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In direct-seeding cultivation of rice, the emergence and establishment of seedlings are important for determining the actual yield. These traits depend principally upon elongation of both the mesocotyl and coleoptile. Mesocotyl elongation in rice is controlled by several genetic factors and is also affected by environmental factors. In this study, we mapped QTL for mesocotyl elongation using F8 lines from a cross between the cultivated rice, Ilpumbyeo and a weedy rice, PBR. One of the Korean weedy rice, PBR showed the long mesocotyl length than that of cultivars, Ilpumebyeo under soil and agar media conditions. This weedy rice showed long mesocotyl than the elite japonica cultivars. After a phenotyping of 150 F7 lines for mesocotyl length, a subset of 20 lines selected from the two extreme phenotypic tails was used for the bulked segregant analysis. Two QTL were identified on chromosomes 1 and 3. These two QTL were confirmed using 120 F8 lines. Two QTL, qMel-1 and qMel-3 on chromosomes 1 and 3 accounted for 37.3% and 6.5% of the phenotypic variance, respectively. The PBR alleles were associated with an increase in mesocotyl elongation at both loci. It is noteworthy that two QTL for mesocotyl elongation were colocalized with the QTL for mesocotyl length reported in the previous QTL reports. These QTLs can be introgressed into cultivar background using marker assisted backcrossing in an effort to enhance the level of mesocotyl elongation.

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기사명 저자명 페이지 원문 목차
Optimization of agrobacterium-mediated transformation in Japonica-type rice Oryza sativa L. cv. Dongjin for high efficiency Se-Youn Han, Dongjin Shin, Seok-Jun Moon, Seon-A Jeon, Myung-Ok Byun, Beom-Gi Kim pp.221-228

Comparative analysis among four citrus species by DNA microarray Jeong Won Park, Seong Beom Jin, Kyung Hwan Boo, Sung Jin Chung, Su Hyun Yun, Md. Adnan Al Bachchu, Jeong Hun Yun, Song I Han, Key Zung Riu, Jae Hoon Kim pp.229-237

Identification of molecular markers for mesocotyl elongation in weedy rice Hyun-Sook Lee, Ju-Won Kang, Nam-Jin Chung, Kwan-Sam Choi, Sang-Nag Ahn pp.238-244

SDS-PAGE 및 PCR을 활용한 국산 밀 품종의 글루텐닌 조성 분석 신상현, 강천식, 김경훈, 박철수 pp.245-257

STS-CAPS 마커 개발을 통한 110개 한국 콩 품종 판별 황태영, 서민정, 이석기, 박향미, 정광호, 이유영, 김선림, 윤홍태, 이재은, 김대욱 [외] pp.258-272

벼의 밀양23호/기호벼 재조합자식 유전집단을 이용한 PCR 기반 DNA 마커들로 구성된 분자유전자지도 작성 지현소, 김학범, 이강섭, 윤웅한, 김태호, 설영주, 윤도원, 고희종, 은무영 pp.273-281

벼 줄무늬잎마름병 신규 저항성 유전자원 탐색을 위한 유전적 다양성 분석 권택민, 이종희, 이샛별, 박수권, 김상열, 황운하, 신동진, 조준현, 송유천, 남민희 [외] pp.282-289

등숙기에 따른 검정찰옥수수 자식계통 및 교잡계의 안토시아닌 함량 및 항산화 활성 이진석, 손범영, 김정태, 구자환, 한옥규, 백성범, 문중경, 황종진, 권영업 pp.290-300

SSR 분자마커를 이용한 색소옥수수 계통들에 대한 계통유연관계 및 집단구조 분석 김병완, 사규진, 최승훈, 박기진, 박종열, 이주경 pp.301-311

벼에서 Agrobacterium vector를 이용한 세포사멸 억제 유전자 도입 최정숙, 이현숙, 김경민 pp.312-317

사시나무의 클론 생장에 관여하는 주요 대사물질의 구명 이위영, 한상억 pp.318-327

찰옥수수와 단옥수수간 교잡으로부터 유래된 F_2:3_ 집단에서 수량 및 식미관련 형질의 유전분석 박기진, 이주경, 사규진, 고희종 pp.328-337

채엽 효율 및 수량성이 높은 엽용 들깨 신품종 '동글1호' 이명희, 정찬식, 배석복, 오기원, 이유영, 오세관, 박금룡, 안영섭, 박충범 pp.338-341

연황색의 다수성 절화용 스프레이 장미 '레몬티' 육성 김원희, 김성태, 이은경, 박필만, 허건양, 유봉식 pp.342-345

벼 중만생 자포니카 내병 초다수성 '보람찬' 하기용, 고재권, 남정권, 고종철, 김기영, 강현중, 신문식, 백만기, 김보경, 김우재 [외] pp.346-350

벼 중생 고품질 내도복 복합내병성 중간모본 '중모1009호' 김정일, 박노봉, 이지윤, 박동수, 여운상, 장재기, 강정훈, 오병근, 권오덕, 곽도연 [외] pp.351-357

보라색 홑꽃형 분화용 국화 '마이송' 육성 정윤경, 임병애, 이영순, 김성기, 유예영 pp.358-368

중생 차조 '경관1호' 이재생, 오병근, 송석보, 고지연, 우관식, 남민희, 박성태, 김정인, 서명철, 곽도연 [외] pp.369-372

중만생 고품질 벼멸구 저항성 벼 품종 '친농' 신문식, 고재권, 고종철, 김보경, 강현중, 김영두, 남정권, 하기용, 김기영, 백만기 [외] pp.373-378

조생 단간 내도열병 반투명 중간찰 벼 '월백' 원용재, 신영섭, 안억근, 김명기, 김연규, 황흥구, 윤영환, 전용희, 윤광섭, 윤미라 [외] pp.379-383

도복 및 역병에 강한 다수성 검정깨 신품종 '강흑' 심강보, 김동휘, 박장환, 이성우, 김금숙, 노재환 pp.384-387

벼 중만생 고품질 내도복 신품종 '미품' 신운철, 모영준, 김기영, 신문식, 고재권, 김보경, 남정권, 하기용, 백만기, 고종철, 박현수, 강현중, 김우재 pp.363-368

참고문헌 (32건) : 자료제공( 네이버학술정보 )

참고문헌 목록에 대한 테이블로 번호, 참고문헌, 국회도서관 소장유무로 구성되어 있습니다.
번호 참고문헌 국회도서관 소장유무
1 Bewley JD, Black M. 1994. Seeds; Physiology of development and germination, 2nd edition, pp.274-279. Plenum Press, New York and London. 미소장
2 QTL clusters reflect character associations in wild and cultivated rice 네이버 미소장
3 Cao L-Y, Zhu J, Yan Q-C, He L-B, Wei X-H, Cheng S-H. 2002. Mapping QTLs with epistasis for mesocotyl length in a DH population from indica-japonica cross of rice (Oryza sativa). Chinese J. Rice Sci. 16: 221-224. 미소장
4 Saturated molecular map of the rice genome based on an interspecific backcross population. 네이버 미소장
5 Dilday RH, Mgonja MA, Amonsilpa SA, Collins FC, Wells BR. 1990. Plant height vs. mesocotyl and coleoptile elongation in rice: Linkage or pleiotropism? Crop Sci. 30: 815-818. 미소장
6 Gu X-Y, Kianian SF, Hareland GA, Hoffer BL, Foley ME. 2005. Genetic analysis of adaptive syndromes interrelated with seed dormancy in weedy rice (Oryza sativa). Theor. Appl. Genet. 110: 1108-1118. 미소장
7 Hart JW. 1988. Light and plant growth (Topic in plant physiology:1), pp.102-137. Unwin Hyman Ltd. 미소장
8 Huang C, Jiang S-K, Feng L-L, Xu Z-J, Chen W-F. 2010. Analysis of QTLs for mesocotyl length in rice (Oryza sativa L.). Acta Agron. Sin. 36: 1108-1113. 미소장
9 Katsuta-Seki M, Ebna K, Okuno K. 1996. QTL analysis for mesocotyl elongation in rice. Rice genetics newsletter 13: 126. 미소장
10 MAPMAKER: An interactive computer package for constructing primary genetic linkage maps of experimental and natural populations 네이버 미소장
11 Lee HS 2010. A study of survival strategy related traits for seedling emergence in rice. Doctoral Dissertation in Tohoku University, Japan. 미소장
12 Lee HS, Ahn SN, Sasaki K, Chun NJ, Choi KS, Sato T. 2010. Identification of molecular markers for photoblastism in weedy rice. Korean J. Breed. Sci. 42: 144-150. 미소장
13 Lee HS, Sasaki K, Higashitani A, Ahn SN, Sato T. 2012. Mapping and characterization of quantitative trait loci for mesocotyl elongation in rice (Oryza sativa L.) Rice 5: 13. 미소장
14 McCouch SR, Teytelman L, Xu Y, Lobos KB, Clare K, Walton M, Fu B, Maghirang R, Li Z, Xing Y, Zhang Q, Kono I, Yano M, Fjellstrom R, Declerck G, Schneider D, Cartinhour S, Ware D, Stein L. 2002. Development and mapping of 2240 new SSR markers for rice (Oryza sativa L.). DNA research 9: 199-207. 미소장
15 McCouch SR. 2008. Gene nomenclature system for rice. Rice 1: 72-84. 미소장
16 Identification of Markers Linked to Disease-Resistance Genes by Bulked Segregant Analysis: A Rapid Method to Detect Markers in Specific Genomic Regions by Using Segregating Populations 네이버 미소장
17 Positional Cloning of Rice Semidwarfing Gene, sd-1: Rice “Green Revolution Gene” Encodes a Mutant Enzyme Involved in Gibberellin Synthesis 네이버 미소장
18 Effects of the Dwarfing Gene from Dee-geo-woo-gen and Others on Emergence Ability under Deep Seeding Condition in Rice. 네이버 미소장
19 Phytochrome dependent decrease of gibberellin-sensitivity A case study of cell extension growth in the mesocotyl of japonica and indica type rice cultivars 네이버 미소장
20 Mapping QTLs for aluminum tolerance in maize 네이버 미소장
21 Development of microsatellite markers and characterization of simple sequence length polymorphism (SSLP) in rice ( 네이버 미소장
22 Radosevich S, Holt J, Ghersa C. 1997. Weed ecology: Implications for management, 2nd edition, John Wiley and Sons. 미소장
23 Growth, Anatomy and Morphology of the Mesocotyl and the Growth of Appendages of the Wild Oat (Avena fatua L.) Seedling 네이버 미소장
24 Mapping quantitative trait loci for seedling vigor in rice using RFLPs. 네이버 미소장
25 Semidwarf (sd-1), "Green Revolution" Rice, Contains a Defective Gibberellin 20-Oxidase Gene 네이버 미소장
26 Takahashi N. 1978. Adaptive importance of mesocotyl and coleoptile growth in rice under different moisture regimes. Australian J. Plant Phys. 5: 511-517. 미소장
27 Takahashi N. 1984. Seed germination and seedling growth. In: Biology of rice, pp.71-88. Japan Science Society press Elsevier. 미소장
28 Thomson MJ, Tai TH, McClung AM, Lai X-H, Hinga ME, Lobos KB, Xu Y, Martinez CP, McCouch SR. 2003. Mapping quantitative trait loci for yield, yield components and morphological traits in an advanced backcross population between Oryza rufipogon and the Oryza sativa cultivar Jefferson. Theor. Appl. Genet. 107: 479-493. 미소장
29 Coleoptile and Mesocotyl Lengths in Semidwarf Rice Seedlings 1 네이버 미소장
30 Wang S, Basten CJ, Zeng ZB. 2007. Windows QTL Cartographer 2.5. Department of Statistics, North Carolina State University, Raleigh, NC. http://statgen.ncsu.edu/qtlcart/ WQTLCart.htm. 미소장
31 Identification of Casparian Bands in the Mesocotyl and Lower Internodes of Rice (Oryza sativa L.) Seedlings Using Fluorescence Microscopy 네이버 미소장
32 Identification of genetic factors controlling domestication-related traits of rice using an F~2 population of a cross between Oryza sativa and O. rufipogon 네이버 미소장

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