본문 바로가기 주메뉴 바로가기
22대 대한민국 국회 국회정보길라잡이 국회의원검색
회원가입 로그인
HOME

정보검색

소장정보 검색

국회도서관 홈으로 정보검색 소장정보 검색

결과 내 검색

동의어 포함

고급검색

인명/단체명

저자정보 상세정보
인명/단체명을 입력하세요.

키워드

  • 대표어

  • 외국어

-

초록보기

As a number of archaea are ubiquitously found in non-extreme habitats, elucidation of their functional roles becomes currently an emerging issue. However, most of them are unable to grow in pure culture and so it remains to be established. In order to find genes lacking in the genome of an ammonia-oxidizing archaeon (AOA), we here report on the comparative analyses of an AOA genome with those of experimentally or theoretically established minimal genomes for independent growth. We assessed the genes lacking in AOA using logic of clusters of orthologous groups (COG), remote homology, consensus sequence weight matrix, function-based motif or domain, and then further excluded genes encoding hypothetical orarchaea-specific proteins. The results of these combination analyses revealed 19 candidate genes lacking in the genome of an AOA. Thus, our results provide a possibility of inducing independent growth of AOA when supplemented with product (s) of the lacking gene (s), and also give a chance for finding new proteins with novel sequence or structure space even if the predicted lacking-genes will be found using another algorithms or biochemical studies.

권호기사

권호기사 목록 테이블로 기사명, 저자명, 페이지, 원문, 기사목차 순으로 되어있습니다.
기사명 저자명 페이지 원문 목차
줄기세포의 분화 결손으로 인한 노화와 암화 이미옥 ,차혁진 pp.183-188

대장균에서 Selenocysteine을 가지고 있는 Formate Dehydrogenase H의 최적화 생산 사영승 ,김용환 pp.189-192

Ethylene glycol에 의해 액화된 폐지로부터 polyester 제조 이동헌 ,김창준 ,김성배 pp.193-198

Tetrameric β-galactosidase를 이용한 고초균 포자에서의 미생물 표면 발현 모체 선별 김준형 ,반재구 ,김병기 pp.199-205

알긴산이 Nannochloropsis oculata NIES-2145의 생장에 미치는 영향 박현진 ,김영화 ,이재화 pp.206-210

고산홍경천 에탄올 추출물의 항산화작용과 쥐의 혈압 및 골격근 수축성에 미치는 영향 김은철 ,청위동 ,이광진 ,정용안 ,노경호 pp.211-216

이트라코나졸 마이크로스폰지의 약물 전달 시스템 :제조, 특성 및 방출 연구 조영호 ,이종화 ,김학형 ,이계원 pp.217-222

Enterobacter aerogenes를 이용한 crude glycerol 기반의 바이오에탄올 생산 정홍섭 ,성필제 ,고아라 ,이상준 ,김승욱 ,한성옥 ,조재훈 ,조대행 ,김용환 ,박철환 pp.223-228

이타콘산 고생산성 Aspergillus terreus 변이주의 신속 선별을 위한 효율적인 균주 스크리닝 전략 개발 신우식 ,김평현 ,이도훈 ,김상용 ,정용섭 ,전계택 pp.229-236

암모니아 산화 고세균의 독립성장에 필요한 결손 유전자 예측 한상수 ,이진영 ,이성근 ,김근중 pp.237-242

고초균 포자를 이용한 Zymomonas mobilis 유래의 levansucrase 표면 발현 김준형 ,최수근 ,정흥채 ,반재구 ,김병기 pp.243-247

염증세포주를 이용한 생체재료 용출물의 체외 생체적합성 평가 신연호 ,송계용 ,서민지 ,김성민 ,박정극 ,김동섭 ,박기정 ,허찬회 ,차지훈 ,서영권 pp.248-254

숭어 추출물을 이용한 주름개선 효과 조숙정 ,김윤수 ,남형근 ,신현재 ,류은미 ,나명순 ,안병권 ,최두복 ,차월석 pp.255-259

고주파요법과 갯장어 추출물 병행처리가 남성피부에 미치는 영향 노현주 ,김윤수 ,남형근 ,신현재 ,류은미 ,나명순 ,안병권 ,최두복 ,차월석 pp.260-265

참고문헌 (30건) : 자료제공( 네이버학술정보 )

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 Allen, E. E. and J. F. Banfield (2005) Community genomics in microbial ecology and evolution. Nat. Rev. Microbiol. 3: 489-498. 미소장
2 Allers, T. and M. Mevarech (2005) Archaeal genetics - The third way. Nat. Rev. Genet. 6: 58-73. 미소장
3 Berg, I. A., D. Kockelkorn, W. Buckel, and G. Fuchs (2007) A 3-hydroxypropionate/4-hydroxybutyrate autotrophic carbon dioxide assimilation pathway in archaea. Science 318: 1782-1786. 미소장
4 Bleichert, F., K. T. Gagnon, B. A. Brown, E. S. Maxwell, A. E. Leschziner, V. M. Unger, and S. J. Baserga (2009) A dimeric structure for archaeal box C/D small ribonucleoproteins. Science 325: 1384-1387. 미소장
5 Nucleic Acids Research 네이버 미소장
6 Dore, J. E., R. Lukas, D. W. Sadler, M. J. Church, and D. M. Karl (2009) Physical and biogeochemical modulation of ocean acidification in the central North Pacific. Proc. Natl. Acad. Sci. 106: 12235-12240. 미소장
7 Microbes Made to Order 네이버 미소장
8 Archaeal genomics. 네이버 미소장
9 Gibson, D. G., J. I. Glass, C. Lartigue, V. N. Noskov, R. Y. Chuang, M. A. Algire, G. A. Benders, M. G. Montague, L. Ma, M. M. Moodie, C. Merryman, S. Vashee, R. Krishnakumar, N. Assad- Garcia, C. Andrews-Pfannkoch, E. A. Denisova, L. Young, Z. Q. Qi, T. H. Segall-Shapiro, C. H. Calvey, P. P. Parmar, C. A. Hutchison, H. O. Smith, and J. C. Venter (2010) Creation of a bacterial cell controlled by a chemically synthesized genome. Science 329: 52-56. 미소장
10 Gil, R., F. J. Silva, J. Pereto, and A. Moya (2004) Determination of the core of a minimal bacterial gene set. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 68: 518-537. 미소장
11 Glass, J. I., N. Assad-Garcia, N. Alperovich, S. Yooseph, M. R. Lewis, M. Maruf, C. A. Hutchison, H. O. Smith, and J. C. Venter (2006) Essential genes of a minimal bacterium. Proc. Natl. Acad. Sci. 103: 425-430. 미소장
12 Biotechnology Journal 3/2008 네이버 미소장
13 Herndl, G. J., T. Reinthaler, E. Teira, H. van Aken, C. Veth, A. Pernthaler, and J. Pernthaler (2005) Contribution of Archaea to total prokaryotic production in the deep Atlantic Ocean. Appl. Environ. Microbiol. 71: 2303-2309. 미소장
14 Humbard, M. A., H. V. Miranda, J. M. Lim, D. J. Krause, J. R. Pritz, G. Y. Zhou, S. X. Chen, L. Wells, and J. A. Maupin-Furlow (2010) Ubiquitin-like small archaeal modifier proteins (SAMPs) in Haloferax volcanii. Nature 463: 54-60. 미소장
15 Khomyakova, M., O. Bukmez, L. K. Thomas, T. J. Erb, and I. A. Berg (2011) A methylaspartate cycle in haloarchaea. Science 331: 334-337. 미소장
16 Konneke, M., A. E. Bernhard, J. R. de la Torre, C. B. Walker, J. B. Waterbury, and D. A. Stahl (2005) Isolation of an autotrophic ammonia-oxidizing marine archaeon. Nature 437: 543-546. 미소장
17 McDaniel, L. D., E. Young, J. Delaney, F. Ruhnau, K. B. Ritchie, and J. H. Paul (2010) High frequency of horizontal gene transfer in the oceans. Science 330: 50. 미소장
18 Mincer, T. J., M. J. Church, L. T. Taylor, C. Preston, D. M. Kar, and E. F. DeLong (2007) Quantitative distribution of presumptive archaeal and bacterial nitrifiers in Monterey Bay and the North Pacific Subtropical Gyre. Environ. Microbiol. 9: 1162-1175. 미소장
19 Archaea in artificial environments: Their presence in global spacecraft clean rooms and impact on planetary protection 네이버 미소장
20 Mushegian, A. R. and E. V. Koonin (1996) A minimal gene set for cellular life derived by comparison of complete bacterial genomes. Proc. Natl. Acad. Sci. 93: 10268-10273. 미소장
21 Nather, D. J. and R. Rachel (2004) The outer membrane of the hyperthermophilic archaeon ignicoccus: dynamics, ultrastructure and composition. Biochem. Soc. Trans. 32: 199-203. 미소장
22 Orengo, C. A. and J. M. Thornton (2005) Protein families and their evolution - A structural perspective. Ann. Rev. Biochem. 74: 867-900. 미소장
23 Park, B. J., S. J. Park, D. N. Yoon, S. Schouten, J. S. S. Damste, and S. K. Rhee (2010) Cultivation of autotrophic ammoniaoxidizing archaea from marine sediments in coculture with sulfur-oxidizing bacteria. Appl. Environ. Microbiol. 76: 7575-7587. 미소장
24 Schleper, C., I. Holz, D. Janekovic, J. Murphy, and W. Zillig (1995) A multicopy plasmid of the extremely thermophilic archaeon Sulfolobus effects its transfer to recipients by mating. J. Bacteriol. 177: 4417-4426. 미소장
25 Spang, A., R. Hatzenpichler, C. Brochier-Armanet, T. Rattei, P. Tischler, E. Spieck, W. Streit, D. A. Stahl, M. Wagner, and C. Schleper (2010) Distinct gene set in two different lineages of ammonia-oxidizing archaea supports the phylum Thaumarchaeota. Trends Microbiol. 18: 331-340. 미소장
26 FEMS Microbiology journals ‐ new feature: Articles in Press 네이버 미소장
27 Venter, J. C., K. Remington, J. F. Heidelberg, A. L. Halpern, D. Rusch, J. A. Eisen, D. Y. Wu, I. Paulsen, K. E. Nelson, W. Nelson, D. E. Fouts, S. Levy, A. H. Knap, M. W. Lomas, K. Nealson, O. White, J. Peterson, J. Hoffman, R. Parsons, H. Baden-Tillson, C. Pfannkoch, Y. H. Rogers, and H. O. Smith (2004) Environmental genome shotgun sequencing of the Sargasso Sea. Science 304: 66-74. 미소장
28 Walker, C. B., J. R. de la Torre, M. G. Klotz, H. Urakawa, N. Pinel, D. J. Arp, C. Brochier-Armanet, P. S. G. Chain, P. P. Chan, A. Gollabgir, J. Hemp, M. Hugler, E. A. Karr, M. Konneke, M. Shin, T. J. Lawton, T. Lowe, W. Martens-Habbena, L. A. Sayavedra-Soto, D. Lang, S. M. Sievert, A. C. Rosenzweig, G. Manning, and D. A. Stahl (2010) Nitrosopumilus maritimus genome reveals unique mechanisms for nitrification and autotrophy in globally distributed marine crenarchaea. Proc. Natl. Acad. Sci. 107: 8818-8823. 미소장
29 Woese, C. R. and G. E. Fox (1977) Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms. Proc. Natl. Acad. Sci. 74: 5088-5090. 미소장
30 Wuchter, C., B. Abbas, M. J. L. Coolen, L. Herfort, J. van Bleijswijk, P. Timmers, M. Strous, E. Teira, G. J. Herndl, J. J. Middelburg, S. Schouten, and J. S. S. Damste (2006) Archaeal nitrification in the ocean. Proc. Natl. Acad. Sci. 103: 12317-12322. 미소장

추천서가 (다양한 추천 자료를 만나보세요)

권호기사보기

권호기사 목록 테이블로 기사명, 저자명, 페이지, 원문, 기사목차 순으로 되어있습니다.
기사명 저자명 페이지 원문 기사목차

권호

기사명 원문보기 기사목차
닫기