 결과 39

다. KASP assay 분석 결과 43

4. 고찰 45

III. 검은뻐꾸기 46

1. 서론 46

2. 연구방법 48

가. 연구시료 48

나. 실험방법 48

3. 연구 결과 50

가. de novo assembly 결과 50

나. 미토콘드리아 유전체 분석 및 계통분석 결과 50

4. 고찰 54

IV. 검은등제비갈매기 55

1. 서론 55

2. 연구방법 58

가. 연구시료 58

나. 실험방법 58

3. 연구 결과 60

가. 게놈 시퀀싱 결과 60

나. 미토콘드리아 유전체 분석 결과 60

다. 계통분석 결과 63

4. 고찰 64

V. 흰눈썹뜸부기 65

1. 서론 65

2. 연구방법 67

가. 연구시료 67

나. 실험방법 67

3. 연구 결과 69

가. 게놈 시퀀싱 결과 69

나. 미토콘드리아 유전체 분석 결과 69

다. 계통분석 결과 72

4. 고찰 74

VI. 솔새류 75

1. 서론 75

2. 연구방법 87

가. 연구시료 87

나. 실험방법 98

3. 연구결과 105

가. 분자생물학적 종판별 결과 105

나. 분자생물학적 성판별 결과 124

다. 솔새류 계통분류 결과 139

라. 미토콘드리아 전장유전체 분석 결과 141

4. 고찰 147

VII. 노랑턱멧새 149

1. 서론 149

2. 연구방법 151

가. 연구시료 151

나. 실험방법 152

3. 연구 결과 156

가. 노랑턱멧새 마이크로새터라이트 다양성 및 구조 156

나. 노랑턱멧새 미토콘드리아 전장 유전체 정보 확보 160

4. 고찰 166

VIII. 참고 문헌 167

뒷표지 177

표목차

표 II-1. 큰기러기, 쇠기러기 시료 목록 20

표 II-2. 큰기러기, 쇠기러기 SNP 검증 24

표 II-3. 큰기러기, 쇠기러기 SNP 선별 결과 39

표 III-1. NGS를 위한 검은뻐꾸기 DNA의 정성분석 결과 48

표 III-2. 검은뻐꾸기 de novo assembly 결과 50

표 III-3. 검은뻐꾸기 미토콘드리아 유전체 분석 요약 50

표 III-4. 검은뻐꾸기 미토콘드리아 유전자별 위치정보 52

표 IV-1. 검은등제비갈매기 Illumina 데이터 분석 결과 60

표 IV-2. 검은등제비갈매기 미토콘드리아 유전체 assembly 및 조립 결과 60

표 IV-3. 검은등제비갈매기 미토콘드리아 유전자별 위치정보 62

표 V-1. 흰눈썹뜸부기 Illumina 데이터 분석 결과 69

표 V-2. 흰눈썹뜸부기 미토콘드리아 유전체 assembly 및 조립 결과 69

표 V-3. 흰눈썹뜸부기 미토콘드리아 유전자별 위치정보 71

표 VI-1. 국가생물종목록에 기록된 솔새류 14종 75

표 VI-2. 쇠솔새 또는 큰솔새 시료 목록 88

표 VI-3. 노랑눈썹솔새 또는 연노랑눈썹솔새 시료 목록 91

표 VI-4. 긴다리솔새사촌 또는 쇠긴다리솔새사촌 시료 목록 93

표 VI-5. 되솔새 또는 사할린되솔새 시료 목록 94

표 VI-6. 성판별법 구축 시료 목록 97

표 VI-7. 솔새류 Cyt-b PCR 프라이머 98

표 VI-8. 솔새류 Cyt-b PCR 조건 99

표 VI-9. 솔새류 sexing PCR 테스트 프라이머 100

표 VI-10. 솔새류 sexing PCR 조건 101

표 VI-11. NGS를 위한 솔새류 DNA 정성분석 결과 102

표 VI-12. 쇠솔새, 큰솔새의 분자생물학적 종판별 결과 105

표 VI-13. 노랑눈썹솔새의 분자생물학적 종판별 결과 110

표 VI-14. 긴다리솔새사촌, 쇠긴다리솔새사촌의 분자생물학적 종판별 결과 115

표 VI-15. 되솔새, 사할린되솔새의 분자생물학적 종판별 결과 118

표 VI-16. 쇠솔새, 큰솔새의 분자생물학적 성판별 결과 130

표 VI-17. 노랑눈썹솔새의 분자생물학적 성판별 결과 133

표 VI-18. 긴다리솔새사촌, 쇠긴다리솔새사촌의 분자생물학적 성판별 결과 135

표 VI-19. 되솔새, 사할린되솔새의 분자생물학적 성판별 결과 136

표 VI-20. Cyt-b를 이용한 솔새류 간 유전적 거리 139

표 VI-21. 쇠긴다리솔새사촌, 버들솔새 Illumina 데이터 분석 결과 141

표 VI-22. 쇠긴다리솔새사촌, 버들솔새 미토콘드리아 유전체 조립 결과 141

표 VI-23. 쇠긴다리솔새사촌 미토콘드리아 유전자별 위치정보 144

표 VI-24. 버들솔새 미토콘드리아 유전자별 위치정보 145

표 VII-1. 노랑턱멧새 연구 시료 목록 151

표 VII-2. 노랑턱멧새의 마이크로새터라이트 증폭을 위한 PCR 반응액 조건 153

표 VII-3. 노랑턱멧새의 마이크로새터라이트 증폭을 위한 PCR 조건 154

표 VII-4. 노랑턱멧새 유전체 NGS 결과 요약 156

표 VII-5. 노랑턱멧새(ESH_A00672) 개체의 NGS reads assembly 결과 요약 156

표 VII-6. 노랑턱멧세 마이크로새터라이트 유전자좌 빈도 156

표 VII-7. 노랑턱멧새 10개 마이크로새터라이트 마커 정보 157

표 VII-8. 노랑턱멧새 10개 마이크로새터라이트 유전 다양성 158

표 VII-9. 노랑턱멧새 AMOVA 분석결과 160

표 VII-10. 노랑턱멧새 mtDNA 유전체 정보(ESH_A00672) 162

표 VII-11. 노랑턱멧새 mtDNA 유전체 정보(BR1008) 163

표 VII-12. 노랑턱멧새 COI Haplotype 정보 165

그림목차

그림 II-1. 큰기러기의 분포도 16

그림 II-2. 쇠기러기의 분포도 17

그림 II-3. 큰기러기(왼쪽)와 쇠기러기(오른쪽)의 생김새 18

그림 II-4. KASP assay 실험 원리 37

그림 II-5. 큰기러기, 쇠기러기 Real-Time PCR의 증폭 조건 38

그림 II-6. ●큰기러기 ●쇠기러기의 선별 SNP좌위 PCA 결과[이미지참조] 42

그림 II-7. 큰기러기, 쇠기러기 Delta K값 43

그림 II-8. 큰기러기, 쇠기러기 STRUCTURE 분석 결과 43

그림 II-9. ●큰기러기, ●쇠기러기의 KASP assay 2D/3D PCA 결과[이미지참조] 44

그림 III-1. 검은뻐꾸기 수컷(왼쪽)과 암컷(오른쪽)의 생김새 46

그림 III-2. 검은뻐꾸기의 분포도 47

그림 III-3. 검은뻐꾸기의 미토콘드리아 유전자 지도 51

그림 III-4. mtDNA PCG를 이용한 근연종과 검은뻐꾸기의 계통수 분석 결과 53

그림 IV-1. 검은등제비갈매기의 생김새 55

그림 IV-2. 검은등제비갈매기의 분포도 56

그림 IV-3. 검은등제비갈매기 미토콘드리아 유전자 지도 61

그림 IV-4. mtDNA PCG를 이용한 근연종과 검은등제비갈매기의 계통수 분석 결과 63

그림 V-1. 흰눈썹뜸부기의 생김새 65

그림 V-2. 흰눈썹뜸부기의 분포도 66

그림 V-3. 흰눈썹뜸부기 미토콘드리아 유전자 지도 70

그림 V-4. mtDNA PCG를 이용한 근연종과 흰눈썹뜸부기의 계통수 분석 결과 72

그림 V-5. COI을 이용한 흰눈썹뜸부기, 회색가슴뜸부기의 계통수 분석 결과 73

그림 VI-1. 쇠솔새(위)와 큰솔새(아래)의 생김새 76

그림 VI-2. 쇠솔새, 큰솔새, 솔새 분포도 77

그림 VI-3. 노랑눈썹솔새(왼쪽)와 연노랑눈썹솔새(오른쪽)의 생김새 78

그림 VI-4. 노랑눈썹솔새와 연노랑눈썹솔새의 분포도 79

그림 VI-5. 긴다리솔새사촌(위)과 쇠긴다리솔새사촌(아래)의 생김새 80

그림 VI-6. 긴다리솔새사촌(위)과 쇠긴다리솔새사촌(아래)의 분포도 81

그림 VI-7. 되솔새 또는 사할린되솔새의 생김새 82

그림 VI-8. 되솔새(왼쪽)와 사할린되솔새(오른쪽)의 분포도 83

그림 VI-9. 버들솔새의 생김새 84

그림 VI-10. 버들솔새의 분포도 85

그림 VI-11. Greenish Warbler의 고리종 분포도 85

그림 VI-12. 솔새류의 포획과 시료 확보 87

그림 VI-13. DNA Library 제작 과정 103

그림 VI-14. 쇠솔새와 큰솔새의 네트워크 분석 결과 108

그림 VI-15. Cyt-b 982bp를 이용한 쇠솔새, 큰솔새, 솔새의 계통수 109

그림 VI-16. 노랑눈썹솔새의 네트워크 분석 결과 113

그림 VI-17. Cyt-b 1,032bp를 이용한 노랑눈썹솔새, 연노랑눈썹솔새의 계통수 114

그림 VI-18. 긴다리솔새사촌과 쇠긴다리솔새사촌의 네트워크 분석 결과 116

그림 VI-19. Cyt-b 851bp를 이용한 긴다리솔새사촌, 쇠긴다리솔새사촌의 계통수 117

그림 VI-20. 되솔새와 사할린되솔새의 네트워크 분석 결과 122

그림 VI-21. Cyt-b 1,012bp를 이용한 되솔새, 사할린되솔새의 계통수 123

그림 VI-22. 1237L/1272H 프라이머 증폭 결과 124

그림 VI-23. 2550F/2718R 프라이머 증폭 결과 125

그림 VI-24. P2/NP 프라이머 증폭 결과 126

그림 VI-25. P2/NP/MP 프라이머 증폭 결과 127

그림 VI-26. P2/P8 프라이머 증폭 결과 128

그림 VI-27. CHD1F/CHD1R 프라이머 증폭 결과 129

그림 VI-28. Cyt-b 1,032bp를 이용한 솔새류의 계통수 140

그림 VI-29. 쇠긴다리솔새사촌 미토콘드리아 유전자 지도 142

그림 VI-30. 버들솔새 미토콘드리아 유전자 지도 143

그림 VI-31. mtDNA PCG를 이용한 솔새류의 계통수 분석 결과 146

그림 VII-1. 노랑턱멧새의 생김새 149

그림 VII-2. 노랑턱멧새의 분포도 150

그림 VII-3. 노랑턱멧새 STRUCTURE 분석 159

그림 VII-4. 노랑턱멧새 개체군 유전 구조(상 : K＝2, 하 : K＝4) 160

그림 VII-5. 노랑턱멧새의 mtDNA 전장유전체의 조립지도 161

그림 VII-6. Emberiza 속의 mtDNA PCG(Protein Coding Gene) 계통수 164

그림 VII-7. 노랑턱멧새 COI 바코드 계통수 165

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조류의 유전적 다양성 연구(4차년도) = Studies for genetic diversity of migratory birds 이용현황 표 - 등록번호, 청구기호, 권별정보, 자료실, 이용여부로 구성 되어있습니다.
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