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Rapid extension of genomic database leads

to the remarkable advance of functional genomics. This

study proposes a novel methodology of functional analysis

using 5-methyltrytophan (5 MT) mutant together with their

2-DE analysis and public microarray database. A total of

24 proteins was changed in 5 MT mutant and four remarkably

different expressed proteins were identified. Among them,

three spots were converted to Affymetrix probe. A total of

155 microarray samples from Gene Expression Omnibus

(GEO) in NCBI was retrieved and followed by constructing

gene co-expression networks over a broad range of biological

issues through Self-Organising Tree Algorithm. Three

co-expressing gene clusters were retrieved and each functional

categorization with differential expression pattern

was exhibited from 5 MT resistance mutant rice. It was

indicated new co-expression networks in the mutant. This

study suggests that on investigating possibility which correspond

2-DE to microarray database with their full potential.

권호기사

권호기사 목록 테이블로 기사명, 저자명, 페이지, 원문, 기사목차 순으로 되어있습니다.
기사명 저자명 페이지 원문 목차
중부지역 적응 주요 벼 품종의 수발아 특성 박중수 ;김희동 pp.241-248

Association of puroindolines genotypes and grain properties, milling performances and physical properties of flour in Korean wheats Chul Soo Park ;Chon-Sik Kang ;Jong-Chul Park ;Youn-Joo Jung ;Young-Keun Cheong ;Sun-Hee Woo pp.249-259

벼 낙수시기 기준 자운영 파종적기 구명 김상열 ;오성환 ;최경진 ;김정일 ;박성태 ;여운상 ;강항원 pp.260-264

자운영 입모부족시 Sethoxydim 처리가 둑새풀 방제 및 자운영 녹비량 증가에 미치는 영향 김상열 ;오성환 ;황운하 ;최경진 ;박성태 ;김정일 ;여운상 ;강항원 pp.265-269

한국, 일본에서 수집한 들깨와 차조기의 재배형 및 잡초형들의 종자발아 변이 정지나 ;유창연 ;김종화 ;이주경 pp.270-278

보리와 완두의 혼파재배에서 혼파비율과 예취시기에 따른 사료가치의 변화 오태석 ;김창호 ;이효원 pp.279-286

홍삼 물 추출액의 사포닌 함량 및 맛의 증진을 위한 추출 조건 李翔國 ;한진수 ;박용준 ;강선주 ;김정선 ;남기열 ;이기택 ;최재을 pp.287-293

심지수의 차이에 따른 심지양액재배 씨감자의 생육 및 수량 김찬우 ;강봉균 ;송창길 ;박성준 ;강영길 pp.294-298

Kunitz Trypsin Inhibitor 발현 억제에 의한 콩 뿌리혹 수의 감소 김선형 ;임채우 ;박지영 ;황철호 pp.299-306

Influence of antibiotics on shoot regeneration and Agrobacteium[i.e. Agrobacterium] suppression using cotyledonary node in Korean soybean cultivars Kyung-Hee Kim ;Jae-Eun Lee ;Young-Up Kwon ;Byung-Moo Lee pp.307-313

콩나물의 향기 성분 분석 김용호 ;이경애 ;김희선 pp.314-319

두과 작물의 경실종자 발아촉진에 대한 종피연화처리의 효과 김석현 ;장미하 ;정종일 ;심상인 pp.320-326

밭토양에서 녹비작물 헤어리베치와 호밀의 혼파비율이 Biomass 생산에 미치는 영향 전원태 ;성기영 ;이종기 ;김민태 ;조현숙 pp.327-331

A genome-wide approach for functional analysis using rice mutant Won Cheol Yim ;Dong Sub Kim ;Jun-Cheol Moon ;Cheol Seong Jang ;Byung-Moo Lee pp.332-338

참고문헌 (23건) : 자료제공( 네이버학술정보 )

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 Functional Divergence of Duplicated Genes Formed by Polyploidy during Arabidopsis Evolution 네이버 미소장
2 de Hoon, M. J., S. Imoto, J. Nolan, and S. Miyano. 2004. Open source clustering software. Bioinformatics 20 : 1453- 1454. 미소장
3 Genome Relationships: The Grass Model in Current Research 네이버 미소장
4 Gale, M. D. and K. M. Devos. 1998. Comparative genetics in the grasses. Proc. Natl Acad. Sci 95 : 1971-1974. 미소장
5 Gromova, I. and J. E. Celis. 2004. Protein detection in gels by silver staining: A procedure compatible with mass- spectrometry. Cell Biology. A Laboratory Handbook. 미소장
6 Rapid divergence in expression between duplicate genes inferred from microarray data 네이버 미소장
7 Biochemical Genetics of Plant Secondary Metabolites in Arabidopsis thaliana: The Glucosinolates 네이버 미소장
8 A hierarchical unsupervised growing neural network for clustering gene expression patterns 네이버 미소장
9 Hobo, T., Y. Kowyama, and T. Hattori. 1999. A bZIP factor, TRAB1, interacts with VP1 and mediates abscisic acid- induced transcription. Proc. Natl Acad. Sci 96(26) : 15348-15353. 미소장
10 W. C. Yim. and Jang, C. S. 2007. Discovery of gene regulatory networks via in silico analysis and their application in abiotic stress responses. Korean J. Breed 37(4) : 464-472. 미소장
11 Separation and characterization of Arabidopsis thaliana proteins by two-dimensional gel electrophoresis. 네이버 미소장
12 Selection of 5-methyltryptophan resistant rice mutants from irradiated calli derived from embryos 네이버 미소장
13 Kruger, N. J. 2002. The Bradford Method for Protein Quanti-tation. The Protein Protocols Handbook. Humana Press, Inc. 15-20. 미소장
14 Larkin, P. J. and W. R. Scowcroft. 1981. Somaclonal variation -a novel source of variability from cell cultures for plant improvement. Theor. App. Genet. 60 : 197-214. 미소장
15 High resolution two-dimensional electrophoresis of proteins. 네이버 미소장
16 Phillips, R. L., S. M. Kaeppler, and P. Olhoft. 1994. Genetic Instability of Plant Tissue Cultures: Breakdown of Normal Controls. Proc. Natl Acad. Sci 91 : 5222-5226. 미소장
17 The sequence of rice chromosomes 11 and 12, rich in disease resistance genes and recent gene duplications. 네이버 미소장
18 Expression of the cold-induced wheat gene Wcs120 and its homologs in related species and interspecific combinations 네이버 미소장
19 Sasaki, T. 1998. The rice genome project in Japan. Proc. Natl Acad. Sci 95(5) : 2027-2028. 미소장
20 Variation for improved protein and yield from rice anther culture. 네이버 미소장
21 Genomics-assisted breeding for crop improvement 네이버 미소장
22 A draft gene regulatory network for cellular totipotency reprogramming during plant somatic embryogenesis 네이버 미소장
23 Zimmermann, P., L. Hennig, and W. Gruissem. 2005. Gene- expression analysis and network discovery using Genevesti-gator. Trends Plant Sci. 10 : 407-409. 미소장

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