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요약문

목차

Abstract 11

I. 서론 12

II. 본문 13

1. 백수오/이엽우피소 소재 종 판별법 연구 13

가. 서론 13

나. 재료 및 방법 14

다. 연구결과 및 고찰 17

2. 비비추속 원예품종 소재 종 판별법 연구 21

가. 서론 21

나. 재료 및 방법 21

다. 연구결과 및 고찰 25

3. Hyb-Seq 및 Genome-Skimming을 통한 전 세계 쑥속 식물 계통/진화(Phylogenomics) 연구 28

가. 서론 28

나. 재료 및 방법 30

다. 연구결과 및 고찰 39

4. 애엽소재(쑥. 황해쑥, 산쑥)를 포함한 쑥속 약용소재 종 판별 마커 개발 연구 43

가. 서론 43

나. 재료 및 방법 45

다. 연구결과 및 고찰 48

5. 주요생물소재 대용량 유전정보 기반 슈퍼바코드 분석 66

가. 서론 66

나. 재료 및 방법 67

다. 연구결과 및 고찰 69

III. 종합고찰 77

IV. 참고문헌 78

Appendix 87

Appendix 1. 주요약용소재종 엽록체 유전체 분석 결과 87

Appendix 2. 쑥속 약용소재 MassARRAY용 종 판별 프라이머 목록 89

표목차

1. 백수오/이엽우피소 소재 종 판별법 연구 8

표 1. 본 연구에 사용된 큰조롱속 식물 목록 15

표 2. 어셈블된 전사체의 통계적 정보 16

2. 비비추속 원예품종 소재 종 판별법 연구 8

표 1. 본 연구에 사용된 비비추속 식물 목록 22

3. Hyb-Seq 및 Genome-Skimming을 통한 전 세계 쑥속 식물 계통/진화(Phylogenomics) 연구 8

표 1. 본 연구에 이용한 쑥속 및 Outgroup 시료 목록 34

4. 애엽소재(쑥. 황해쑥, 산쑥)를 포함한 쑥속 약용소재 종 판별 마커 개발 연구 8

표 1. MassARRAY를 이용한 종 판별 마커 SNP 패널 1번 well 분석 결과 49

표 2. MassARRAY를 이용한 종 판별 마커 SNP 패널 2번 well 분석 결과 50

표 3. 국내 쑥속 12개 분류군에 대한 29개 최종 선별 SNP 목록 51

표 4. MassARRAY 상 쑥속 종 판별 마커 목록 57

표 5. Artemisia annua 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 58

표 6. Artemisia apiaceae 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 59

표 7. Artemisia gmelini 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 60

표 8. Artemisia capillaris 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 61

표 9. Artemisia rubripes 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 62

표 10. Artemisia feddei 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 63

표 11. Artemisia keiskeana 종 마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 64

표 12. MassARRYA분석용 최종 SNP 선별 목록('19~'20) 65

5. 주요생물소재 대용량 유전정보 기반 슈퍼바코드 분석 8

표 1. 슈퍼바코드 분석 연구를 위한 너도밤나무의 샘플 확보 결과 67

표 2. 너도밤나무의 GBS 분석 raw data 결과 70

표 3. 너도밤나무 mapping 결과 70

표 4. 너도밤나무 SNP 자료 71

표 5. 너도밤나무의 필터 기준에 따른 SNP 유전자좌 71

표 6. 너도밤나무 3개 집단의 유전적 다양성 분석 결과 72

표 7. 너도밤나무 3개 집단의 분화도(Fst, 사선아래)와 지리적 거리 74

그림목차

1. 백수오/이엽우피소 소재 종 판별법 연구 9

그림 1. 국내 유통되는 백수오/이엽우피소 기원종 추정 분류군 14

그림 2. 474 단일카피의 길이 분포 16

그림 3. 각각의 시료에 따른 데이터 생산량의 분포 17

그림 4. 각각의 분류군에 대한 유전자 구간별 염기서열이 결정된 양을 시각화한 heatmap 17

그림 5. 동아시아산 큰조롱속 Hyb-Seq 결과에 근거한 계통수 19

그림 6. 큰조롱속 Hyb-Seq 및 Genome skimming 결과 비교 분석 20

2. 비비추속 원예품종 소재 종 판별법 연구 9

그림 1. 실험에 사용한 DNA들의 quality 확인용 전기영동 사진 23

그림 2. Hyb-Seq에 이용된 single copy gene 자료 24

그림 3. 각각의 시료에 따른 데이터 생산량의 분포 25

그림 4. 각각의 분류군에 대한 유전자 구간별 염기서열이 결정된 양을 시각화한 heatmap 26

그림 5. 동아시아산 비비추속 Hyb-Seq 및 Genome-skimming 결과 비교 분석 27

3. Hyb-Seq 및 Genome-Skimming을 통한 전 세계 쑥속 식물 계통/진화(Phylogenomics) 연구 9

그림 1. 290개의 nuclear single-copy 유전자들을 기반으로 한 전 세계 쑥속 식물의 계통도 40

그림 2. Hyb-Seq 및 Genome-Skimming 분석 결과에 따른 계통수 비교 42

4. 애엽소재(쑥. 황해쑥, 산쑥)를 포함한 쑥속 약용소재 종 판별 마커 개발 연구 9

그림 1. MassARRAY system의 SNP 분석 방법 44

그림 2. MassARRAY system의 mass spectrometry analysis 결과 예시 44

그림 3. Hyb-Seq 및 분석 프로그램 모식도 46

그림 4. Exome-Seq의 variant call 모식도 46

그림 5. MassARRAY의 실험과정 48

그림 6. Hyb-Seq 분석 결과에 근거한 국내 쑥속 전체 SNP 기반 계통도 53

그림 7. 최종 선별된 29개 마커에 기반한 계통수 56

그림 8. Artemicia annua의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 58

그림 9. Artemicia apiaceae의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 59

그림 10. Artemicia gmelini의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 60

그림 11. Artemicia capillaris의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 61

그림 12. Artemicia rubripes의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 62

그림 13. Artemicia feddei의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 63

그림 14. Arternicia keiskeana의 종 판별마커에 대한 MassARRAY 분석 결과 64

5. 주요생물소재 대용량 유전정보 기반 슈퍼바코드 분석 10

그림 1. 너도밤나무 95개체의 SNP 자료를 이용한 PCA 분석 결과 73

그림 2. 너도밤나무 3집단 간 분화도(Fst)와 지리적 거리의 상관관계도 74

그림 3. 너도밤나무 95개체의 SNP 자료를 이용한 NJ 계통수 75

그림 4. Delta-K method를 이용한 너도밤나무 집단의 true K 추론 결과 76

그림 5. K값에 따른 너도밤나무 3개 집단의 유전적 구조 76

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슈퍼바코드를 이용한 생물산업소재 종 판별법 개발 연구(4차년도) = A study on the species identification for bio-industry using super barcode 이용현황 표 - 등록번호, 청구기호, 권별정보, 자료실, 이용여부로 구성 되어있습니다.
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